Исследование образцов костного мозга больных острым лейкозом

ЦЕЛИ:

• Провести высокопроизводительное секвенирование набора специфических для мегакариоцитов факторов транскрипции, тирозинкиназ и киназ Src в ДНК, выделенной из образцов костного мозга взрослых с острым мегакариобластным лейкозом (AMKL).
• Оценить способность ингибиторов киназы Src (SU6656, дазатиниб) индуцировать дифференцировку бластов AMKL у этих пациентов.

ПЛАН: ДНК из ранее собранных образцов костного мозга секвенируется для анализа генов, связанных с факторами транскрипции (GATA1, GATA2, SCL, FOG-1, ETS1, ETS2, ERG, FLI-1, GABP, HOXA11, NF-E2 и RUNX1). , тирозинкиназы (JAK2, JAK3 и c-MPL) и киназы семейства Src (LYN, FYN и HCK) и сравнивали с контрольной ДНК. С помощью биоинформатики генные изменения сравниваются с известными полиморфизмами и последующими изменениями аминокислотной последовательности кодируемого белка. Последующие анализы оценивают влияние на пролиферацию и дифференцировку, а исследования in vitro оценивают последствия мутаций на способность фактора транскрипции и активности киназы. Влияние SU6656 и дазатиниба на гибель клеток и полиплоидизацию оценивают с помощью проточной цитометрии и сравнивают с контрольной ДНК.