- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT02917460
Rady Children's Institute Genomic Biorepository
Genomisches Biorepository: Protokoll für die Sammlung, Speicherung, Analyse und Verteilung biologischer Proben, genomischer und klinischer Daten
Das Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCI) wird biologische Proben (z. B. Blut), abgeleitete Genomsequenzen (aus DNA und RNA) und klinische Merkmale in einem Biorepository als standardisierte Ressource für zukünftige Forschungsstudien sammeln. Der Zweck des Genomic Institute Biorepository besteht darin, genehmigte Proben und Daten für die Grundlagen- und klinische Forschung im Zusammenhang mit der genomischen Ursache und Behandlung von Kinderkrankheiten und in Zukunft als Referenzdaten (Qualitätskontrolle) bereitzustellen, um die Fähigkeit zur klinischen Herstellung zu verbessern Diagnosen oder klinische Entscheidungen.
Darüber hinaus wird das Biorepository einen Mechanismus zur Diagnose einer genetischen Krankheit bereitstellen. Das heißt, sobald genomische Sequenzen aus biologischen Proben gewonnen wurden, werden sie sofort analysiert. Wenn eine genetische Krankheit identifiziert wird, die die klinischen Merkmale eines betroffenen Kindes zu erklären scheint, werden diese Ergebnisse durch den medizinisch anerkannten Standard bestätigt und in die elektronische Patientenakte aufgenommen.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
RCI wird biologische Proben (z. B. Blut), abgeleitete genomische Sequenzen (aus DNA und RNA) und klinische Merkmale in einem Biorepository als standardisierte Ressource für zukünftige Forschungsstudien sammeln. Der Zweck des Genomics Institute Biorepository besteht darin, genehmigte Proben und Daten für die Grundlagen- und klinische Forschung im Zusammenhang mit der genomischen Ursache und Behandlung von Kinderkrankheiten und in Zukunft als Referenzdaten (Qualitätskontrolle) bereitzustellen, um die Fähigkeit zur klinischen Herstellung zu verbessern Diagnosen oder klinische Entscheidung.
Ein vielfältiges Biorepository biologischer Proben und klinischer Daten ist unerlässlich, damit diese Studien umfassende und detaillierte Vergleiche durchführen können. Insbesondere wird ein großes Biorepository es Forschern des Instituts ermöglichen, neue Ursachen von Krankheiten oder Behandlungsreaktionen in vielen der wenig untersuchten ethnischen und rassischen Gruppen zu identifizieren, denen das Rady Children's Hospital, San Diego (RCHSD) dient.
Insbesondere wird das Biorepository über nachfolgende individuelle Forschungsprotokolle die Forschung ermöglichen, die Raten klinischer Diagnosen für eingeschriebene Probanden und anschließend alle betroffenen Patienten zu verbessern, die den Patienten angebotenen Testmöglichkeiten zu verbessern, das Verständnis der Krankheitsmechanismen und des Ansprechens auf Behandlungen zu verbessern und die klinischen Ergebnisse zu verbessern Management dieser Erkrankungen. Das Biorepository nimmt betroffene und nicht betroffene Personen und Familienmitglieder oder betroffene und nicht betroffene Gewebe zu Analyse- und Vergleichszwecken auf, um die zugrunde liegende Ursache der Krankheit oder Behandlung in den betroffenen Proben zu identifizieren. Proben und Daten werden auf unbestimmte Zeit gespeichert und mit zugelassenen Forschern geteilt, um das Verständnis der genomischen Komponenten von pädiatrischen Krankheiten zu verbessern.
Darüber hinaus wird das Biorepository einen Mechanismus zur Diagnose einer genetischen Krankheit bereitstellen. Das heißt, sobald genomische Sequenzen aus biologischen Proben gewonnen wurden, werden sie sofort analysiert. Wenn eine genetische Krankheit identifiziert wird, die die klinischen Merkmale eines betroffenen Kindes zu erklären scheint, werden diese Ergebnisse in Übereinstimmung mit den Empfehlungen des Clinical Laboratory Improvements Act (CLIA) und des College of American Pathologist (CAP) bestätigt und aufgenommen die elektronische Patientenakte (EHR). Durch CLIA- und CAP-Methoden bestätigte Proben werden als solche identifiziert und für zukünftige Bestätigungsuntersuchungen aufbewahrt.
Spezifische Ziele
- Sammeln biologischer Proben und zugehöriger klinischer Daten (Phänomen).
- Erstellung, Analyse und Speicherung genomischer Daten aus den biologischen Proben. Genomdaten umfassen Genom-(DNA-)Sequenzen, RNA-Sequenzen und/oder andere verwandte omische Daten (einschließlich Pharmakogenomik, Transkriptomik, Epigenetik und Mikrobiom). Einige genomische Daten werden ganze Genomsequenzen sein. Bei anderen Proben handelt es sich bei den genomischen Daten um Panels spezifischer Gene oder aller Exons von Genen (das „Exom“).
