UCSF:n genomiavokeskuksen biopankki ja rekisteri
UCSF:n genomiikirurgian keskuksen biopankki ja rekisteri
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tila
Ehdot
Ehdot
Opintotyyppi
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Ilmoittautuminen
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
Opiskeluyhteys
- Nimi: Emma Canepa
- Puhelinnumero: (415) 476-7255
- Sähköposti: Emma.Canepa@ucsf.edu
Opiskelupaikat
-
-
California
-
San Francisco, California, Yhdysvallat, 94143
- Rekrytointi
- University of California, San Francisco
-
Ottaa yhteyttä:
- Emma Canepa
- Puhelinnumero: 415-476-7255
- Sähköposti: Emma.Canepa@ucsf.edu
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Ottamiskriteerit:
Alustava seulonta ja keskustelu huddle-puhelussa:
- Mies- ja naisyksilöt kaiken ikäisiä, mukaan lukien raskaana olevat naiset ja heidän sikiönsä missä tahansa raskauden vaiheessa.
- Itse lähetetyt tai terveydenhuollon tarjoajan kautta lähetetyt UCSF:n genomiakirurgian keskuksen/interventiivisen genomian hallituksen (IGB) luo tilaan, joka on geneettinen tai jonka oletetaan olevan geneettistä alkuperää.
- UCSF:n potilas TAI suostuu sallimaan tapauksensa esittämisen IGB:n huddle-tapaamisessa.
Rekisteröitymiseen tai biopankkiin:
- Mikä tahansa yllä mainituista osallistujista, joiden IGB katsoo sopiviksi tämän pöytäkirjan rekisteriin ja biopankkiosioon liittymiseen TAI mikä tahansa rekisteriin ja biopankkiosioon liitetyn henkilön mies- tai naissukulainen kaiken ikäisiä.
- Antaa tietoon perustuvan suostumuksen osallistumiseen pöytäkirjan rekisteriin ja biopankkiosioon.
Poissulkemiskriteerit:
Alustava seulonta ja keskustelu huddle-puhelussa:
- Yksilöt, joista IGB on aiemmin keskustellut ja päättänyt, etteivät he sovellu siirtymään pöytäkirjan rekisteriin ja biopankkiosioon, ellei heidän tapaukseensa liittyvät uudet tiedot muuta alkuperäistä arviota.
- Yksilöt, joita geneettinen tai oletettu geneettinen tila ei koske.
Rekisteröitymiseen tai biopankkiin:
-Mikä tahansa osallistuja, jonka IGB katsoo sopimattomaksi tämän pöytäkirjan rekisteriin ja biopankkiosioon liittymiseen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Ryhmien/kohorttien lukumäärä
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/KohorttiRyhmä/Kohortti |
|---|
|
Genomikirurgian keskuksen tapausesittelykeskustelu
|
|
Rekisteriin ja biopankkiin ilmoittautuminen
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Paranna ymmärrystämme siitä, miten tietyt mutaatiot johtavat toimintahäiriöihin ja aiheuttavat sairauksia
Aikaikkuna: Enintään 25 vuotta
|
Enintään 25 vuotta
|
|
Empirisesti arvioida yksittäisten osallistujien genomisten varianttien käyttökelpoisuutta in silico -menetelmin ja potilasperäisissä soluissa räätälöityjen genomisten terapioiden tarkoituksiin.
Aikaikkuna: Enintään 25 vuotta
|
Enintään 25 vuotta
|
Muut tulostoimenpiteet
Muut tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Tukea geeniterapioiden kliinisiä tutkimuksia, jotka ovat osallistujakohtaisia
Aikaikkuna: Enintään 25 vuotta
|
Enintään 25 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Sponsori
Tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Tippi Mackenzie, MD, University of California, San Francisco
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Tsai SQ, Zheng Z, Nguyen NT, Liebers M, Topkar VV, Thapar V, Wyvekens N, Khayter C, Iafrate AJ, Le LP, Aryee MJ, Joung JK. GUIDE-seq enables genome-wide profiling of off-target cleavage by CRISPR-Cas nucleases. Nat Biotechnol. 2015 Feb;33(2):187-197. doi: 10.1038/nbt.3117. Epub 2014 Dec 16.
- Lazzarotto CR, Malinin NL, Li Y, Zhang R, Yang Y, Lee G, Cowley E, He Y, Lan X, Jividen K, Katta V, Kolmakova NG, Petersen CT, Qi Q, Strelcov E, Maragh S, Krenciute G, Ma J, Cheng Y, Tsai SQ. CHANGE-seq reveals genetic and epigenetic effects on CRISPR-Cas9 genome-wide activity. Nat Biotechnol. 2020 Nov;38(11):1317-1327. doi: 10.1038/s41587-020-0555-7. Epub 2020 Jun 15.
- Ioannidis NM, Rothstein JH, Pejaver V, Middha S, McDonnell SK, Baheti S, Musolf A, Li Q, Holzinger E, Karyadi D, Cannon-Albright LA, Teerlink CC, Stanford JL, Isaacs WB, Xu J, Cooney KA, Lange EM, Schleutker J, Carpten JD, Powell IJ, Cussenot O, Cancel-Tassin G, Giles GG, MacInnis RJ, Maier C, Hsieh CL, Wiklund F, Catalona WJ, Foulkes WD, Mandal D, Eeles RA, Kote-Jarai Z, Bustamante CD, Schaid DJ, Hastie T, Ostrander EA, Bailey-Wilson JE, Radivojac P, Thibodeau SN, Whittemore AS, Sieh W. REVEL: An Ensemble Method for Predicting the Pathogenicity of Rare Missense Variants. Am J Hum Genet. 2016 Oct 6;99(4):877-885. doi: 10.1016/j.ajhg.2016.08.016. Epub 2016 Sep 22.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Ensimmäinen Lähetetty
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin päivitys julkaistu
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muut tutkimustunnusnumerot
Muut tutkimustunnusnumerot
- UCSF_CGS_Biobank_Registry
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .