Untersuchung von Knochenmarkproben von Patienten mit akuter Leukämie

ZIELE:

• Durchführung einer Hochdurchsatz-Sequenzierung einer Reihe von Megakaryozyten-spezifischen Transkriptionsfaktoren, Tyrosinkinasen und Src-Kinasen in DNA, die aus Knochenmarksproben von Erwachsenen mit akuter megakaryoblastischer Leukämie (AMKL) isoliert wurde.
• Untersuchung der Fähigkeit von Src-Kinase-Inhibitoren (SU6656, Dasatinib), die Differenzierung von AMKL-Blasten bei diesen Patienten zu induzieren.

ÜBERBLICK: DNA aus zuvor gesammelten Knochenmarkproben wird sequenziert, um Gene zu analysieren, die mit Transkriptionsfaktoren assoziiert sind (GATA1, GATA2, SCL, FOG-1, ETS1, ETS2, ERG, FLI-1, GABP, HOXA11, NF-E2 und RUNX1) , Tyrosinkinasen (JAK2, JAK3 und c-MPL) und Kinasen der Src-Familie (LYN, FYN und HCK) und mit Kontroll-DNA verglichen. Mithilfe von Bioinformatik werden Genveränderungen mit bekannten Polymorphismen und nachfolgenden Änderungen in der Aminosäuresequenz des kodierten Proteins verglichen. Nachfolgende Assays bewerten die Wirkung auf die Proliferation und Differenzierung, und In-vitro-Studien bewerten die Folgen von Mutationen auf die Fähigkeit zur Transkriptionsfaktor- und Kinaseaktivität. Die Wirkung von SU6656 und Dasatinib auf Zelltod und Polyploidisierung wird durch Durchflusszytometrie bewertet und mit Kontroll-DNA verglichen.