- Untersuchung und Verbesserung von Genomiktechnologien und -software zur Verbesserung des Verständnisses und der Testfähigkeiten im Zusammenhang mit Kinderkrankheiten und Behandlungsansprechen.
- Bereitstellung von Proben und Daten für qualifizierte Forscher und Mitarbeiter, um das Verständnis von Kinderkrankheiten und Behandlungsansprechen zu fördern.
- Sammeln und Korrelieren genomischer Daten aus einer Vielzahl von Populationen und klinischen Präsentationen.
- Bereitstellung von Proben- und Datensammlungen mit einheitlicher Zustimmung, Erwerbsmethoden, Speicherung für genombasierte Forschungsstudien mit anschließenden IRB-Genehmigungen.
- Analyse und Berichterstattung über klinisch bestätigte genomische Diagnosen und Behandlungsleitlinien durch den Einsatz neuer Forschungstechnologien.
- Identifizierung und Untersuchung neuartiger Gen- und Krankheitsprozesse.
Der Ermittler plant, 3000 Probanden pro Jahr einzuschreiben. Nach Einverständniserklärung wird das Studienteam eine Familienanamnese und Blutproben sammeln. Der Prüfarzt sammelt klinische Informationen aus der Krankenakte zum Zeitpunkt der Registrierung und im Längsschnitt, um Änderungen im Gesundheitszustand des Probanden zu bewerten und neue Symptome zu erfassen. Das Studienteam wird Gewebe und andere biologische Materialien, die aus klinischen Verfahren stammen, wie in der klinischen Präsentation angegeben, und für zukünftige Forschungstests auffangen.
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Phase
- Unzutreffend
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: Dominic Baun, MBS
- Telefonnummer: 228491 858-576-1700
- E-Mail: jbaun@rchsd.org
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Lauren Olsen, MSN
- Telefonnummer: 228456 858-576-1700
- E-Mail: lolsen1@rchsd.org
Studienorte
-
-
California
-
San Diego, California, Vereinigte Staaten, 92123
- Rekrutierung
- Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute
-
Kontakt:
- Dominic Baun, MBS
- Telefonnummer: 228491 858-576-1700
- E-Mail: jbaun@rchsd.org
-
Kontakt:
- Lauren Olsen, MSN
- Telefonnummer: 228456 858-576-1700
- E-Mail: lolsen1@rchsd.org
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Alle Altersgruppen, Rassen, Geschlechter, Ethnien und Gesundheitszustände sind zur Teilnahme berechtigt. Die Registrierung umfasst die folgenden gefährdeten Bevölkerungsgruppen: schwangere Frauen, Neugeborene, Föten, Menschen mit kognitiven Behinderungen, pädiatrische Patienten, Minderheiten und Mitarbeiter.
Ausschlusskriterien:
- Keiner
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Hauptzweck: Versorgungsforschung
- Zuteilung: N / A
- Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
- Maskierung: Keine (Offenes Etikett)
Waffen und Interventionen
Teilnehmergruppe / Arm |
Intervention / Behandlung |
|---|---|
|
Experimental: Eingeschriebene
Aufnahme gesunder und betroffener Probanden zur Sammlung von Proben und Daten für ein pädiatrisches genomisches Biorepository.
Die Daten umfassen gegebenenfalls die Genomsequenzierung und daraus resultierende molekulardiagnostische Ergebnisse.
|
Die Proben werden im pädiatrischen genomischen Biorepository aufbewahrt.
Eine Teilmenge der Proben wird einer genetischen/genomischen Analyse unterzogen.
Andere Namen:
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Anzahl der pro Jahr registrierten Proben
Zeitfenster: Jährlich bis Studienabschluss auf 40 Jahre geschätzt
|
Einrichtung eines Biorepository für die Verwendung in der Genom-/Präzisionsmedizin in der pädiatrischen Population.
Dadurch werden Proben zur Verfügung gestellt, um seltene genetische Erkrankungen, Screening-Methoden, Diagnosemethoden, andere "Omics" und Laborforschung für mögliche Behandlungen zu untersuchen.
|
Jährlich bis Studienabschluss auf 40 Jahre geschätzt
|
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Anteil der Kinder, die molekulare Diagnosen erhalten
Zeitfenster: Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre
|
Nutzen Sie modernste Technologien, um sowohl die Diagnoseraten als auch die Zeit bis zur Diagnose seltener genetischer Krankheiten zu verbessern.
