Hypertension erottelu-/yhteysanalyysi

TAUSTA:

Verenpainetaudin geneettisen komponentin luonteesta on olemassa kaksi yleistä hypoteesia. Yksittäinen geenihypoteesi visualisoi kohonneen verenpaineen spesifisenä sairauskokonaisuutena, jonka määrittää autosomaalisesti hallitseva tai epätäydellisesti hallitseva alleeli, jolla on vähän ympäristövaikutuksia. Polygeenisen hypoteesin mukaan verenpainetauti määräytyy useiden geneettisten ja ympäristötekijöiden perusteella, jotka toimivat itsenäisesti suunnilleen yhtä suurella panoksella. Todisteet, jotka tukevat yhden geenin hypoteesia, perustuvat ensisijaisesti verenpaineen bimodaaliseen ja trimodaaliseen jakautumiseen väestössä. On ehdotettu, että bimodaaliset tai trimodaaliset jakaumat ovat seurausta varmistusharhasta. Polygeenistä mallia tukeva näyttö perustuu useisiin tutkimuksiin, joissa verenpaineen jakautuminen on unimodaalinen ja usein vinoutunut korkeampiin arvoihin sekä verenpainepotilaiden populaatiossa että ensimmäisen asteen sukulaisissa. Nämä vääristyneet jakaumat voidaan likimäärin normalisoida käyttämällä log-muunnoksia.

Tässä tutkimuksessa pyrittiin erityisesti havaitsemaan tärkeimmät geenit. Päägeenin sanotaan olevan tietyssä näytteessä, jos huomattava määrä ominaisuuden vaihtelua kyseisessä näytteessä johtuu alleelien segregaatiosta yhdessä lokuksessa. Päägeenin läsnäolo ei sulje pois muiden geneettisten tai ympäristövaikutusten olemassaoloa. Viimeisen vuosikymmenen aikana on ehdotettu kolmea yleistä mallia päägeenin havaitsemiseksi. Siirtymistodennäköisyysmalli on yleinen sukutaulutietojen geneettisen analyysin malli, joka testaa Mendelin erottelusuhteita ja on yleistys perinteisistä segregaatioanalyysimenetelmistä. Tällä mallilla on vähän kykyä erottaa yksittäinen geeni ja polygeeninen perinnöllisyys, vaikka se saattaa pystyä havaitsemaan jonkinlaisia ​​ei-yksittäisen geenin siirtymiä. Tätä menetelmää on laajennettu mahdollistamaan monimuuttujien ominaisuuksien analysointi, useiden tartuntatapoja koskevien hypoteesien testaaminen ja erilaiset varmistuskorjaukset. Tärkeimmät tällä mallilla tunnistetut geenit ovat hyperkolesterolemia, dopamiini-beeta-hydroksylaasi ja katekoli-o-metyylitransferaasi.

Sekoitettu malli sisältää sekä yhden lokuksen että usean lokuksen komponentin, ja se on suunniteltu erottamaan nämä kaksi. Malli olettaa, että kaikki siirtyminen sukupolvelta toiselle, jota ei voida selittää klassisella polygeenisellä perinnöllä, johtuu alleelien erottelusta yhdessä lokuksessa. Se on ihanteellinen päägeenin havaitsemiseen polygeenisen perinnön läsnä ollessa, edellyttäen, että muuta siirtotyyppiä ei tapahdu. Tätä mallia on laajennettu sisältämään sisarusten välisen ympäristökorrelaation. Tärkeimmät tällä mallilla tunnistetut lokukset ovat PTC, IgE ja synnynnäinen glaukooma. Yhdistetty malli on sekamalli, jossa yksittäinen lokuskomponentti on parametroitu lähetystodennäköisyyksien suhteen, ja se on kahden edellisen mallin yhdistelmä. Useat tutkimusryhmät ovat kehittäneet menetelmiä tämän yhdistetyn mallin esittämien laskennallisten vaikeuksien voittamiseksi.

SUUNNITTELUN KARRATIIVINEN:

Tutkimus jakautui kahteen osaan, metodologioiden analyysiin ja menetelmien soveltamiseen verenpainetaudin geneettisessä analyysissä. Tutkimuksen ensimmäisessä osassa tarkasteltiin kolmen segregaatio- ja kytkentäanalyysin geneettisen mallin tehoa, robustisuutta ja validiteettia: transmissiotodennäköisyysmalli; sekoitettu malli; ja yhtenäinen malli, joka oli myös sekamalli, jossa yksittäinen lokuskomponentti oli parametroitu lähetystodennäköisyyksien suhteen. Tyydyttävimmiksi havaittuja erottelu- ja kytkentäanalyysimenetelmiä sovellettiin sitten viiden suuren sukupuun tietojen analysointiin yhteistyössä Wright State Universityn kanssa ja kymmenen suuren sukupuun analysointiin osana Bogalusa Heart -tutkimusta. Päätettiin suurperheiden jakamisen ydinperheiksi ja näiden ydinperheiden erottelun ja kytkemisen vaikutuksista.

Tässä tietueessa mainittu tutkimuksen päättymispäivämäärä on saatu "Päättymispäivämäärästä", joka on syötetty PRS-tietueeseen.