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Rady Children's Institute Genomic Biorepository

8. Dezember 2022 aktualisiert von: Stephen F. Kingsmore, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

Genomisches Biorepository: Protokoll für die Sammlung, Speicherung, Analyse und Verteilung biologischer Proben, genomischer und klinischer Daten

Das Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCI) wird biologische Proben (z. B. Blut), abgeleitete Genomsequenzen (aus DNA und RNA) und klinische Merkmale in einem Biorepository als standardisierte Ressource für zukünftige Forschungsstudien sammeln. Der Zweck des Genomic Institute Biorepository besteht darin, genehmigte Proben und Daten für die Grundlagen- und klinische Forschung im Zusammenhang mit der genomischen Ursache und Behandlung von Kinderkrankheiten und in Zukunft als Referenzdaten (Qualitätskontrolle) bereitzustellen, um die Fähigkeit zur klinischen Herstellung zu verbessern Diagnosen oder klinische Entscheidungen.

Darüber hinaus wird das Biorepository einen Mechanismus zur Diagnose einer genetischen Krankheit bereitstellen. Das heißt, sobald genomische Sequenzen aus biologischen Proben gewonnen wurden, werden sie sofort analysiert. Wenn eine genetische Krankheit identifiziert wird, die die klinischen Merkmale eines betroffenen Kindes zu erklären scheint, werden diese Ergebnisse durch den medizinisch anerkannten Standard bestätigt und in die elektronische Patientenakte aufgenommen.

Studienübersicht

Detaillierte Beschreibung

RCI wird biologische Proben (z. B. Blut), abgeleitete genomische Sequenzen (aus DNA und RNA) und klinische Merkmale in einem Biorepository als standardisierte Ressource für zukünftige Forschungsstudien sammeln. Der Zweck des Genomics Institute Biorepository besteht darin, genehmigte Proben und Daten für die Grundlagen- und klinische Forschung im Zusammenhang mit der genomischen Ursache und Behandlung von Kinderkrankheiten und in Zukunft als Referenzdaten (Qualitätskontrolle) bereitzustellen, um die Fähigkeit zur klinischen Herstellung zu verbessern Diagnosen oder klinische Entscheidung.

Ein vielfältiges Biorepository biologischer Proben und klinischer Daten ist unerlässlich, damit diese Studien umfassende und detaillierte Vergleiche durchführen können. Insbesondere wird ein großes Biorepository es Forschern des Instituts ermöglichen, neue Ursachen von Krankheiten oder Behandlungsreaktionen in vielen der wenig untersuchten ethnischen und rassischen Gruppen zu identifizieren, denen das Rady Children's Hospital, San Diego (RCHSD) dient.

Insbesondere wird das Biorepository über nachfolgende individuelle Forschungsprotokolle die Forschung ermöglichen, die Raten klinischer Diagnosen für eingeschriebene Probanden und anschließend alle betroffenen Patienten zu verbessern, die den Patienten angebotenen Testmöglichkeiten zu verbessern, das Verständnis der Krankheitsmechanismen und des Ansprechens auf Behandlungen zu verbessern und die klinischen Ergebnisse zu verbessern Management dieser Erkrankungen. Das Biorepository nimmt betroffene und nicht betroffene Personen und Familienmitglieder oder betroffene und nicht betroffene Gewebe zu Analyse- und Vergleichszwecken auf, um die zugrunde liegende Ursache der Krankheit oder Behandlung in den betroffenen Proben zu identifizieren. Proben und Daten werden auf unbestimmte Zeit gespeichert und mit zugelassenen Forschern geteilt, um das Verständnis der genomischen Komponenten von pädiatrischen Krankheiten zu verbessern.

Darüber hinaus wird das Biorepository einen Mechanismus zur Diagnose einer genetischen Krankheit bereitstellen. Das heißt, sobald genomische Sequenzen aus biologischen Proben gewonnen wurden, werden sie sofort analysiert. Wenn eine genetische Krankheit identifiziert wird, die die klinischen Merkmale eines betroffenen Kindes zu erklären scheint, werden diese Ergebnisse in Übereinstimmung mit den Empfehlungen des Clinical Laboratory Improvements Act (CLIA) und des College of American Pathologist (CAP) bestätigt und aufgenommen die elektronische Patientenakte (EHR). Durch CLIA- und CAP-Methoden bestätigte Proben werden als solche identifiziert und für zukünftige Bestätigungsuntersuchungen aufbewahrt.

Spezifische Ziele

  1. Sammeln biologischer Proben und zugehöriger klinischer Daten (Phänomen).
  2. Erstellung, Analyse und Speicherung genomischer Daten aus den biologischen Proben. Genomdaten umfassen Genom-(DNA-)Sequenzen, RNA-Sequenzen und/oder andere verwandte omische Daten (einschließlich Pharmakogenomik, Transkriptomik, Epigenetik und Mikrobiom). Einige genomische Daten werden ganze Genomsequenzen sein. Bei anderen Proben handelt es sich bei den genomischen Daten um Panels spezifischer Gene oder aller Exons von Genen (das „Exom“).
  3. Untersuchung und Verbesserung von Genomiktechnologien und -software zur Verbesserung des Verständnisses und der Testfähigkeiten im Zusammenhang mit Kinderkrankheiten und Behandlungsansprechen.
  4. Bereitstellung von Proben und Daten für qualifizierte Forscher und Mitarbeiter, um das Verständnis von Kinderkrankheiten und Behandlungsansprechen zu fördern.
  5. Sammeln und Korrelieren genomischer Daten aus einer Vielzahl von Populationen und klinischen Präsentationen.
  6. Bereitstellung von Proben- und Datensammlungen mit einheitlicher Zustimmung, Erwerbsmethoden, Speicherung für genombasierte Forschungsstudien mit anschließenden IRB-Genehmigungen.
  7. Analyse und Berichterstattung über klinisch bestätigte genomische Diagnosen und Behandlungsleitlinien durch den Einsatz neuer Forschungstechnologien.
  8. Identifizierung und Untersuchung neuartiger Gen- und Krankheitsprozesse.

