Emättimen, istukan ja vastasyntyneen bukkaalinen mykobiota ja mikrobiomi ennenaikaisessa synnytyksessä
Emättimen, istukan ja vastasyntyneen mykobiootan sekä mikrobiomin ja ennenaikaisen synnytyksen välisen suhteen arviointi naisilla, joilla on lyhyt kohdunkaulan pituus
Mikrobiota edistää isännän immunologista, hormonaalista ja metabolista homeostaasia. Kuten kaikissa kehon luonnollisissa aukoissa, on myös emättimelle ominaista mikrobiota ja mykobioota.
Toisaalta sonografinen lyhyt kohdunkaula raskauden toisella kolmanneksella liittyy ennenaikaiseen synnytykseen, joka voi olla tärkeä kuolleisuuden ja sairastuvuuden syy vastasyntyneellä. American Society of Obstetricians and Gynecologists (ACOG), British Royal Society of Obstetricians and Gynecologists (RCOG) ja American Society of Maternal Fetal Medicine (SMFM) ehdottavat, että transvaginaalisen sonografisen kohdunkaulan pituuden mittaaminen 20–24 raskausviikolla ennenaikainen synnytys. Edellä mainitut yhdistykset suosittelevat myös progesteronin käyttöä sellaisten naisten hoidossa, joille transvaginaalisessa ultraäänitutkimuksessa on diagnosoitu lyhyt kohdunkaula, koska progesteroni on tehokas lääke ennenaikaisen synnytyksen ehkäisyssä (luokka B).
Aiemmat emättimen mikrobistotutkimukset ovat osoittaneet, että jotkin bakteerilajit, kuten Lactobacillus insersit, aiheuttavat taipumuksen ennenaikaiseen synnytykseen naisilla, joilla on lyhyt kohdunkaula. Näissä tutkimuksissa havaittava puute on kuitenkin se, että eukaryoottisia sieniä runsaassa emättimen kasvistossa ei ole arvioitu.
Toisaalta on jo osoitettu, että progesteronihoito pystyy estämään vain 45 % ennenaikaisen synnytyksen naisilla, joilla on lyhyt kohdunkaulan pituus. Tämän havainnoivan prospektiivisen tutkimuksen tavoitteena on siis arvioida mikrobiston ja/tai mykobiootan vaihtelua ennenaikaiseen synnytykseen johtavissa raskauksissa ja niillä, jotka synnyttävät keskeneräisinä. Vaikka naiset, joilla on lyhyt kohdunkaulan pituus, saavat progesteronia säännöllisesti toisesta raskauskolmanneksesta lähtien, ennenaikainen synnytys voi tapahtua. Tässä tutkimuksessa tutkijat pyrkivät myös arvioimaan mikrobiotan ja mykobiootan kuvioita emättimestä otetuista vanupuikoista naisilta, jotka ovat synnyttäneet lyhyen kohdunkaulan pituuden ja synnytyksen jälkeisiä vanupuikkoja istukasta ja sikiön suuontelosta.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Ennenaikainen synnytys on vastuussa yli 70 % kaikista vastasyntyneiden ja vastasyntyneiden kuolemista. Lisäksi keskosina syntyneiden lasten aivohalvauksen riski on 10 kertaa suurempi kuin ennenaikaisesti syntyneillä. Ennenaikaisen synnytyksen riski on kääntäen verrannollinen kohdunkaulan pituuteen keskiasennossa. Satunnaistetut kontrolloidut tutkimukset, joissa oli mukana yksittäisiä raskauksia, joiden kohdunkaulan pituus on lyhyt (alle 25 mm), ovat osoittaneet, että progesteronin profylaktinen käyttö vähentää merkittävästi ennenaikaisten synnytysten ja vastasyntyneiden kuoleman määrää. Emättimen micobiotan suhde ennenaikaiseen synnytykseen on dokumentoitu. Lyhyen kohdunkaulan pituuden ja progesteronihoidon vaikutusta emättimen, vastasyntyneen ja istukan mikrobiotaan ja mykobiotaan ei ole kuitenkaan arvioitu. Tämän tutkimuksen tavoitteena on käsitellä seuraavia asioita;
- Pitkittäinen äidin (emättimen), sikiön (suun) ja istukan (tyvilevy ja parenkyymi) 16S-pohjainen ja 18S-pohjainen metagenominen profilointi päätellyllä metagenomiikalla paljastaa selkeitä mikrobiyhteisöjä ennenaikaisen synnytyksen yhteydessä.
