Molekulares und genomisches Profiling von Kopf-Hals-Tumoren

Frühere Forschungen unserer Gruppe unter Verwendung genetischer Microarray-Analysen von HNSCC und normalen Keratinozyten haben zwei unterschiedliche Gruppen der genetischen Expression identifiziert, basierend auf Clustering-Mustern einer Untergruppe von Genen. Klinische Daten wurden für jede Gruppe zusammengefasst und insgesamt war die Patientensegregation durch Genexpressionsprofilierung ein besserer Prädiktor für das Ergebnis als klinisch-pathologische Variablen. Weitere Analysen identifizierten 375 Gene, die zwischen den genotypischen Subtypen von HNSCC unterscheiden. Insgesamt haben unsere vorläufigen Daten gezeigt, dass das Muster der globalen Genexpression in einer HNSCC-Probe als Prädiktor für die Prognose verwendet werden kann. Wir isolierten Untergruppen von Genen, die die größten Divergenzmuster in der Genexpression zeigen. Wir haben auch 366 überexprimierte und 246 unterexprimierte Gene beim Vergleich des Primärtumors mit normalen chirurgischen Rändern identifiziert und eine ähnliche Anzahl von Genen identifiziert, deren Expression sich beim Vergleich des Primärtumors mit Lymphknotenmetastasen verändert hat. Durch Kombinieren dieser Datensätze haben wir Gene identifiziert, die die Expression während des Fortschreitens von normalem Gewebe zu einem Primärtumor und anschließend zu einem metastatischen Knoten konsistent erhöhen oder verringern. Wir haben mehrere Kandidatengene für die anschließende Analyse mit HNSCC-Gewebarrays ausgewählt. Durch DNA-Microarray-Analyse und andere Techniken zur Untersuchung genetischer und molekularer Merkmale kann bei diesen Patienten ein detaillierteres Wissen über den malignen Transformationsprozess und die Veränderungen durch die Therapie gewonnen werden. Ziel dieser Studie ist es, umfassende molekulare und genetische Profile zu erstellen, um die Entwicklung von Biomarkern bei HNSCC zu verbessern und diese Daten mit klinischen Patientendaten zu korrelieren. Letztendlich hofft man, dass tumorspezifische genetische Anomalien identifiziert werden können, die Angriffspunkte für Behandlungsstrategien wie Gentherapie, Immuntherapie oder andere Interventionen bieten könnten.

Lernziele:

Bewertung von Genexpressionsmustern bei Plattenepithelkarzinomen des menschlichen Kopfes und Halses und Korrelation dieser mit dem Ansprechen auf die Behandlung, sowohl chirurgische als auch nicht-chirurgische.

Identifizierung einer Reihe von diagnostischen Markern in Blut, Urin und/oder Sputum für Plattenepithelkarzinome im Kopf-Hals-Bereich und Untersuchung des Wirkungsmechanismus dieser Proteine.