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Biorrepositório genômico do Rady Children's Institute

8 de dezembro de 2022 atualizado por: Stephen F. Kingsmore, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

Biorrepositório Genômico: Protocolo para Coleta, Armazenamento, Análise e Distribuição de Amostras Biológicas, Dados Genômicos e Clínicos

O Rady Children's Institute for Genomic Medicine (RCI) coletará amostras biológicas (como sangue), sequências genômicas derivadas (de DNA e RNA) e características clínicas em um Biorepositório como um recurso padronizado para futuros estudos de pesquisa. O objetivo do Biorepositório do Instituto Genômico é fornecer amostras e dados consentidos para pesquisas básicas e clínicas relacionadas à causa genômica e tratamento de doenças infantis e, no futuro, como dados de referência (Controle de Qualidade) para melhorar a capacidade de fazer análises clínicas diagnósticos ou decisões clínicas.

Além disso, o Biorepositório fornecerá um mecanismo para fazer o diagnóstico de uma doença genética. Ou seja, uma vez que as sequências genômicas tenham sido derivadas de amostras biológicas, elas serão imediatamente analisadas. Se for identificada uma doença genética que pareça explicar as características clínicas de uma criança afetada, esses resultados serão confirmados pelo padrão medicamente aceito e colocados no registro eletrônico de saúde.

Visão geral do estudo

Descrição detalhada

O RCI coletará amostras biológicas (como sangue), sequências genômicas derivadas (de DNA e RNA) e características clínicas em um Biorepositório como um recurso padronizado para futuros estudos de pesquisa. O objetivo do Biorepositório do Genomics Institute é fornecer amostras e dados consentidos para pesquisas básicas e clínicas relacionadas à causa genômica e tratamento de doenças infantis e, no futuro, como dados de referência (Controle de Qualidade) para melhorar a capacidade de fazer análises clínicas diagnóstico ou decisão clínica.

Um biorrepositório diversificado de amostras biológicas e dados clínicos é essencial para permitir que esses estudos realizem comparações amplas e detalhadas. Em particular, um grande biorrepositório permitirá que pesquisadores afiliados ao Instituto identifiquem novas causas de doenças ou respostas a tratamentos em muitos dos grupos étnicos e raciais pouco estudados que o Rady Children's Hospital, San Diego (RCHSD) atende.

Especificamente, o Biorepositório, por meio de protocolos de pesquisa individuais subsequentes, permitirá que a pesquisa melhore as taxas de diagnósticos clínicos para indivíduos inscritos e, posteriormente, todos os pacientes afetados, melhore os recursos de teste oferecidos aos pacientes, melhore a compreensão dos mecanismos da doença e das respostas ao tratamento e melhore as respostas clínicas manejo dessas doenças. O Biorepositório registrará indivíduos e familiares afetados e não afetados, ou tecidos afetados e não afetados, para fins de análise e comparação, a fim de identificar a causa subjacente da doença ou tratamento nas amostras afetadas. Amostras e dados serão armazenados indefinidamente e compartilhados com pesquisadores aprovados para maior compreensão dos componentes genômicos de doenças pediátricas.

Além disso, o Biorepositório fornecerá um mecanismo para fazer o diagnóstico de uma doença genética. Ou seja, uma vez que as sequências genômicas tenham sido derivadas de amostras biológicas, elas serão imediatamente analisadas. Se for identificada uma doença genética que pareça explicar as características clínicas de uma criança afetada, esses resultados serão confirmados de maneira compatível com as recomendações do Clinical Laboratory Improvements Act (CLIA) e do College of American Pathologist (CAP) e colocados em o prontuário eletrônico de saúde (EHR). As amostras confirmadas pelos métodos CLIA e CAP serão identificadas como tal e retidas para futuras investigações confirmatórias.

Objetivos Específicos

  1. Recolher amostras biológicas e dados clínicos associados (Fenoma).
  2. Para criar, analisar e armazenar dados genômicos das amostras biológicas. Os dados genômicos incluirão sequências de genoma (DNA), sequências de RNA e/ou outros dados ômicos relacionados (incluindo farmacogenômica, transcriptômica, epigenética e o microbioma). Alguns dados genômicos serão sequências completas do genoma. Para outras amostras, os dados genômicos serão painéis de genes específicos ou de todos os éxons de genes (o "Exoma").
  3. Investigar e melhorar tecnologias e softwares de genômica para melhorar a compreensão e testar habilidades relacionadas a doenças infantis e respostas a tratamentos.
  4. Disponibilizar espécimes e dados para pesquisadores e colaboradores qualificados para aprofundar a compreensão das doenças infantis e as respostas ao tratamento.
  5. Coletar e correlacionar dados genômicos de uma ampla variedade de populações e apresentações clínicas.
  6. Fornecer amostras e coletas de dados com consentimento uniforme, métodos de aquisição, armazenamento para estudos de pesquisa baseados em genoma com aprovações subsequentes do IRB.
  7. Analisar e relatar diagnósticos genômicos clinicamente confirmados e orientações de tratamento por meio do uso de novas tecnologias de pesquisa.
  8. Identificar e estudar novos genes e processos de doenças.

