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Biorrepositorio genómico del Rady Children's Institute

8 de diciembre de 2022 actualizado por: Stephen F. Kingsmore, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

Biorepositorio Genómico: Protocolo para la Recolección, Almacenamiento, Análisis y Distribución de Muestras Biológicas, Datos Genómicos y Clínicos

El Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCI) recolectará muestras biológicas (como sangre), secuencias genómicas derivadas (de ADN y ARN) y características clínicas en un Biorepositorio como un recurso estandarizado para futuros estudios de investigación. El propósito del Biorepositorio del Instituto Genómico es proporcionar muestras y datos autorizados para la investigación básica y clínica relacionada con la causa genómica y el tratamiento de enfermedades infantiles y, en el futuro, como datos de referencia (control de calidad) para mejorar la capacidad de hacer pruebas clínicas. diagnósticos o decisiones clínicas.

Además, el Biorepositorio proporcionará un mecanismo para realizar un diagnóstico de una enfermedad genética. Es decir, una vez que las secuencias genómicas se hayan derivado de muestras biológicas, se analizarán inmediatamente. Si se identifica una enfermedad genética que parece explicar las características clínicas de un niño afectado, esos resultados serán confirmados por el estándar médicamente aceptado y se colocarán en el registro de salud electrónico.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

RCI recolectará muestras biológicas (como sangre), secuencias genómicas derivadas (de ADN y ARN) y características clínicas en un Biorepositorio como un recurso estandarizado para futuros estudios de investigación. El propósito del Biorepositorio del Instituto de Genómica es proporcionar muestras y datos autorizados para la investigación básica y clínica relacionada con la causa genómica y el tratamiento de enfermedades infantiles y, en el futuro, como datos de referencia (Control de calidad) para mejorar la capacidad de hacer pruebas clínicas. diagnósticos o decisión clínica.

Un Biorepositorio diverso de muestras biológicas y datos clínicos es esencial para permitir que estos estudios realicen comparaciones amplias y detalladas. En particular, un gran Biorepositorio permitirá a los investigadores afiliados al Instituto identificar nuevas causas de enfermedades o respuestas al tratamiento en muchos de los grupos étnicos y raciales poco estudiados a los que atiende el Rady Children's Hospital, San Diego (RCHSD).

Específicamente, el Biorepositorio, a través de protocolos de investigación individuales subsiguientes, permitirá que la investigación mejore las tasas de diagnósticos clínicos para los sujetos inscritos y, posteriormente, para todos los pacientes afectados, mejorará las capacidades de prueba que se ofrecen a los pacientes, mejorará la comprensión de los mecanismos de la enfermedad y las respuestas al tratamiento, y mejorará los resultados clínicos. manejo de estas enfermedades. El Biorepositorio inscribirá a personas y familiares afectados y no afectados, o tejidos afectados y no afectados, con fines de análisis y comparación para identificar la causa subyacente de la enfermedad o el tratamiento en las muestras afectadas. Las muestras y los datos se almacenarán indefinidamente y se compartirán con investigadores aprobados para comprender mejor los componentes genómicos de las enfermedades pediátricas.

Además, el Biorepositorio proporcionará un mecanismo para realizar un diagnóstico de una enfermedad genética. Es decir, una vez que las secuencias genómicas se hayan derivado de muestras biológicas, se analizarán inmediatamente. Si se identifica una enfermedad genética que parece explicar las características clínicas de un niño afectado, esos resultados se confirmarán de una manera que cumpla con las recomendaciones de la Ley de Mejoras de Laboratorio Clínico (CLIA) y el Colegio de Patólogos Estadounidenses (CAP), y se colocarán en la historia clínica electrónica (HCE). Las muestras confirmadas por los métodos CLIA y CAP se identificarán como tales y se conservarán para futuras investigaciones de confirmación.

Objetivos Específicos

  1. Recoger muestras biológicas y datos clínicos asociados (Phenoma).
  2. Para crear, analizar y almacenar datos genómicos de las muestras biológicas. Los datos genómicos incluirán secuencias de genoma (ADN), secuencias de ARN y/u otros datos ómicos relacionados (que incluyen farmacogenómica, transcriptómica, epigenética y el microbioma). Algunos datos genómicos serán secuencias del genoma completo. Para otras muestras, los datos genómicos serán paneles de genes específicos o de todos los exones de genes (el "Exoma").
  3. Investigar y mejorar las tecnologías y el software de genómica para mejorar la comprensión y las capacidades de prueba relacionadas con las enfermedades infantiles y las respuestas al tratamiento.
  4. Poner muestras y datos a disposición de investigadores y colaboradores calificados para mejorar la comprensión de las enfermedades infantiles y las respuestas al tratamiento.
  5. Para recopilar y correlacionar datos genómicos de una amplia variedad de poblaciones y presentaciones clínicas.
  6. Proporcionar colecciones de muestras y datos con consentimiento uniforme, métodos de adquisición, almacenamiento para estudios de investigación basados ​​en el genoma con las aprobaciones posteriores del IRB.
  7. Analizar e informar diagnósticos genómicos clínicamente confirmados y orientación de tratamiento mediante el uso de nuevas tecnologías de investigación.
  8. Identificar y estudiar nuevos genes y procesos de enfermedades.