Der Ermittler plant, 3000 Probanden pro Jahr einzuschreiben. Nach Einverständniserklärung wird das Studienteam eine Familienanamnese und Blutproben sammeln. Der Prüfarzt sammelt klinische Informationen aus der Krankenakte zum Zeitpunkt der Registrierung und im Längsschnitt, um Änderungen im Gesundheitszustand des Probanden zu bewerten und neue Symptome zu erfassen. Das Studienteam wird Gewebe und andere biologische Materialien, die aus klinischen Verfahren stammen, wie in der klinischen Präsentation angegeben, und für zukünftige Forschungstests auffangen.

Studientyp

Interventionell

Einschreibung (Voraussichtlich)

102000

Phase

  • Unzutreffend

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

  • Name: Dominic Baun, MBS
  • Telefonnummer: 228491 858-576-1700
  • E-Mail: jbaun@rchsd.org

Studieren Sie die Kontaktsicherung

  • Name: Lauren Olsen, MSN
  • Telefonnummer: 228456 858-576-1700
  • E-Mail: lolsen1@rchsd.org

Studienorte

    • California
      • San Diego, California, Vereinigte Staaten, 92123
        • Rekrutierung
        • Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute
        • Kontakt:
          • Dominic Baun, MBS
          • Telefonnummer: 228491 858-576-1700
          • E-Mail: jbaun@rchsd.org
        • Kontakt:

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Alle Altersgruppen, Rassen, Geschlechter, Ethnien und Gesundheitszustände sind zur Teilnahme berechtigt. Die Registrierung umfasst die folgenden gefährdeten Bevölkerungsgruppen: schwangere Frauen, Neugeborene, Föten, Menschen mit kognitiven Behinderungen, pädiatrische Patienten, Minderheiten und Mitarbeiter.

Ausschlusskriterien:

  • Keiner

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Hauptzweck: Versorgungsforschung
  • Zuteilung: N / A
  • Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
  • Maskierung: Keine (Offenes Etikett)

Waffen und Interventionen

Teilnehmergruppe / Arm
Intervention / Behandlung
Experimental: Eingeschriebene
Aufnahme gesunder und betroffener Probanden zur Sammlung von Proben und Daten für ein pädiatrisches genomisches Biorepository. Die Daten umfassen gegebenenfalls die Genomsequenzierung und daraus resultierende molekulardiagnostische Ergebnisse.
Die Proben werden im pädiatrischen genomischen Biorepository aufbewahrt. Eine Teilmenge der Proben wird einer genetischen/genomischen Analyse unterzogen.
Andere Namen:
  • Pädiatrisches genetisches Biorepository
  • Pädiatrische Präzisionspflege

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Anzahl der pro Jahr registrierten Proben
Zeitfenster: Jährlich bis Studienabschluss auf 40 Jahre geschätzt
Einrichtung eines Biorepository für die Verwendung in der Genom-/Präzisionsmedizin in der pädiatrischen Population. Dadurch werden Proben zur Verfügung gestellt, um seltene genetische Erkrankungen, Screening-Methoden, Diagnosemethoden, andere "Omics" und Laborforschung für mögliche Behandlungen zu untersuchen.
Jährlich bis Studienabschluss auf 40 Jahre geschätzt

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Anteil der Kinder, die molekulare Diagnosen erhalten
Zeitfenster: Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre
Nutzen Sie modernste Technologien, um sowohl die Diagnoseraten als auch die Zeit bis zur Diagnose seltener genetischer Krankheiten zu verbessern. Symptomgesteuerte Rückgabe klinischer Ergebnisse und Analyse des klinischen Nutzens.
Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre
Zeit, die benötigt wird, um eine molekulare Diagnose zu erhalten
Zeitfenster: Vom Datum der Einschreibung bis zum Datum der dokumentierten klinischen Labordiagnose oder dem Datum des Todes jeglicher Ursache, je nachdem, was zuerst eintrat, bewertet bis zu 10 Jahre.
Vom Datum der Einschreibung bis zum Datum der dokumentierten klinischen Labordiagnose oder dem Datum des Todes jeglicher Ursache, je nachdem, was zuerst eintrat, bewertet bis zu 10 Jahre.
Anteil der Kinder, bei denen Begriffe der menschlichen Phänotyp-Ontologie (HPO) die molekulare Diagnose genau vorhersagen
Zeitfenster: Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre
Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Ermittler

  • Hauptermittler: Stephen Kingsmore, MD, MSc, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

Publikationen und hilfreiche Links

Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.

Allgemeine Veröffentlichungen

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

1. Juli 2016

Primärer Abschluss (Voraussichtlich)

1. Dezember 2050

Studienabschluss (Voraussichtlich)

1. Dezember 2050

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

10. August 2016

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

26. September 2016

Zuerst gepostet (Schätzen)

28. September 2016

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Schätzen)

12. Dezember 2022

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

8. Dezember 2022

Zuletzt verifiziert

1. Dezember 2022

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • 160468

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

Ja

Beschreibung des IPD-Plans

Wir können Proben und Daten vertraulich mit Mitarbeitern wie kommerziellen Labors oder Technologieunternehmen teilen. Alle Daten und Musterfreigaben werden streng vertraulich behandelt. Es werden keine identifizierenden Informationen weitergegeben.

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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