O investigador planejará inscrever 3.000 indivíduos por ano. Após o consentimento informado, a equipe do estudo coletará um histórico familiar e amostras de sangue. O investigador coletará informações clínicas do prontuário médico no momento da inscrição e longitudinalmente para avaliar as mudanças na condição médica do sujeito, bem como coletar novos sintomas. A equipe do estudo coletará tecidos e outros materiais biológicos obtidos de procedimentos clínicos conforme indicado pela apresentação clínica e para futuros testes de pesquisa.

Tipo de estudo

Intervencional

Inscrição (Antecipado)

102000

Estágio

  • Não aplicável

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Contato de estudo

  • Nome: Dominic Baun, MBS
  • Número de telefone: 228491 858-576-1700
  • E-mail: jbaun@rchsd.org

Estude backup de contato

  • Nome: Lauren Olsen, MSN
  • Número de telefone: 228456 858-576-1700
  • E-mail: lolsen1@rchsd.org

Locais de estudo

    • California
      • San Diego, California, Estados Unidos, 92123
        • Recrutamento
        • Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute
        • Contato:
          • Dominic Baun, MBS
          • Número de telefone: 228491 858-576-1700
          • E-mail: jbaun@rchsd.org
        • Contato:
          • Lauren Olsen, MSN
          • Número de telefone: 228456 858-576-1700
          • E-mail: lolsen1@rchsd.org

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

  • Filho
  • Adulto
  • Adulto mais velho

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Gêneros Elegíveis para o Estudo

Tudo

Descrição

Critério de inclusão:

  • Todas as idades, raças, gêneros, etnias e estado de saúde serão elegíveis para participação. A inscrição incluirá as seguintes populações vulneráveis: mulheres grávidas, recém-nascidos, fetos, pessoas com deficiências cognitivas, pacientes pediátricos, minorias e funcionários.

Critério de exclusão:

  • Nenhum

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Finalidade Principal: Pesquisa de serviços de saúde
  • Alocação: N / D
  • Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
  • Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)

Armas e Intervenções

Grupo de Participantes / Braço
Intervenção / Tratamento
Experimental: Inscritos
Inscrição de indivíduos saudáveis ​​e afetados para coletar amostras e dados para um Biorepositório genômico pediátrico. Os dados incluem sequenciamento genômico e resultados de diagnóstico molecular resultantes, se houver.
As amostras serão armazenadas no Biorepositório genômico pediátrico. Um subconjunto de amostras passará por análise genética/genômica.
Outros nomes:
  • Biorepositório Genético Pediátrico
  • Cuidados de precisão pediátrica

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Número de amostras inscritas por ano
Prazo: Anualmente até a conclusão do estudo estimado em 40 anos
Estabelecimento de um Biorrepositório para uso em genômica/medicina de precisão na população pediátrica. Isso disponibilizará amostras para estudar distúrbios genéticos raros, métodos de triagem, métodos de diagnóstico, outros "omics" e pesquisa de bancada para possíveis tratamentos.
Anualmente até a conclusão do estudo estimado em 40 anos

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Proporção de crianças que recebem diagnósticos moleculares
Prazo: Através da conclusão do estudo estimado em 40 anos
Utilize tecnologias de ponta para melhorar as taxas de diagnóstico e o tempo para o diagnóstico de doenças genéticas raras. Retorno baseado em sintomas de resultados clínicos e análise de utilidade clínica.
Através da conclusão do estudo estimado em 40 anos
Tempo necessário para receber o diagnóstico molecular
Prazo: Desde a data de inscrição até a data do diagnóstico laboratorial clínico documentado ou data da morte por qualquer causa, o que ocorrer primeiro, avaliado até 10 anos.
Desde a data de inscrição até a data do diagnóstico laboratorial clínico documentado ou data da morte por qualquer causa, o que ocorrer primeiro, avaliado até 10 anos.
Proporção de crianças em que os termos da ontologia do fenótipo humano (HPO) preveem com precisão o diagnóstico molecular
Prazo: Através da conclusão do estudo estimado em 40 anos
Através da conclusão do estudo estimado em 40 anos

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Investigadores

  • Investigador principal: Stephen Kingsmore, MD, MSc, Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute

Publicações e links úteis

A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.

Publicações Gerais

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

1 de julho de 2016

Conclusão Primária (Antecipado)

1 de dezembro de 2050

Conclusão do estudo (Antecipado)

1 de dezembro de 2050

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

10 de agosto de 2016

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

26 de setembro de 2016

Primeira postagem (Estimativa)

28 de setembro de 2016

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Estimativa)

12 de dezembro de 2022

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

8 de dezembro de 2022

Última verificação

1 de dezembro de 2022

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Termos MeSH relevantes adicionais

Outros números de identificação do estudo

  • 160468

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

Sim

Descrição do plano IPD

Podemos compartilhar amostras e dados de forma confidencial com colaboradores, como laboratórios comerciais ou empresas de tecnologia. Todos os dados e compartilhamento de amostras serão estritamente confidenciais. Nenhuma informação de identificação será compartilhada.

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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