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Epigenetics, DNA Methylation Patterns and Periodontal Disease (SZU)

20. Juli 2011 aktualisiert von: University of North Carolina, Chapel Hill

Host DNA Methylation Patterns in Association With Periodontal Disease : MiRNA Changes in Obesity

The overall goal of this research is (1) to identify changes in gene expression and DNA methylation status in subjects who exhibit advanced chronic periodontal inflammation and (2) to identify microRNAs (miRNAs) and the interactive pathways associated with obesity as a modifier of periodontal infection pathogenesis.

Studienübersicht

Status

Status

Zeigt den aktuellen Rekrutierungsstatus oder den erweiterten Zugriffsstatus an.
Abgeschlossen

Bedingungen

Bedingungen

Die Krankheit, Störung, das Syndrom, die Krankheit oder die Verletzung, die untersucht wird. Auf ClinicalTrials.gov können die Bedingungen auch andere gesundheitsbezogene Themen wie Lebensdauer, Lebensqualität und Gesundheitsrisiken umfassen.

Detaillierte Beschreibung

Aim 1. To determine whether diseased periodontal tissues biopsied from patients with periodontal disease will have altered DNA methylation patterns of selected genes as compared to the DNA methylation status biopsies obtained from adjacent, non-diseased periodontal sites, as well as periodontal biopsy samples obtained from non-diseased, healthy subjects.

Aim 2. To determine the role of tissue DNA Methylation on mRNA expression:

  • 2a. To determine whether alterations in tissue mRNA expression (as determined by quantitative PCR) are associated with an aberrant DNA methylation status of respective gene promoter CpG islands in tissue biopsy samples obtained from diseased and non-diseased tissues from patients with periodontal disease and from non-diseased healthy subjects.
  • 2b. By performing laser capture microdissection of biopsy samples from diseased patients [(epithelium, connective tissue and inflammatory infiltrate)] we seek to determine cellular patterns of mRNA expression and DNA methylation of targeted genes comparing inflamed to non-inflamed sites within diseased patients.
  • 2c. We will perform in vitro studies to analyze whether gingival fibroblasts from patients with periodontal disease will show a differential methylation pattern and whether these cells will display a differential inflammatory response when compared to control fibroblasts isolated from healthy subjects.

Aim 3. The aim of this pilot investigation was to determine if miRNA expression differed in the presence or absence of obesity, comparing gingival biopsies obtained from patients with or without periodontal disease.

  • 3a. To determine whether diseased periodontal tissues biopsied from patients with periodontal disease will influence the level of miRNA expression as compared to the biopsies obtained from non-diseased, healthy subjects.
  • 3b. To determine whether BMI [nonobese subjects BMI <30kg/m2, obese subjects >30kg/m2] will influence the level of miRNA expression in biopsies from diseased periodontal tissues as compared to periodontal biopsy samples obtained from non-diseased, healthy subjects.

Gingival samples, gingival crevicular fluid, saliva and plaque samples will be collected and a periodontal examination will be performed. The periodontal assessment will record pocket depth, clinical attachment level and percent bleeding on probing. Blood pressure, height and weight (Body Mass Index assessment) will be obtained on participants as well.

Tissue gene expression by quantitative PCR and DNA methylation sequence analysis, proteomic analyses of gingival crevicular fluid, Differential Methylation Hybridization and, microRNA expression profile by Human miRNA Microarray and Real-time PCR quantification will all be performed.

Studientyp

Studientyp

Beschreibt die Art einer klinischen Studie. Zu den Studientypen gehören Interventionsstudien (auch klinische Studien genannt), Beobachtungsstudien (einschließlich Patientenregister) und erweiterter Zugang.
Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

Einschreibung

Die Anzahl der Teilnehmer an einer klinischen Studie. Die „erwartete“ Einschreibung ist die Zielzahl an Teilnehmern, die die Forscher für die Studie benötigen.
98

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Vereinigte Staaten
    • North Carolina
      • Chapel Hill, North Carolina, Vereinigte Staaten, 27599
        • Center for Oral and Systemic Diseases

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Zulassungskriterien

Die wichtigsten Voraussetzungen, die Personen erfüllen müssen, die an einer klinischen Studie teilnehmen möchten, bzw. welche Eigenschaften sie mitbringen müssen. Auswahlkriterien bestehen sowohl aus Einschlusskriterien (die erforderlich sind, damit eine Person an der Studie teilnehmen kann) als auch aus Ausschlusskriterien (die eine Person an der Teilnahme hindern). Arten von Zulassungskriterien umfassen, ob eine Studie gesunde Freiwillige akzeptiert, Alters- oder Altersgruppenanforderungen hat oder durch das Geschlecht begrenzt ist.

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre bis 65 Jahre (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Ja

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Wahrscheinlichkeitsstichprobe

Studienpopulation

Ninety-eight subjects will be recruited from the Graduate Periodontics Clinic and Dental Faculty Practice at the University of North Carolina School of Dentistry and if needed from the general population. Subjects must present with either chronic periodontitis or periodontal health.

