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Utility of Whole Genome Sequencing in Fetuses With Abnormal Ultrasound Findings

20 de mayo de 2026 actualizado por: Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University

Clinical Study on Prenatal Diagnosis of Fetal Abnormalities of Unknown Cause Using Whole-Genome Sequencing: A Multicenter Study

The goal of this observational study is to learn if whole-genome sequencing (WGS) can help find the genetic cause in fetuses with structural abnormalities that remain unexplained after standard genetic testing (such as karyotyping, chromosomal microarray, or whole-exome sequencing). It will also learn how WGS results may affect pregnancy management and family decision-making.

The main questions it aims to answer are:

How often does WGS identify a genetic cause in these fetuses? Does WGS find more genetic causes compared to standard genetic tests? Can combining WGS with other molecular analyses help discover new disease genes or pathways? Researchers will compare WGS results to results from standard genetic tests to see if WGS finds more genetic causes.

Participants are pregnant women whose fetuses have structural abnormalities seen on ultrasound or MRI, with negative results from routine genetic testing. Participants will:

Undergo an invasive procedure (such as amniocentesis) or provide postnatal samples as part of their regular medical care Allow the use of leftover samples for WGS and additional molecular studies Be followed until after delivery to collect information on pregnancy outcomes and neonatal health

Descripción general del estudio

Estado

Estado

Indica el estado de contratación actual o el estado de acceso ampliado.
Reclutamiento

Condiciones

Condiciones

La enfermedad, trastorno, síndrome, dolencia o lesión que se está estudiando. En ClinicalTrials.gov, las condiciones también pueden incluir otros problemas relacionados con la salud, como la esperanza de vida, la calidad de vida y los riesgos para la salud.

Tipo de estudio

Tipo de estudio

Describe la naturaleza de un estudio clínico. Los tipos de estudio incluyen estudios de intervención (también llamados ensayos clínicos), estudios observacionales (incluidos registros de pacientes) y acceso ampliado.
De observación

Inscripción (Estimado)

Inscripción

El número de participantes en un estudio clínico. La inscripción "anticipada" es el número objetivo de participantes que los investigadores necesitan para el estudio.
1000

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

Estudio Contacto

El nombre y la información de contacto de la persona que puede responder las preguntas de inscripción para un estudio clínico. Cada ubicación donde se lleva a cabo el estudio también puede tener un contacto específico, que puede responder mejor a esas preguntas.
  • Nombre: Qiong Luo
  • Número de teléfono: +86 571 89998819
  • Correo electrónico: luoq@zju.edu.cn

Ubicaciones de estudio

  • Porcelana
    • Zhejiang
      • Hangzhou, Zhejiang, Porcelana, 310006
        • Reclutamiento
        • Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University
        • Contacto:
          • Qiong Luo
          • Número de teléfono: +86 571 89998819
          • Correo electrónico: luoq@zju.edu.cn
      • Huzhou, Zhejiang, Porcelana, 313000
        • Reclutamiento
        • Huzhou Maternity & Child Care Hospital
        • Contacto:
          • Liping Qiu
          • Número de teléfono: +86 15906823270
          • Correo electrónico: 392686340@qq.com
      • Quzhou, Zhejiang, Porcelana, 324000
        • Reclutamiento
        • Quzhou Maternal and Child Health Care Hospital
        • Contacto:
          • Yuying Zhu
          • Número de teléfono: +86 15257023995
          • Correo electrónico: zhuyuy123@163.com
      • Shaoxing, Zhejiang, Porcelana, 312000
        • Reclutamiento
        • Shaoxing Maternity & Child Care Hospital
        • Contacto:
          • Hualin Xu
          • Número de teléfono: +86 13867526767
          • Correo electrónico: xhl0175@sina.cn

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Criterio de elegibilidad

Los principales requisitos que deben cumplir las personas que quieran participar en un estudio clínico o las características que deben tener. Los criterios de elegibilidad consisten en criterios de inclusión (que se requieren para que una persona participe en el estudio) y criterios de exclusión (que impiden que una persona participe). Los tipos de criterios de elegibilidad incluyen si un estudio acepta voluntarios sanos, tiene requisitos de edad o grupo de edad, o está limitado por sexo.

Edades elegibles para estudiar

  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

Pregnant women aged 18 years or older with singleton pregnancies, whose fetuses have structural abnormalities detected by ultrasound or MRI between 11+0 and 32+0 weeks of gestation, and who are scheduled to undergo invasive or postnatal genetic diagnostic procedures.

Descripción

Inclusion Criteria:

  1. Pregnant women aged ≥ 18 years.
  2. Singleton pregnancy.
  3. Gestational age between 11+0 and 32+0 weeks, with ultrasound or MRI indicating a definite structural malformation in the fetus (may be with or without soft marker abnormalities) requiring prenatal diagnosis (see Appendices 1 and 2). Fetal developmental abnormalities include those of the central nervous system, cardiovascular system, craniofacial/neck region, chest/mediastinum, abdomen/digestive tract, urinary system, skeletal system/limbs, and systemic abnormalities such as fetal hydrops, abnormally thickened placenta with hydrops, and severe growth restriction. Criteria for ultrasound soft markers and structural malformations are provided in the appendices.
  4. Planned to undergo at least one invasive or postnatal procedure for genetic diagnosis, and consent to the use of residual diagnostic samples for research testing.
  5. Signed unified informed consent form, agreement to follow-up, and consent for storage and submission of samples and data according to the protocol.

Exclusion Criteria:

  1. Age < 18 years or individuals lacking full capacity for civil conduct.
  2. Twin or multiple pregnancies.
  3. Known parental or familial carrier status of a pathogenic variant highly consistent with the current fetal phenotype, where testing is planned only for targeted confirmation.
  4. Refusal to consent to the storage and use of samples and data for this study.
  5. Other conditions deemed unsuitable for participation in this study by the investigator.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medidas de resultado primarias

En el protocolo de un estudio clínico, la medida de resultado planificada que es la más importante para evaluar el efecto de una intervención/tratamiento. La mayoría de los estudios clínicos tienen una medida de resultado primaria, pero algunos tienen más de una.
Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Diagnostic yield of WGS
Periodo de tiempo: 8 weeks after enrollment of the last participant
Proportion of fetuses with structural malformations or significant ultrasound abnormalities in whom whole-genome sequencing (WGS) using fetal and related tissues identifies at least one pathogenic or likely pathogenic variant. Overall diagnostic yield (including pathogenic/likely pathogenic variants and variants of uncertain significance reclassified as pathogenic/likely pathogenic based on additional evidence) will also be reported.
8 weeks after enrollment of the last participant
Comparison of diagnostic increment of WGS vs. standard clinical testing pathway
Periodo de tiempo: 12 weeks after enrollment of the last participant
Difference in diagnostic rate (proportion of fetuses with pathogenic/likely pathogenic variants) between whole-genome sequencing (WGS) and the current standard clinical testing pathway (karyotyping, CMA/CNV-seq, WES/panel). Stratified analysis by malformation type (e.g., isolated CNS, cardiac, skeletal, multiple systems) and by pattern of system involvement will be reported.
12 weeks after enrollment of the last participant
Number of novel candidate disease genes and enriched molecular pathways
Periodo de tiempo: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Count of novel candidate disease genes or regulatory elements identified by integrated multi-omics analysis. List of enriched KEGG pathways and GO terms (with FDR < 0.05) associated with fetal developmental abnormalities.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)

Medidas de resultado secundarias

Medidas de resultado secundarias

En el protocolo de un estudio clínico, una medida de resultado planificada que no es tan importante como la medida de resultado primaria para evaluar el efecto de una intervención pero que sigue siendo de interés. La mayoría de los estudios clínicos tienen más de una medida de resultado secundaria.
Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Phenotypic stratification system and gene pathway enrichment results
Periodo de tiempo: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Phenotypic classification system (based on organ/system involvement: isolated, multiple, syndromic). For each subtype: (1) count and frequency of pathogenic/likely pathogenic variants; (2) count of variant types (SNV, Indel, SV, CNV); (3) list of enriched KEGG pathways and GO terms with FDR < 0.05.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Reclassification rate of variants of uncertain significance (VUS) and impact on counseling decisions
Periodo de tiempo: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Proportion of VUS reclassified to pathogenic/likely pathogenic or benign/likely benign after multi-omics integration. Number of participants/families with altered genetic counseling or clinical decision-making (e.g., termination, prenatal intervention, postnatal follow-up plan) due to reclassification.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Establishment of a multicenter database and biobank
Periodo de tiempo: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
A unified, relational database containing de-identified clinical phenotypes, genotypes (WGS variants), multi-omics data (e.g., transcriptomic, epigenomic), and biospecimen inventory (e.g., DNA, RNA, plasma, tissue blocks) from participating centers. Database completion will be defined as ≥90% of expected participants with all required data types uploaded and quality-controlled. Biobank completion will be defined as ≥90% of expected biospecimens collected, processed, and stored with traceable metadata.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Standardized data submission and sharing protocols
Periodo de tiempo: At study completion (average 24 months after first participant enrollment)
Completion of a written protocol document (yes/no) covering sample submission, data formats, quality thresholds, reporting template (ACMG/AMP classification), clinical data dictionary, and de-identification rules, with sign-off obtained from all participating centers' principal investigators and data managers.
At study completion (average 24 months after first participant enrollment)