- Emättimen, vastasyntyneen (bukkaali) ja istukan (tyvilevy ja parenkyyma) 16s-rRNA:n ja sienten ja 18s-rRNA:n vertailu raskaana olevilla naisilla, joilla on lyhyt kohdunkaulan pituus, ja niillä, joilla on normaali kohdunkaulan pituus;
2. Äidin (emättimen), vastasyntyneen (suun) ja istukan (tyvilevy ja parenkyymi)16s-rRNA:n ja sienten ja 18s-rRNA:n vertailu raskauden aikana lyhyen kohdunkaulan pituuden omaavilla naisilla ennenaikaisesti synnyttäneisiin; 3. Progesteronin vaikutus äidin (emättimen), vastasyntyneen (bukkaali) ja istukan (tyvilevy ja parenkyymi)16s-rRNA:han bakteereilla ja 18s-rRNA:han sienillä.
Kohdunkaulan pituuden mittaukset tehdään kahdessa eri raskausjaksossa (11-14 ja 18-22 raskausviikkoa) yksittäisraskauksissa. Ensinnäkin emättimen pyyhkäisynäytteet otetaan naisilta, jotka suostuvat osallistumaan tutkimukseen 11-14 raskausviikolla juuri ennen kohdunkaulan pituuden mittaamista. Myös emättimen pyyhkäisynäytteet otetaan uudelleen 18-22 raskausviikolla, kuten edellä on selitetty. Mikronisoitu progesteroni aloitetaan naisilla, joiden kohdunkaulan pituus on enintään 25 mm (pienempi kuin 3. prosenttipiste) 18-22 raskausviikolla. Lääke (progesteroni 200 mg) annetaan intravaginaalisesti joka ilta ennen nukkumaanmenoa ja sitä jatketaan 36. raskausviikkoon asti, ellei potilas synny. Kohdunkaulan pituuden mittaus toistetaan transvaginaalisesti 28. ja 32. raskausviikolla, ja näytteet otetaan kohdunkaulan vanupuikolla ennen näitä mittauksia. Istukan mykobiootan ja mikrobiotan esiintymisen arvioimiseksi otetaan 1 cm x 1 cm x 1 cm kudosnäytettä istukasta, joka on 3 cm:n etäisyydellä napanuoran lisäyksestä steriileissä olosuhteissa syntymän jälkeen. Lapsivesitilan arvioimiseksi vastasyntyneiltä otetaan posken limakalvopuikko välittömästi syntymän jälkeen. Kaikki näytteet toimitetaan välittömästi tutkimuslaboratorioimme ja säilytetään -80 ℃ kaapissa arviointiin asti. V3-V4-alueet 16s ribosomaalisen RNA:n sekvensointimenetelmällä sekvensoidaan Illumina MiSeq -laitteella ja tiedot analysoidaan Human Microbiome Projectissa standardoitujen protokollien mukaisesti.
DNA-näytteet, jotka luokitellaan ITS1-alueen metabiotaprotokollan mukaisesti sekvensoitavista tiedoista, arvioidaan Human Microbiome Projectissa.
Positiivisina kontrolleina käytetään Pseudomonas-, Escherichia-, Neisseria-, Streptococcus-, Lactobacillus-, Candida-, Actinomyces- ja V3-V4- ja ITS-alueita bakteeri- ja sienimikrobistolle. Kun amplikonien "toiminnalliset taksonomiset yksiköt" on konfiguroitu VSEARCH-ohjelmalla, analyysit suoritetaan GENBANKin mikrobiota- ja mikobiotatiedoilla.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Ebru Celik, M.D.
- Puhelinnumero: 21654 +90 850 250 8 250
- Sähköposti: ecelik@ku.edu.tr
Opiskelupaikat
-
-
-
Istanbul, Turkki, 34010
- Rekrytointi
- Koc University Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Ebru Celik, M.D.
- Puhelinnumero: +905326035151
- Sähköposti: ecelik@ku.edu.tr
-
Ottaa yhteyttä:
- Mert Turgal, M.D.
