ADNc mycobactérien plasmatique avant bronchoscopie

La tuberculose (TB) reste un défi mondial de santé publique, particulièrement en Asie de l'Est. Selon le Rapport mondial sur la tuberculose de l'Organisation mondiale de la Santé (OMS) en 2024, plus de 10 millions de personnes ont contracté la TB en 2023, avec 1,25 million de décès attribués à la maladie. L'Inde, l'Indonésie et la Chine supportent la charge la plus élevée, tandis que Hong Kong maintient une incidence intermédiaire, avec en moyenne 3 200 nouveaux cas annuels.

La tuberculose pulmonaire (TBP) est la forme la plus courante de tuberculose active. Le diagnostic repose généralement sur la détection de Mycobacterium tuberculosis (MTB) dans les crachats par microscopie à frottis, culture ou réaction en chaîne par polymérase (PCR). Cependant, le frottis de crachats a une sensibilité limitée, la culture nécessite 6 à 8 semaines, et la production de crachats est souvent difficile chez certains patients. La TBP peut présenter des caractéristiques radiologiques hétérogènes, imitant parfois une tumeur maligne, ce qui justifie une bronchoscopie avec lavage broncho-alvéolaire (LBA) chez les patients à frottis négatif. Le liquide de LBA est ensuite testé par culture MTB, PCR et cytologie. La bronchoscopie, bien qu'informative, est invasive et présente des risques pour les patients âgés ou avec des comorbidités cardiopulmonaires. L'interruption temporaire des anticoagulants oraux, maintenant largement prescrits, peut entraîner des complications cardio-emboliques, contribuant jusqu'à 2,6 % des accidents vasculaires cérébraux. Les retards dans la programmation des bronchoscopies et l'attente des résultats de culture MTB sur LBA entravent davantage le diagnostic rapide. Les marqueurs inflammatoires sanguins sont non spécifiques. Ces limitations soulignent la nécessité d'un outil de diagnostic non invasif, rapide et précis pour la TBP.

Les progrès des technologies de séquençage offrent de nouvelles possibilités diagnostiques. Lorsque les bactéries meurent, leur ADN fragmenté pénètre dans la circulation sanguine sous forme d'ADN libre (ADNlc). La détection de l'ADNlc microbien dans le plasma, combinée à la bioinformatique, fournit une méthode mini-invasive pour identifier directement les pathogènes, surpassant l'hémoculture ou les marqueurs substituts. L'ADNlc de MTB plasmatique est un outil diagnostique émergent. Le test sanguin IntelliGenome CRISPR-TB peut détecter l'ADNlc de MTB et son étude phare s'est concentrée sur les populations pédiatriques et VIH-positives. Cependant, son application clinique reste limitée, sans validation dans les régions à charge intermédiaire comme Hong Kong, où la prévalence du VIH est faible.

L'investigateur a développé un nouveau test de séquençage ciblé de l'ADNlc de MTB. Le test utilise un séquençage basé sur le génome entier pour enrichir l'ADNlc de MTB, suivi d'un filtrage bioinformatique pour éliminer l'ADN humain, distinguer MTB des mycobactéries non tuberculeuses (MNT), et exclure les contaminants microbiens. Une étude prospective serait nécessaire pour confirmer la précision diagnostique et l'utilité clinique de ce nouveau test de séquençage. Les investigateurs émettent l'hypothèse que le séquençage ciblé de l'ADNlc de MTB plasmatique n'est pas inférieur à la culture MTB sur LBA et la PCR chez les patients diagnostiqués par frottis négatif subissant une bronchoscopie.