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Patrocinador

Patrocinador

La organización o persona que inicia el estudio y que tiene autoridad y control sobre el estudio.
Women's Hospital School Of Medicine Zhejiang University

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

Inicio del estudio

La fecha real en la que el primer participante se inscribió en un estudio clínico. La fecha de inicio "anticipada" del estudio es la fecha que los investigadores creen que será la fecha de inicio del estudio.
12 de marzo de 2026

Finalización primaria (Estimado)

Finalización primaria

La fecha en la que el último participante en un estudio clínico fue examinado o recibió una intervención para recopilar datos finales para la medida de resultado primaria. Si el estudio clínico terminó de acuerdo con el protocolo o se terminó, no afecta esta fecha. Para estudios clínicos con más de una medida de resultado primaria con diferentes fechas de finalización, este término se refiere a la fecha en que se completa la recopilación de datos para todas las medidas de resultado primarias. La fecha de finalización principal "anticipada" es la fecha que los investigadores creen que será la fecha de finalización principal del estudio.
12 de septiembre de 2027

Finalización del estudio (Estimado)

Finalización del estudio

La fecha en la que el último participante en un estudio clínico fue examinado o recibió una intervención/tratamiento para recopilar los datos finales de las medidas de resultado primarias, las medidas de resultado secundarias y los eventos adversos (es decir, la última visita del último participante). La fecha de finalización "anticipada" del estudio es la fecha que los investigadores creen que será la fecha de finalización del estudio.
12 de marzo de 2028

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

Enviado por primera vez

La fecha en la que el patrocinador o investigador del estudio envió por primera vez un registro del estudio a ClinicalTrials.gov. Por lo general, hay un retraso de unos días entre la primera fecha de envío y la disponibilidad del registro en ClinicalTrials.gov (la primera fecha publicada).
9 de abril de 2026

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

La fecha en la que el patrocinador del estudio o el investigador envía por primera vez un registro del estudio que es consistente con los criterios de revisión de control de calidad (QC) de la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM). Es posible que el patrocinador o el investigador deba revisar y enviar un registro de estudio una o más veces antes de que se cumplan los criterios de revisión de control de calidad de la NLM. Es responsabilidad del patrocinador o investigador asegurarse de que el registro del estudio sea coherente con los criterios de revisión de control de calidad de la NLM.
20 de mayo de 2026

Publicado por primera vez (Actual)

Publicado por primera vez

La fecha en la que el registro del estudio estuvo disponible por primera vez en ClinicalTrials.gov después de que concluyó la revisión de control de calidad (QC) de la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM). Por lo general, hay una demora de unos días entre la fecha en que el patrocinador del estudio o el investigador envió el registro del estudio y la primera fecha publicada.
26 de mayo de 2026

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

Última actualización publicada

La fecha más reciente en la que se pusieron a disposición los cambios en un registro del estudio en ClinicalTrials.gov. Puede haber una demora entre el momento en que el patrocinador o el investigador del estudio envió los cambios a ClinicalTrials.gov (la fecha de envío de la última actualización) y la fecha de publicación de la última actualización.
26 de mayo de 2026

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

La fecha más reciente en la que el patrocinador del estudio o el investigador presentó cambios en un registro del estudio que son consistentes con los criterios de revisión de control de calidad (QC) de la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM). Es responsabilidad del patrocinador o investigador asegurarse de que el registro del estudio sea coherente con los criterios de revisión de control de calidad de la NLM.
20 de mayo de 2026

Última verificación

Última verificación

La fecha más reciente en la que el patrocinador o investigador del estudio confirmó que la información sobre un estudio clínico en ClinicalTrials.gov es precisa y actual. Si un estudio con un estado de reclutamiento de reclutamiento; aún no está reclutando; o activo, no se ha confirmado el reclutamiento en los últimos 2 años, el estado de reclutamiento del estudio se muestra como desconocido.
1 de marzo de 2026

Más información

Términos relacionados con este estudio

Términos MeSH relevantes adicionales

Otros números de identificación del estudio

Otros números de identificación del estudio

Identificadores o números de identificación distintos del número NCT que el patrocinador del estudio, los financiadores u otros asignan a un estudio clínico. Estos números pueden incluir identificadores únicos de otros registros de ensayos y números de subvención de los Institutos Nacionales de Salud.
  • IRB-20260095-R

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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