- Sähköposti: mturgal@kuh.ku.edu.tr
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Yksittäiset raskaudet
- Tutkittava on vapaaehtoisesti allekirjoittanut Ilmoitettu suostumuslomakkeen ja siihen liittyvät lomakkeet saatuaan sisällön selityksen
Poissulkemiskriteerit:
- Useita raskauksia
- Suuren sikiön poikkeavuuden tai tunnetun kromosomipoikkeavuuden esiintyminen
- Kohdunsisäisen sikiön kuoleman löytäminen
- Antibiootti- ja/tai sienilääkekäyttö kahden viikon sisällä näytteiden oton yhteydessä
- Alle 18-vuotiaat raskaana olevat naiset
- Naiset, joilla on aikaisempi kohdunkaulan leikkaus
- Naiset, jotka eivät suostu osallistumaan tutkimukseen
- Kohdun poikkeaman esiintyminen
- Naiset, joilla on emättimen verenvuotoa kohdunkaulan näytteiden ottamisen yhteydessä
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Termi Syntymä
Toimitus 37-41 raskausviikon välillä
|
Emättimen, vastasyntyneen bukkaalin ja istukan mikrobiomin ja mykobiootan analyysi
|
|
Ennenaikainen synnytys
Toimitus 24-37 raskausviikolla
|
Emättimen, vastasyntyneen bukkaalin ja istukan mikrobiomin ja mykobiootan analyysi
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Äidin ja sikiön mikrobiomin ja mykobiomin karakterisointi
Aikaikkuna: 11 raskausviikkoa synnytyspäivään
|
Luonnehdi äidin (emättimen), istukan ja vastasyntyneen (suun) mikrobiomia ja mykobiomia kohortissa, jossa on ennenaikaisen syntymän riski, käyttämällä BIO Power Soil DNA Isolation -sarjaa.
Tutkijat pystyvät arvioimaan, onko mikrobiomin ja mykobiomin muutosten välillä yhteyttä ennenaikaiseen synnytykseen.
V3-V4-alueet 16s rRNA:n ja ITS-alueet 18s rRNA:n sekvensointimenetelmällä sekvensoidaan.
Kun amplikonien "toiminnalliset taksonomiset yksiköt" on konfiguroitu VSEARCH-ohjelmalla, analyysit suoritetaan GENBANKin mikrobiota- ja mikobiotatiedoilla.
|
11 raskausviikkoa synnytyspäivään
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Progesteronin vaikutus äidin mikrobiomiin (emätin ja istukka) progesteronin kanssa
Aikaikkuna: 11 raskausviikkoa synnytyspäivään
|
Kuvaile äidin, istukan ja vastasyntyneen mikrobiomia kohortissa, jossa on progesteronihoitoa saava ennenaikainen syntymä.
Kaikki naiset eivät lopulta synnytä ajoissa huolimatta progesteronin profylaktisesta hoidosta; BIO Power Soil DNA Isolation -sarjan avulla tutkijat voivat nähdä, onko ennenaikaiseen synnytykseen liittyviä mikrobiomimuutoksia.
Pystymme arvioimaan, onko mikrobiomin ja mykobiomin muutosten välillä yhteyttä ennenaikaiseen synnytykseen.
V3-V4-alueet 16s rRNA:n ja ITS-alueet 18s rRNA:n sekvensointimenetelmällä sekvensoidaan.
Kun amplikonien "toiminnalliset taksonomiset yksiköt" on konfiguroitu VSEARCH-ohjelmalla, analyysit suoritetaan GENBANKin mikrobiota- ja mikobiotatiedoilla.
|
11 raskausviikkoa synnytyspäivään
|
|
Erilaisia mikrobi- ja mykobisormenjälkiä
Aikaikkuna: 11 raskausviikkoa synnytyspäivään
|
Emättimen, vastasyntyneen bukkaalin ja istukan 16S-rRNA- ja 18S-rRNA-geenisekvensoinnin vertailu ennenaikaisesti synnyttävien naisten välillä, joilla on lyhyt kohdunkaula.
|
11 raskausviikkoa synnytyspäivään
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Opintojohtaja: Ebru Celik, M.D., Koc University
- Opintojohtaja: Fusun Can, M.D., Koç University School of Medicine
- Päätutkija: Mert Turgal, M.D., Koç University School of Medicine
- Päätutkija: Ozlem Dogan, M.D., Koç University School of Medicine
- Päätutkija: Mehmet Gonen, P.h.D, Koç University School of Medicine
- Päätutkija: Tugba Gursoy, M.D., Koç University School of Medicine
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Iams JD, Goldenberg RL, Meis PJ, Mercer BM, Moawad A, Das A, Thom E, McNellis D, Copper RL, Johnson F, Roberts JM. The length of the cervix and the risk of spontaneous premature delivery. National Institute of Child Health and Human Development Maternal Fetal Medicine Unit Network. N Engl J Med. 1996 Feb 29;334(9):567-72. doi: 10.1056/NEJM199602293340904.
