Plasma MTB cfDNA før bronkoskopi

Tuberkulose (TB) forbliver en global sundhedsudfordring, især i Østasien. Ifølge den globale TB-rapport fra Verdenssundhedsorganisationen (WHO) i 2024 blev over 10 millioner mennesker smittet med TB i 2023, med 1,25 millioner dødsfald tilskrevet sygdommen. Indien, Indonesien og Kina bærer den højeste byrde, mens Hong Kong har en mellem incidens med i gennemsnit 3.200 nye tilfælde årligt.

Lungetuberkulose (PTB) er den mest almindelige form for aktiv TB-sygdom. Diagnostik baserer sig typisk på påvisning af Mycobacterium tuberculosis (MTB) i sputum via udstrygsmikroskopi, kultur eller polymerase chain reaction (PCR). Imidlertid har sputumudstryg begrænset følsomhed, kultur kræver 6-8 uger, og sputumproduktion er ofte vanskelig hos visse patienter. PTB kan præsentere sig med heterogene radiologiske træk, som nogle gange efterligner malignitet, hvilket fremkalder bronkoskopi med bronchoalveolær lavage (BAL) hos udstrygsnegative patienter. BAL-væske (BALF) testes derefter via MTB-kultur, PCR og cytologi. Bronkoskopi, selvom informativ, er invasiv og indebærer risici for ældre patienter eller patienter med kardiopulmonale komorbiditeter. Midlertidig afbrydelse af orale antikoagulantia, som nu er bredt ordinerede, kan føre til kardoemboliske komplikationer, der bidrager til op til 2,6% af slagtilfælde. Forsinkelser i planlægning af bronkoskopi og afventning af BALF MTB-kulturresultater hæmmer yderligere rettidig diagnostik. Blodets inflammatoriske markører er ikke-specifikke. Disse begrænsninger understreger behovet for en ikke-invasiv, hurtig og præcis diagnostisk værktøj for PTB.

Fremskridt i sekventeringsteknologi tilbyder nye diagnostiske muligheder. Når bakterier dør, kommer deres DNA-fragmenter i blodbanen som cell-free (cfDNA). Påvisning af mikrobielt cfDNA i plasma, kombineret med bioinformatik, giver en minimalt invasiv metode til direkte at identificere patogener, som overgår blodkultur eller surrogate markører. Plasma MTB cfDNA er et nyt diagnostisk værktøj. IntelliGenome CRISPR-TB blodprøven kan påvise MTB cfDNA, og dens landmark-studie fokuserede på pædiatriske og hiv-positive populationer. Imidlertid forbliver dens kliniske anvendelse begrænset, uden validering i mellem-byrde regioner som Hong Kong, hvor hiv-prævalens er lav.

Forskeren har udviklet en ny målrettet MTB cfDNA sekventeringsanalyse. Analysen bruger whole-genome-baseret sekventering til at berige MTB cfDNA, efterfulgt af bioinformatisk filtrering for at fjerne humant DNA, skelne MTB fra ikke-tuberkuløse mykobakterier (NTM), og udelukke mikrobielle forureningsstoffer. Et prospektivt studie ville være nødvendigt for at bekræfte diagnostisk nøjagtighed og klinisk anvendelighed af denne nye sekventeringsanalyse. Forskerne formoder, at plasma målrettet MTB cfDNA sekventering ikke er underlegen til BALF MTB-kultur og PCR i diagnostiske udstrygsnegative patienter, der gennemgår bronkoskopi.