Plazmatická MTB cfDNA před bronchoskopií

Tuberkulóza (TB) zůstává celosvětovou zdravotní výzvou, zejména ve východní Asii. Podle Globální zprávy o tuberkulóze Světové zdravotnické organizace (WHO) z roku 2024 onemocnělo v roce 2023 tuberkulózou přes 10 milionů lidí, přičemž 1,25 milionu úmrtí bylo připisováno této nemoci. Největší zátěž nesou Indie, Indonésie a Čína, zatímco Hongkong udržuje střední výskyt s průměrem 3 200 nových případů ročně.

Plicní tuberkulóza (PTB) je nejčastější formou aktivního TB onemocnění. Diagnóza obvykle spočívá v detekci Mycobacterium tuberculosis (MTB) ve sputu pomocí mikroskopie nátěru, kultivace nebo polymerázové řetězové reakce (PCR). Avšak mikroskopie sputa má omezenou senzitivitu, kultivace vyžaduje 6-8 týdnů a produkce sputa je u některých pacientů často obtížná. PTB se může projevovat heterogenními radiologickými znaky, někdy napodobujícími malignitu, což vede k bronchoskopii s bronchoalveolární laváží (BAL) u pacientů s negativním nálezem v nátěru. BAL tekutina (BALF) je následně testována pomocí MTB kultivace, PCR a cytologie. Bronchoskopie, ač informativní, je invazivní a představuje rizika pro starší pacienty nebo pacienty s kardiopulmonálními přidruženými onemocněními. Dočasné přerušení perorálních antikoagulancií, nyní široce předepisovaných, může vést ke kardioembolickým komplikacím, které přispívají až k 2,6 % cévních mozkových příhod. Zpoždění v naplánování bronchoskopie a čekání na výsledky BALF MTB kultivace dále brání včasné diagnóze. Krevní zánětlivé markery jsou nespecifické. Tato omezení zdůrazňují potřebu neinvazivního, rychlého a přesného diagnostického nástroje pro PTB.

Pokroky v sekvenačních technologiích nabízejí nové diagnostické možnosti. Když bakterie odumírají, jejich fragmenty DNA vstupují do krevního řečiště jako bezbuněčná DNA (cfDNA). Detekce mikrobiální cfDNA v plazmě v kombinaci s bioinformatikou poskytuje minimálně invazivní metodu k přímé identifikaci patogenů, překonávající krevní kultivaci nebo náhradní markery. Plazmatická MTB cfDNA je nově se objevujícím diagnostickým nástrojem. Test IntelliGenome CRISPR-TB Blood Test dokáže detekovat MTB cfDNA a jeho klíčová studie se zaměřila na pediatrickou a HIV-pozitivní populaci. Avšak jeho klinické využití zůstává omezené, bez ověření v oblastech se střední zátěží jako je Hongkong, kde je prevalence HIV nízká.

Výzkumník vyvinul novou cílenou MTB cfDNA sekvenační metodu. Tato metoda využívá sekvenování založené na celém genomu k obohacení MTB cfDNA, následované bioinformatickou filtrací k odstranění lidské DNA, rozlišení MTB od netuberkulózních mykobakterií (NTM) a vyloučení mikrobiálních kontaminantů. Pro potvrzení diagnostické přesnosti a klinické užitečnosti této nové sekvenační metody by byla vyžadována prospektivní studie. Výzkumníci hypotetizují, že cílené sekvenování MTB cfDNA z plazmy není horší než BALF MTB kultivace a PCR u diagnostikovaných pacientů s negativním nálezem v nátěru podstupujících bronchoskopii.