- American College of Obstetricians and Gynecologists' Committee on Practice Bulletins-Obstetrics. Practice Bulletin No. 171: Management of Preterm Labor. Obstet Gynecol. 2016 Oct;128(4):e155-64. doi: 10.1097/AOG.0000000000001711.
- Aagaard K, Ma J, Antony KM, Ganu R, Petrosino J, Versalovic J. The placenta harbors a unique microbiome. Sci Transl Med. 2014 May 21;6(237):237ra65. doi: 10.1126/scitranslmed.3008599.
- DiGiulio DB, Romero R, Amogan HP, Kusanovic JP, Bik EM, Gotsch F, Kim CJ, Erez O, Edwin S, Relman DA. Microbial prevalence, diversity and abundance in amniotic fluid during preterm labor: a molecular and culture-based investigation. PLoS One. 2008 Aug 26;3(8):e3056. doi: 10.1371/journal.pone.0003056.
- Gardella C, Riley DE, Hitti J, Agnew K, Krieger JN, Eschenbach D. Identification and sequencing of bacterial rDNAs in culture-negative amniotic fluid from women in premature labor. Am J Perinatol. 2004 Aug;21(6):319-23. doi: 10.1055/s-2004-831884.
- Han YW, Shen T, Chung P, Buhimschi IA, Buhimschi CS. Uncultivated bacteria as etiologic agents of intra-amniotic inflammation leading to preterm birth. J Clin Microbiol. 2009 Jan;47(1):38-47. doi: 10.1128/JCM.01206-08. Epub 2008 Oct 29.
- Kindinger LM, Bennett PR, Lee YS, Marchesi JR, Smith A, Cacciatore S, Holmes E, Nicholson JK, Teoh TG, MacIntyre DA. The interaction between vaginal microbiota, cervical length, and vaginal progesterone treatment for preterm birth risk. Microbiome. 2017 Jan 19;5(1):6. doi: 10.1186/s40168-016-0223-9.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM). Electronic address: pubs@smfm.org, McIntosh J, Feltovich H, Berghella V, Manuck T. The role of routine cervical length screening in selected high- and low-risk women for preterm birth prevention. Am J Obstet Gynecol. 2016 Sep;215(3):B2-7. doi: 10.1016/j.ajog.2016.04.027. Epub 2016 Apr 28.
- Romero R, Nicolaides KH, Conde-Agudelo A, O'Brien JM, Cetingoz E, Da Fonseca E, Creasy GW, Hassan SS. Vaginal progesterone decreases preterm birth </= 34 weeks of gestation in women with a singleton pregnancy and a short cervix: an updated meta-analysis including data from the OPPTIMUM study. Ultrasound Obstet Gynecol. 2016 Sep;48(3):308-17. doi: 10.1002/uog.15953. Epub 2016 Jul 19.
- DiGiulio DB, Romero R, Kusanovic JP, Gomez R, Kim CJ, Seok KS, Gotsch F, Mazaki-Tovi S, Vaisbuch E, Sanders K, Bik EM, Chaiworapongsa T, Oyarzun E, Relman DA. Prevalence and diversity of microbes in the amniotic fluid, the fetal inflammatory response, and pregnancy outcome in women with preterm pre-labor rupture of membranes. Am J Reprod Immunol. 2010 Jul 1;64(1):38-57. doi: 10.1111/j.1600-0897.2010.00830.x. Epub 2010 Mar 21.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 119S463
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
IPD-jaon aikakehys
IPD-jaon käyttöoikeuskriteerit
IPD-jakamista tukeva tietotyyppi
- Tutkimuspöytäkirja
- Ilmoitettu suostumuslomake (ICF)
- Kliinisen tutkimuksen raportti (CSR)
- Analyyttinen koodi
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .