Un estudio piloto para evaluar la viabilidad y la aceptabilidad de la detección de recién nacidos utilizando la secuenciación del genoma solo basado en paneles en Silico en Francia (PGC1)

La detección de recién nacidos (NBS) basado en la secuenciación del genoma (GS) es actualmente objeto de especial atención tanto a nivel europeo como internacional. En los últimos tres años, varias publicaciones han discutido las oportunidades y desafíos de usar GS para NBS. Hasta la fecha, solo dos programas chinos han publicado sus resultados, el primero de una serie de 29,601 recién nacidos sanos y el segundo en una serie de 10,334 recién nacidos sanos y 668 bebés de alto riesgo. A nivel mundial, más de veinte proyectos piloto están en marcha, aunque hasta ahora se ha iniciado ninguno dentro del contexto francés. En los diferentes proyectos piloto, se utilizan varios diseños de estudio. La mayoría ha optado por un análisis basado en GS dirigido para detectar enfermedades de inicio pediátrico. Algunos proyectos se centran únicamente en enfermedades para las cuales existen medicamentos o intervenciones efectivas para prevenir o reducir los síntomas. Por el contrario, otros ofrecen a los padres la opción de evaluar a sus recién nacidos para enfermedades sin opciones de tratamiento actuales, pero para lo cual un tratamiento está subdesarrollado o con interés en la gestión temprana, una elección ejercida por la mayoría de los padres. De hecho, el diagnóstico temprano de estas enfermedades puede ayudar a introducir tratamientos o intervenciones cuando estén disponibles, para participar en ensayos de investigación sobre nuevos tratamientos y para recibir el manejo temprano y el asesoramiento genético.

En Francia, el Programa Nacional de NBS ha sido reconocido durante mucho tiempo en todo el mundo por su calidad e integridad organizacional, aunque hasta hace poco, tiene uno de los números más bajos de enfermedades proyectadas en Europa. A mediados de 2014, el NBS francés solo incluye 14 enfermedades graves. Recientemente, la ley de bioética francesa ha evolucionado para permitir el uso de pruebas genéticas como un procedimiento de primera línea para NBS. Al mismo tiempo, el desarrollo y la eficiencia de las técnicas genómicas y el rápido aumento en el número de enfermedades raras tratables (RDS) plantean preguntas sobre la aceptabilidad y la relevancia de estos métodos genómicos para los NB y su posible extensión. La extensión de NBS a muchos RDS de inicio temprano representa un verdadero desafío de salud pública como RDS, el 80% de los cuales son de origen genético, representan el 10% de las muertes antes de los 5 años.

La FHU Translad ha elaborado el proyecto perigenomado, un proyecto a gran escala que tiene como objetivo evaluar la relevancia de PGS-NB en Francia (validez analítica y clínica, utilidad clínica y problemas psicosociales, éticos y organizacionales).

El PGS-NB (también conocido como GS basado en panel in silico, es decir, un análisis realizado completamente utilizando herramientas informáticas) consiste en pasos de filtrado bioinformático que devuelven solo variantes seleccionadas y/o variantes raras de genes específicos emitidos de GS. Entonces, incluso si los datos de origen provienen del GS, es posible configurar la tubería para devolver solo aquellas variaciones que se sabe que son responsables de RDS específicos.

El proyecto perigenomado se dirigirá en dos pasos. El primer paso piloto (estudio Perigenomed-Clinics 1-PGC1), presentado en este protocolo, tiene como objetivo evaluar la viabilidad y aceptabilidad de PGS-NBS Francia. Este estudio piloto planea evaluar a 2.500 recién nacidos utilizando PGS-NB dirigidos a dos listas de genes (1 correspondiente a variables de genes responsables de enfermedades raras tratables, 2 que incluye la variación de genes que conduce a enfermedades raras procesables). En ambas listas solo se consideran RDS de inicio temprano. El estudio PGC1 se llevará a cabo en 5 centros de atención médica en Francia, y se espera que los resultados se devuelvan a los médicos en menos de 4 semanas. También proporcionará una comprensión de la información óptima y las rutas analíticas, y las posibles repercusiones organizacionales de PGS-NB, así como una primera idea sobre la validez de los PGS-NB y sobre el curso clínico de los recién nacidos positivos y con un RD dos estudios confirmados en humanidades y ciencias sociales (HSS) también estarán vinculados a estudios PGC1. El primero se centrará en las razones dadas por los declinadores y en las características médicas y socioeconómicas (a nivel individual y contextual) de declive versus participantes. El segundo evaluará el impacto psicosocial de la divulgación de resultados en las familias de recién nacidos positivos, comparativamente de los negativos.

Estos resultados iniciales proporcionarán los primeros resultados antes del lanzamiento de una segunda fase más grande Perigenomed-Clinics 2 (estudio PGC2-22,000 recién nacidos), diseñado para estudiar la implementación de dichos PGS-NB en rutina a nivel regional.