Studie av benmargsprøver fra pasienter med akutt leukemi

MÅL:

• For å utføre høykapasitetssekvensering av et sett med megakaryocyttspesifikke transkripsjonsfaktorer, tyrosinkinaser og Src-kinaser i DNA isolert fra benmargsprøver fra voksne med akutt megakaryoblastisk leukemi (AMKL).
• For å analysere evnen til Src-kinasehemmere (SU6656, dasatinib) til å indusere differensiering av AMKL-blaster hos disse pasientene.

OVERSIGT: DNA fra tidligere innsamlede benmargsprøver sekvenseres for å analysere gener assosiert med transkripsjonsfaktorer (GATA1, GATA2, SCL, FOG-1, ETS1, ETS2, ERG, FLI-1, GABP, HOXA11, NF-E2 og RUNX1) , tyrosinkinaser (JAK2, JAK3 og c-MPL), og Src-familiekinaser (LYN, FYN og HCK) og sammenlignet med kontroll-DNA. Ved bruk av bioinformatikk sammenlignes genendringer med kjente polymorfismer og påfølgende endringer i aminosyresekvensen til det kodede proteinet. Påfølgende analyser vurderer effekten på proliferasjon og differensiering og in vitro-studier evaluerer konsekvensene av mutasjoner på transkripsjonsfaktor og kinaseaktivitetsevner. Effekten av SU6656 og dasatinib på celledød og polyploidisering blir evaluert ved flowcytometri og sammenlignet med kontroll-DNA.