El investigador planea inscribir 3000 sujetos por año. Tras el consentimiento informado, el equipo de estudio recopilará antecedentes familiares y muestras de sangre. El investigador recopilará información clínica de la historia clínica en el momento de la inscripción y de forma longitudinal para evaluar los cambios en la condición médica del sujeto, así como para recopilar nuevos síntomas. El equipo de estudio recolectará tejido y otros materiales biológicos obtenidos de procedimientos clínicos según lo indicado por la presentación clínica y para futuras pruebas de investigación.

Tipo de estudio

Intervencionista

Inscripción (Anticipado)

102000

Fase

  • No aplica

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

  • Nombre: Dominic Baun, MBS
  • Número de teléfono: 228491 858-576-1700
  • Correo electrónico: jbaun@rchsd.org

Copia de seguridad de contactos de estudio

  • Nombre: Lauren Olsen, MSN
  • Número de teléfono: 228456 858-576-1700
  • Correo electrónico: lolsen1@rchsd.org

Ubicaciones de estudio

    • California
      • San Diego, California, Estados Unidos, 92123
        • Reclutamiento
        • Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute
        • Contacto:
          • Dominic Baun, MBS
          • Número de teléfono: 228491 858-576-1700
          • Correo electrónico: jbaun@rchsd.org
        • Contacto:
          • Lauren Olsen, MSN
          • Número de teléfono: 228456 858-576-1700
          • Correo electrónico: lolsen1@rchsd.org

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Niño
  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Todas las edades, razas, géneros, etnias y estado de salud serán elegibles para participar. La inscripción incluirá las siguientes poblaciones vulnerables: mujeres embarazadas, recién nacidos, fetos, personas con discapacidades cognitivas, pacientes pediátricos, minorías y empleados.

Criterio de exclusión:

  • Ninguno

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Propósito principal: Investigación de servicios de salud
  • Asignación: N / A
  • Modelo Intervencionista: Asignación de un solo grupo
  • Enmascaramiento: Ninguno (etiqueta abierta)

Armas e Intervenciones

Grupo de participantes/brazo
Intervención / Tratamiento
Experimental: Inscritos
Inscripción de sujetos sanos y afectados para recolectar muestras y datos para un Biorepositorio genómico pediátrico. Los datos incluyen la secuenciación genómica y los resultados de diagnóstico molecular resultantes, si los hubiere.
Las muestras se almacenarán en el Biorepositorio genómico pediátrico. Un subconjunto de muestras se someterá a un análisis genético/genómico.
Otros nombres:
  • Biorrepositorio Genético Pediátrico
  • Atención pediátrica de precisión

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Número de muestras inscritas por año
Periodo de tiempo: Anualmente hasta la finalización del estudio estimado en 40 años
Establecimiento de un Biorepositorio para uso genómico/medicina de precisión en población pediátrica. Esto hará que las muestras estén disponibles para estudiar trastornos genéticos raros, métodos de detección, métodos de diagnóstico, otros "ómicos" e investigación de banco para posibles tratamientos.
Anualmente hasta la finalización del estudio estimado en 40 años

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Proporción de niños que reciben diagnósticos moleculares
Periodo de tiempo: A través de la finalización del estudio estimado en 40 años.
Utilice tecnologías de vanguardia para mejorar tanto las tasas de diagnóstico como el tiempo de diagnóstico de enfermedades genéticas raras. Retorno basado en síntomas de resultados clínicos y análisis de utilidad clínica.
A través de la finalización del estudio estimado en 40 años.
Tiempo necesario para recibir el diagnóstico molecular
Periodo de tiempo: Desde la fecha de inscripción hasta la fecha del diagnóstico de laboratorio clínico documentado o la fecha de muerte por cualquier causa, lo que ocurra primero, evaluado hasta 10 años.
Desde la fecha de inscripción hasta la fecha del diagnóstico de laboratorio clínico documentado o la fecha de muerte por cualquier causa, lo que ocurra primero, evaluado hasta 10 años.
Proporción de niños en los que los términos de la ontología del fenotipo humano (HPO) predicen con precisión el diagnóstico molecular
Periodo de tiempo: A través de la finalización del estudio estimado en 40 años.
A través de la finalización del estudio estimado en 40 años.

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Investigadores

  • Investigador principal: Stephen Kingsmore, MD, MSc, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Publicaciones Generales

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

1 de julio de 2016

Finalización primaria (Anticipado)

1 de diciembre de 2050

Finalización del estudio (Anticipado)

1 de diciembre de 2050

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

10 de agosto de 2016

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

26 de septiembre de 2016

Publicado por primera vez (Estimar)

28 de septiembre de 2016

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Estimar)

12 de diciembre de 2022

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

8 de diciembre de 2022

Última verificación

1 de diciembre de 2022

Más información

Términos relacionados con este estudio

Términos MeSH relevantes adicionales

Otros números de identificación del estudio

  • 160468

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

Descripción del plan IPD

Podemos compartir muestras y datos de forma confidencial con colaboradores, como laboratorios comerciales o empresas de tecnología. Todos los datos y el intercambio de muestras serán estrictamente confidenciales. No se compartirá ninguna información de identificación.

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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