Biomarkkerien tutkiminen näytteistä nuoremmilta potilailta, joilla on pahanlaatuisen sukusolukasvaimen eteneminen
Pahanlaatuisten sukusolukasvainten etenemisen genomiset allekirjoitukset: Retrospektiivinen tutkimus talletetuista näytteistä
PERUSTELUT: Syöpää sairastavien potilaiden veri- ja kudosnäytteiden tutkiminen laboratoriossa voi auttaa lääkäreitä oppimaan lisää DNA:ssa tapahtuvista muutoksista ja tunnistamaan syöpään liittyviä biomarkkereita. Se voi myös auttaa lääkäreitä löytämään parempia tapoja hoitaa syöpää.
TARKOITUS: Tämä tutkimustutkimus tutkii näytteitä nuoremmista potilaista, joilla on pahanlaatuinen sukusolukasvaimen eteneminen.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tila
Ehdot
Ehdot
Interventio / Hoito
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
TAVOITTEET:
- Tutki tuumorien välistä heterogeenisyyttä DNA-metylaatiossa kasvaimen histologian avulla.
- Määritä kasvainten genominen metylaatiokuvio.
- Korreloi metylaatiokuvio kasvaimen histologian ja kliinisten ominaisuuksien kanssa.
- Suorita eksomien sieppaus ja massiivinen rinnakkaissekvensointi valituille sukusolukasvaimille (GCT) ja vastaavalle normaalille kudokselle.
- Suorita exome-kaappaus ja Solexa-sekvensointi valitulle GCT-joukolle.
- Vahvista ehdokasmutaatiot itsenäisessä kasvainjoukossa.
- Määritä mRNA:iden, lincRNA:iden ja mikroRNA:iden ilmentymisprofiili kasvaimissa käyttämällä RNA Seq.
YHTEENVETO: Arkistoiduista veri- ja kasvainkudosnäytteistä analysoidaan genominen metylaatiomalli, eksomin sieppaus ja sekvensointi sekä ehdokasmutaatiot metylaatiospesifisillä PCR-tekniikoilla, yhden nukleotidin polymorfismin (SNP) järjestelmillä ja Solexa-sekvensointimenetelmillä. Tulokset validoidaan käyttämällä pyrosekvensointimäärityksiä ja alukepidennysmäärityksiä. Metylaatiokuvio liittyy myös kunkin potilaan kasvaimen histologiaan ja kliinisiin tietoihin.
Opintotyyppi
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Ilmoittautuminen
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
TAUDEN OMINAISUUDET:
- Kasvain- ja verinäytteet potilailta, jotka on rekisteröity Children Oncology Groupin (COG) sukusolukasvainten protokolliin, ja muista tutkimuspaikoista, jotka on otettu ei-COG-potilaille, mukaan lukien Children's Medical Center, Dallas ja Dana-Farber Cancer Institute, Boston
- Potilaiden kliiniset tiedot
POTILAS OMINAISUUDET:
- Ei määritelty
EDELLINEN SAMANAIKAINEN HOITO:
- Ei määritelty
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
|---|
|
Tapahtumaton selviytyminen
|
|
GCTS:ään liittyvät genomiset prognostiset allekirjoitukset
|
|
GCTS-patogeneesiä edistävät geneettiset variantit
|
|
RNA:n eri muotojen ilmentyminen
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: James F. Amatruda, MD, PhD, Simmons Cancer Center
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Ensimmäinen Lähetetty
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)
Viimeisin päivitys julkaistu
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
Muut tutkimustunnusnumerot
- AGCT11B2 (Muu tunniste: Children's Oncology Group)
- COG-AGCT11B2 (Muu tunniste: Children's Oncology Group)
- NCI-2011-03456 (Rekisterin tunniste: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .