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Einführung der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) in Mikrobiologie und Parasitologie

5. Dezember 2025 aktualisiert von: Stefania Paolucci, Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo di Pavia

Ziel ist die Entwicklung molekularer Systeme, um mikroskopische Charakterisierungen und In-vitro-Tests durch molekularbiologische Systeme zu unterstützen oder zu ersetzen, die die Leistung in parasitologischen Tests verbessern können. Insbesondere werden wir die wichtigsten Krankheitserreger analysieren: mehrere Leishmania-Arten (altweltliche und neuweltliche Leishmania-Arten), die fünf für den Menschen relevanten Plasmodium-Arten (falciparum, ovale, vivax, malariae und knowlesi) und Pneumocystis jirovecii, unter Verwendung molekularer Methoden, die auf die für ihre Diagnose erforderliche Geschwindigkeit, Spezifität und Sensitivität basieren. Darüber hinaus möchten wir spezifische Elemente für die Typisierung der Arten bereitstellen. Unser Ziel ist es, diagnostische Methoden und Artklassifikationsmethoden durch den Einsatz von PCR in Mikrobiologie und Parasitologie zu verbessern, um deren Auswirkungen auf die Diagnose zu bewerten. Wir würden die Auswirkungen dieser Methode hinsichtlich Zeitaufwand, Sensitivität und Spezifität der Diagnose bewerten. Wir würden auch zukünftige Möglichkeiten bei Quantifizierungstechniken erforschen, um den Kliniker bei der Bewertung der Therapiewirksamkeit während der Nachsorge zu unterstützen.

Darüber hinaus würden wir diese Methoden hinsichtlich der Kosteneffektivität gegenüber klassischen direkten Methoden bewerten, die jetzt vom Bediener abhängig sind.

Studienübersicht

Status

Rekrutierung

Bedingungen

Detaillierte Beschreibung

Unser Projekt ist eine beobachtende retrospektive und prospektive Querschnittsdiagnostik-Pilotstudie über den Vergleich zwischen Standard-Routinelabortests und neuen molekularbiologischen Assays. Insbesondere würden wir die wichtigsten Krankheitserreger-Leishmania-Arten (Alte und Neue Welt Leishmania-Arten), die fünf für den Menschen relevanten Plasmodium-Arten (falciparum, oval, vivax, malaria und knowlesi) und Pneumocystis jiroveci nachweisen.

  1. Positive Proben für Leishmania-Amastigoten im peripheren Blut und/oder Knochenmarkaspirat/Biopsie und/oder aus Hautabschabungen/Biopsien, die zuvor gemäß Routine-Diagnoseassays getestet wurden, werden mit einer spezifischen qualitativen PCR-Analyse unter Verwendung eines kommerziellen Diagnosekits getestet. Zusätzlich würden wir ein System zur DNA-Quantifizierung unter Verwendung des PCR-Zyklusschwellenwerts der einzelnen Probe und einer virtuellen Skala durchführen, die in der Lage ist, die Ergebnisse in die DNA-Last umzuwandeln (Piralla A et al, J clin virol 2013). Anschließend würden wir eine spezifische DNA-Sequenzierung des p70-Gens durchführen, um die Art und den Stamm zu bestimmen.
  2. Plasmodium-Arten-positive Blutproben, die durch Direktmikroskopie und immunochromatographischen Assay getestet und analysiert wurden, werden mit einem Multiplex-PCR-kommerziellen Diagnosekit oder mit einer beschriebenen Methode (A.Berg et al, Infection 2020) getestet, die in der Lage ist, Einzel- oder Mischinfektionen zu bestimmen und die Parasitämie jeweils zu quantifizieren. Im Detail werden die Blutproben mit qualitativer und quantitativer PCR-Analyse für Plasmodium spp bzw. Plasmodium falciparum analysiert. Die Konzentration von P. falciparum-DNA in Blutproben wird durch quantitative Echtzeit-PCR (qPCR) gemessen, wie andernorts beschrieben (Imwong M, J.clin.microb 2014). In Plasmodium falciparum-positiven Proben wird die Menge der aus jeder Probe erhaltenen DNA-Kopien mit dem durch Direktmikroskopieanalyse erhaltenen Parasitämiegrad verglichen. Auf diese Weise möchten wir einen Bereich von DNA-Kopiewerten ermitteln, der mit den verschiedenen Klassifizierungsgraden vergleichbar ist, die derzeit mit Prozentsätzen von für die Infektion positiven roten Blutkörperchen erhalten werden (<5% vs >5%). Auf diese Weise könnte es möglich sein, einen Parasitämiegrad mit quantitativen PCR-Techniken zu bewerten.
  3. Schließlich wird der Nachweis von Pneumocystis jirovecii in positiven BAL- oder Bronchoaspirat (BAS)-Proben, die durch Direktmikroskopie erhalten wurden, durch Verwendung eines PCR-kommerziellen Diagnosekits erneut analysiert. Wie bereits erwähnt, wird der CT-Wert im Vergleich zu Direktmikroskopiedaten in DNA-Last umgewandelt.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

200

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

Studienorte

    • Lombardy
      • Pavia, Lombardy, Italien, 27100
        • Rekrutierung
        • Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo
        • Kontakt:

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Probenahmeverfahren

Wahrscheinlichkeitsstichprobe

Studienpopulation

Positive Proben für Leishmania-Amastigoten im peripheren Blut und/oder Knochenmarkaspirat/Biopsie und/oder von Hautabschabungen/Biopsie, die zuvor gemäß routinemäßigen diagnostischen Tests untersucht wurden 2-Plasmodium-Arten-positive Blutproben, die mittels direkter Mikroskopie und immunochromatographischem Assay getestet und analysiert wurden, 3-Pneumocystis jirovecii in positiven BAL- oder Bronchoaspirat (BAS)-Proben, die durch direkte Mikroskopie gewonnen wurden

Beschreibung

Einschlusskriterien:

Etwa 200-300 Proben, die retrospektiv für die betreffende Studie an das Labor eingesandt wurden, für den Nachweis von P. jirovecii, Plasmodium Malaria und Leishmania, die mit der klassischen Methode getestet wurden.

Ausschlusskriterien:

Proben, die aufgrund von Lagerfehlern und/oder unzureichendem Volumen ungeeignet sind, werden ausgeschlossen.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Pneumocystis-PCR-Test
Zeitfenster: Von Januar 2024 bis September 2025
Primäres Endziel ist die Abschätzung der Sensitivität von PCR-Tests bei der Identifizierung der Hauptpathogene: Leishmania-Arten, Plasmodium-Arten und Pneumocystis jiroveci.
Von Januar 2024 bis September 2025

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Malaria-PCR-Test
Zeitfenster: Von Januar 2025 bis September 2026
Sekundärer Endpunkt wird der Vergleich der Konzentration von P. falciparum-DNA in Blutproben (gemessen durch qPCR) gemäß Parasitämie (>5% vs <5%) sein.
Von Januar 2025 bis September 2026

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

1. September 2023

Primärer Abschluss (Geschätzt)

1. September 2026

Studienabschluss (Geschätzt)

1. Dezember 2026

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

18. November 2025

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

5. Dezember 2025

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

8. Dezember 2025

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

8. Dezember 2025

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

5. Dezember 2025

Zuletzt verifiziert

1. November 2025

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Andere Studien-ID-Nummern

  • P_41

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

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