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  • Subjects must be adult males or females between the ages of 18 and 65 years (inclusive).
  • Subjects must be able and willing to follow study procedures and instructions.
  • Subjects must have read, understood and signed an informed consent form.
  • Subjects must present with at least 20 teeth in the functional dentition, excluding third molars.
  • Subjects must be in good general health.
  • Subjects must present with advanced chronic periodontitis (American Dental Association Class 4) as determined by the investigator or designee during the screening periodontal examination. Such subjects will exhibit periodontal pocketing (>5 mm and Bleeding on Probing) and severe alveolar bone loss. Subjects will be under active care for periodontitis and will be treatment planned for periodontal flap surgery.
  • Control subjects must present with periodontal health as determined by the investigator or designee during the screening periodontal examination. Such subjects will exhibit no evidence of periodontal pocketing (pockets ≤4mm), and no bleeding on probing at the site of the biopsy. Patients from this group will be treatment planned for routine crown extension procedures for restorative reasons, or be volunteers from the general population meeting the inclusion criteria.
  • 24 subjects from group 2 will be enrolled based on Body Mass Index (BMI). Twelve obese subjects (BMI of 30 or greater) and twelve non-obese subjects (BMI less than 30) will be enrolled. Twelve from the obese and twelve from the non-obese group will be split in half based on periodontal status.
  • 6 periodontal healthy non-obese
  • 6 periodontal healthy obese
  • 6 periodontal diseased non-obese
  • 6 periodontal diseased obese

Exclusion Criteria:

  • Individuals who have a chronic disease with oral manifestations.
  • Individuals who exhibit gross oral pathology.
  • Treatment with antibiotics for any medical or dental condition within 1 month prior to the screening examination.
  • Chronic treatment (i.e., two weeks or more) with any medication known to affect periodontal status (e.g., phenytoin, calcium antagonists, cyclosporin, coumadin, non-steroidal anti-inflammatory drugs, aspirin) within one month of the screening examination.
  • Ongoing medications initiated less than three months prior to enrollment (i.e., medications for chronic medical conditions must be initiated at least three months prior to enrollment).
  • Subjects with clinically significant organ disease including impaired renal function, or any bleeding disorder.
  • Subjects with active infectious diseases such as hepatitis, HIV or tuberculosis.
  • Severe unrestored caries, or any condition that is likely to require antibiotic treatment over the trial, including the need for prophylactic antibiotic

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte

Gruppe / Kohorte

Eine Gruppe oder Untergruppe von Teilnehmern an einer Beobachtungsstudie, die hinsichtlich biomedizinischer oder gesundheitlicher Ergebnisse bewertet wird.
MicroRNA study
Obese group (+ periodontitis group) Non-obese group (+ periodontitis group)
DNA methylation study
Periodontitis group Healthy periodontium group

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Primäre Ergebnismessungen

Im Protokoll einer klinischen Studie die geplante Ergebnismessung, die für die Bewertung der Wirkung einer Intervention/Behandlung am wichtigsten ist. Die meisten klinischen Studien haben einen primären Endpunkt, aber einige haben mehr als einen.
Ergebnis Maßnahme
Zeitfenster
DNA methylation patterns of selected candidate genes
Zeitfenster: Visit 1
Visit 1

Sekundäre Ergebnismessungen

Sekundäre Ergebnismessungen

Im Protokoll einer klinischen Studie ein geplantes Ergebnismaß, das nicht so wichtig ist wie das primäre Ergebnismaß für die Bewertung der Wirkung einer Intervention, aber dennoch von Interesse ist. Die meisten klinischen Studien haben mehr als einen sekundären Endpunkt.
Ergebnis Maßnahme
Zeitfenster
Identification of miRNA species
Zeitfenster: Visit 1
Visit 1

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Sponsor

Die Organisation oder Person, die die Studie initiiert und die Autorität und Kontrolle über die Studie hat.
University of North Carolina, Chapel Hill

Mitarbeiter

Mitarbeiter

Eine andere Organisation als der Sponsor, die eine klinische Studie unterstützt. Diese Unterstützung kann Aktivitäten im Zusammenhang mit Finanzierung, Design, Implementierung, Datenanalyse oder Berichterstattung umfassen.
National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIDCR)

Ermittler

Ermittler

Ein Forscher, der an einer klinischen Studie beteiligt ist. Zu den verwandten Begriffen gehören Studienleiter, Unterprüfer am Standort, Studienleiter, Studienleiter und Studienleiter.
  • Hauptermittler: Steven Offenbacher, DDS, MS, PhD, University of North Carolina, Chapel Hill

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn

Studienbeginn

Das tatsächliche Datum, an dem der erste Teilnehmer in eine klinische Studie aufgenommen wurde. Das „voraussichtliche“ Studienstartdatum ist das Datum, von dem die Forscher glauben, dass es das Studienstartdatum sein wird.
1. Oktober 2007

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

Primärer Abschluss

Das Datum, an dem der letzte Teilnehmer einer klinischen Studie untersucht wurde oder eine Intervention erhalten hat, um endgültige Daten für das primäre Ergebnis zu sammeln. Ob die klinische Studie protokollgemäß endete oder beendet wurde, hat keinen Einfluss auf dieses Datum. Bei klinischen Studien mit mehr als einem primären Ergebnismaß mit unterschiedlichen Abschlussdaten bezieht sich dieser Begriff auf das Datum, an dem die Datenerhebung für alle primären Ergebnismaße abgeschlossen ist. Das „erwartete“ primäre Abschlussdatum ist das Datum, von dem die Forscher glauben, dass es das primäre Abschlussdatum für die Studie sein wird.
1. Februar 2011

Studienabschluss (Tatsächlich)

Studienabschluss

Das Datum, an dem der letzte Teilnehmer an einer klinischen Studie untersucht wurde oder eine Intervention/Behandlung erhielt, um endgültige Daten für die primären Ergebnismaße, sekundären Ergebnismaße und Nebenwirkungen zu sammeln (d. h. der letzte Besuch des letzten Teilnehmers). Das „voraussichtliche“ Abschlussdatum der Studie ist das Datum, von dem die Forscher glauben, dass es das Abschlussdatum der Studie sein wird.
1. Februar 2011

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

Zuerst eingereicht

Das Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer zum ersten Mal einen Studienbericht bei ClinicalTrials.gov eingereicht hat. Zwischen dem Datum der ersten Einreichung und der Verfügbarkeit des Datensatzes auf ClinicalTrials.gov (dem ersten veröffentlichten Datum) liegt in der Regel eine Verzögerung von einigen Tagen.
12. Juli 2011

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

Das Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer zum ersten Mal einen Studienbericht einreicht, der den Qualitätskontrollkriterien (QC) der National Library of Medicine (NLM) entspricht. Der Sponsor oder Prüfer muss möglicherweise einen Studienbericht ein- oder mehrmals überarbeiten und einreichen, bevor die QC-Überprüfungskriterien von NLM erfüllt sind. Es liegt in der Verantwortung des Sponsors oder Prüfers, sicherzustellen, dass die Studienaufzeichnung mit den NLM-QC-Überprüfungskriterien übereinstimmt.
20. Juli 2011

Zuerst gepostet (Schätzen)

Zuerst gepostet

Das Datum, an dem der Studienbericht zum ersten Mal auf ClinicalTrials.gov verfügbar war, nachdem die Qualitätskontrolle (QC) der National Library of Medicine (NLM) abgeschlossen wurde. Zwischen dem Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer den Studienbericht eingereicht hat, und dem ersten veröffentlichten Datum liegt in der Regel eine Verzögerung von einigen Tagen.
21. Juli 2011

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Schätzen)

Letztes Update gepostet

Das letzte Datum, an dem Änderungen an einem Studienbericht auf ClinicalTrials.gov verfügbar gemacht wurden. Es kann eine Verzögerung zwischen der Übermittlung der Änderungen an ClinicalTrials.gov durch den Sponsor oder Prüfer der Studie (Datum der letzten eingereichten Aktualisierung) und dem Datum der letzten Veröffentlichung der Aktualisierung geben.
21. Juli 2011

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

Das letzte Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer Änderungen an einem Studienbericht eingereicht hat, die mit den Qualitätskontrollkriterien (QC) der National Library of Medicine (NLM) übereinstimmen. Es liegt in der Verantwortung des Sponsors oder Prüfers, sicherzustellen, dass die Studienaufzeichnung mit den NLM-QC-Überprüfungskriterien übereinstimmt.
20. Juli 2011

Zuletzt verifiziert

Zuletzt verifiziert

Das letzte Datum, an dem der Studiensponsor oder Prüfer die Informationen über eine klinische Studie auf ClinicalTrials.gov als richtig und aktuell bestätigt hat. Wenn eine Studie den Rekrutierungsstatus Recruiting hat; noch keine Rekrutierung; oder aktiv, keine Rekrutierung wurde innerhalb der letzten 2 Jahre nicht bestätigt, der Rekrutierungsstatus der Studie wird als unbekannt angezeigt.
1. Juli 2011

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

Andere Studien-ID-Nummern

Andere Identifikatoren oder ID-Nummern als die NCT-Nummer, die einer klinischen Studie vom Sponsor der Studie, Geldgebern oder anderen zugewiesen werden. Diese Nummern können eindeutige Kennungen von anderen Studienregistern und Zuschussnummern der National Institutes of Health enthalten.
  • 07-0749
  • 1R01DE021052-01 (US NIH Stipendium/Vertrag)

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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