Symptomgesteuerte Rückgabe klinischer Ergebnisse und Analyse des klinischen Nutzens.
|
Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre
|
|
Zeit, die benötigt wird, um eine molekulare Diagnose zu erhalten
Zeitfenster: Vom Datum der Einschreibung bis zum Datum der dokumentierten klinischen Labordiagnose oder dem Datum des Todes jeglicher Ursache, je nachdem, was zuerst eintrat, bewertet bis zu 10 Jahre.
|
Vom Datum der Einschreibung bis zum Datum der dokumentierten klinischen Labordiagnose oder dem Datum des Todes jeglicher Ursache, je nachdem, was zuerst eintrat, bewertet bis zu 10 Jahre.
|
|
|
Anteil der Kinder, bei denen Begriffe der menschlichen Phänotyp-Ontologie (HPO) die molekulare Diagnose genau vorhersagen
Zeitfenster: Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre
|
Bis Studienabschluss voraussichtlich 40 Jahre
|
Mitarbeiter und Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Stephen Kingsmore, MD, MSc, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Briggs B, James KN, Chowdhury S, Thornburg C, Farnaes L, Dimmock D, Kingsmore SF; RCIGM Investigators. Novel Factor XIII variant identified through whole-genome sequencing in a child with intracranial hemorrhage. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Dec 17;4(6). pii: a003525. doi: 10.1101/mcs.a003525. Print 2018 Dec.
- Clark MM, Hildreth A, Batalov S, Ding Y, Chowdhury S, Watkins K, Ellsworth K, Camp B, Kint CI, Yacoubian C, Farnaes L, Bainbridge MN, Beebe C, Braun JJA, Bray M, Carroll J, Cakici JA, Caylor SA, Clarke C, Creed MP, Friedman J, Frith A, Gain R, Gaughran M, George S, Gilmer S, Gleeson J, Gore J, Grunenwald H, Hovey RL, Janes ML, Lin K, McDonagh PD, McBride K, Mulrooney P, Nahas S, Oh D, Oriol A, Puckett L, Rady Z, Reese MG, Ryu J, Salz L, Sanford E, Stewart L, Sweeney N, Tokita M, Van Der Kraan L, White S, Wigby K, Williams B, Wong T, Wright MS, Yamada C, Schols P, Reynders J, Hall K, Dimmock D, Veeraraghavan N, Defay T, Kingsmore SF. Diagnosis of genetic diseases in seriously ill children by rapid whole-genome sequencing and automated phenotyping and interpretation. Sci Transl Med. 2019 Apr 24;11(489):eaat6177. doi: 10.1126/scitranslmed.aat6177.
- Friedman J, Smith DE, Issa MY, Stanley V, Wang R, Mendes MI, Wright MS, Wigby K, Hildreth A, Crawford JR, Koehler AE, Chowdhury S, Nahas S, Zhai L, Xu Z, Lo WS, James KN, Musaev D, Accogli A, Guerrero K, Tran LT, Omar TEI, Ben-Omran T, Dimmock D, Kingsmore SF, Salomons GS, Zaki MS, Bernard G, Gleeson JG. Biallelic mutations in valyl-tRNA synthetase gene VARS are associated with a progressive neurodevelopmental epileptic encephalopathy. Nat Commun. 2019 Feb 12;10(1):707. doi: 10.1038/s41467-018-07067-3.
- Kadakia S, Farnaes L, Dimmock D, Chowdhury S, Ding Y, Anderson EJ, Kingsmore S, Newfield RS. Diagnosis and treatment of a boy with IPEX syndrome presenting with diabetes in early infancy. Clin Case Rep. 2019 Sep 27;7(11):2123-2127. doi: 10.1002/ccr3.2438. eCollection 2019 Nov.
- Laurenzano SE, McFall C, Nguyen L, Savla D, Coufal NG, Wright MS, Tokita M, Dimmock D, Kingsmore SF, Newfield RS. Neonatal diabetes mellitus due to a novel variant in the INS gene. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2019 Aug 1;5(4):a004085. doi: 10.1101/mcs.a004085. Print 2019 Aug.
- Sanford EF, Clark MM, Farnaes L, Williams MR, Perry JC, Ingulli EG, Sweeney NM, Doshi A, Gold JJ, Briggs B, Bainbridge MN, Feddock M, Watkins K, Chowdhury S, Nahas SA, Dimmock DP, Kingsmore SF, Coufal NG; RCIGM Investigators. Rapid Whole Genome Sequencing Has Clinical Utility in Children in the PICU. Pediatr Crit Care Med. 2019 Nov;20(11):1007-1020. doi: 10.1097/PCC.0000000000002056.
- Tokita MJ, Nahas S, Briggs B, Malicki DM, Mesirov JP, Reyes IAC, Farnaes L, Levy ML, Kingsmore SF, Dimmock D, Crawford JR, Wechsler-Reya RJ. Biallelic loss of GNAS in a patient with pediatric medulloblastoma. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2019 Oct 23;5(5):a004572. doi: 10.1101/mcs.a004572. Print 2019 Oct.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
Studienabschluss (Voraussichtlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Schätzen)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Schätzen)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- 160468
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
Beschreibung des IPD-Plans
Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .