Yksisoluinen sekvensointi ja mallien luominen neuroendokriiniseen kasvaimeen
Yksisoluinen sekvensointi ja solulinjojen, organoidien ja siirrettyjen kasvainmallien muodostaminen neuroendokriinisessa kasvaimessa
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Neuroendokriininen kasvain (NEN) viittaa yleensä kaikkiin kasvaimiin, jotka ovat peräisin peptidergisistä hermosoluista ja neuroendokriinisista soluista. Se on suhteellisen harvinainen kasvain, joka vaihtelee laihoista, hitaasti kasvavista matala-asteisista pahanlaatuisista kasvaimista ilmeisiin etäpesäkkeisiin. Sarja pahanlaatuisia kasvaimia. Yleisin neuroendokriinisten kasvainten paikka on ruoansulatusjärjestelmässä, ja noin kaksi kolmasosaa neuroendokriinisista kasvaimista esiintyy maha-suolikanavan haimassa. Kuitenkin ihmisten elintapojen muutoksen ja fyysisen tarkastustietoisuuden parantuessa neuroendokriinisten kasvainten ilmaantuvuus nousi vuoden 1973 1,09/100 000:sta 6,98/100 000:een vuonna 2012. Ilmaantuvuus on lisääntynyt 6 kertaa muihin kasvaimiin verrattuna. , NEN:t lisääntyvät nopeammin. Yli 65-vuotiaiden ilmaantuvuus on lisääntynyt 8-kertaiseksi ja myös alle 50-vuotiaiden ilmaantuvuus on kolminkertaistunut ja ilmaantuvuus on kasvanut vuosi vuodelta. On syytä huomata, että haiman neuroendokriinisten kasvainten keski-ikä on vain 56,7-13,3 vuotta vanha, mikä osoittaa nuorempaa suuntausta.
Koska useimmilla neuroendokriinisilla kasvaimilla ei ole erityisiä ilmenemismuotoja ja ainutlaatuisia inerttejä biologisia ominaisuuksia, kliinikoilta puuttuu usein ymmärrystä, mikä voi helposti johtaa virheelliseen diagnoosiin ja hoitoon. Esimerkkinä maha-suolikanavan haiman neuroendokriiniset kasvaimet (GEP-NEN), epätasaisen diagnoosin ja hoitotason vuoksi GEP-NEN-potilaat voidaan diagnosoida jopa 7 vuoden viiveellä. Tästä johtuen jopa 40-95 %:lla GEP-NEN-potilaista on kehittynyt kaukaisia etäpesäkkeitä diagnoosihetkellä ja 65-95 %:lla maksametastaaseja. Maksametastaasi on GEP-NEN:n kriittisin prognostinen riskitekijä, ja sillä on ratkaiseva vaikutus potilaiden eloonjäämiseen. Ruoansulatuskanavan neuroendokriinisten kasvainten 5 vuoden eloonjäämisaste, joissa on maksaetäpesäkkeitä, on 56-83 %, kun taas haiman neuroendokriinisten kasvainten 5 vuoden eloonjäämisaste on vain 48,8 % ja 10 vuoden eloonjäämisaste on vain 30,2 %. Rajallisen vaiheen potilailla jopa 94 %:ssa tapauksista uusiutuminen ja metastasoituminen tapahtuu 5 vuoden sisällä, vaikka leikkaus olisikin tehty radikaalisti. Vaikka kemoterapiaa, kohdennettua hoitoa, biologista hoitoa ja muita menetelmiä voidaan käyttää leikkauskelvottomilla potilailla, vaikutus on edelleen rajallinen. Siksi neuroendokriinisten kasvainten perus-kliinisen translaatiotutkimuksen systemaattinen kehittäminen on erittäin tärkeää ja välitöntä.
Edellä mainittuihin ongelmiin perustuen tämän hankkeen tarkoituksena on suorittaa systemaattinen ja syvällinen neuroendokriinisten kasvaimien tutkimus: 1. Yksisolusekvensointiteknologian avulla tutkitaan syvällisesti NEN-kasvainten molekyylibiologisia ominaisuuksia, kasvainten heterogeenisuutta ja solualatyyppejä. 2. Rakenna NEN-malleja, mukaan lukien primaariset solulinjat, organoidit ja hiiren eläinmallit. Tällä tutkimuksella voidaan perustaa neuroendokriinisten kasvainten tutkimusjärjestelmä, jonka avulla voidaan löytää NEN:n uusiutumisen ja etäpesäkkeiden molekyylimekanismi ja mahdolliset interventiokohteet ja tarjota kliinikoille turvallisia ja tehokkaita hoitostrategioita, mikä parantaa neuroendokriinisten kasvainten terapeuttista vaikutusta.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Xianjun Yu, MD, PhD
- Puhelinnumero: +86-13801669875
- Sähköposti: yuxianjun@fudanpci.org
Opiskelupaikat
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Kiina, 200032
- Rekrytointi
- Department of Pancreatic Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center; Pancreatic Cancer Institute, Fudan University
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- 18–80-vuotiaat, minkä tahansa sukupuolen kanssa;
- Fyysisen kunnon pisteet ECOG 0～1 pistettä;
- Diagnoosin katsotaan olevan maha-suolikanavan haiman neuroendokriininen kasvain tai haiman duktaalinen adenokarsinooma;
- Leikkaukselle tai biopsialle ei ole ilmeisiä vasta-aiheita;
- Kompensoimaton maksakirroosi, akuutti ja krooninen hepatiitti ja muut sairaudet;
- Ei aiempia muita sappiteihin liittyviä sairauksia;
- Osallistu vapaaehtoiseksi ja allekirjoita tietoinen suostumuslomake. -
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaat, joilla ei ole maha-suolikanavan haiman neuroendokriinisia kasvaimia tai haiman tiehyen adenokarsinooma, joka on vahvistettu patologisesti;
- Kärsivät muista ruoansulatuskanavan sairauksista, kuten ärtyvän suolen oireyhtymästä, tulehduksellisesta suolistosairaudesta;
- Ne, joilla on puutteelliset seurantatiedot tai jotka kieltäytyvät hyväksymästä seurantaa;
- Potilaat, joilla on muita pahanlaatuisia kasvaimia tai hematologisia sairauksia; -
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Gastroenteropankreaattiset neuroendokriiniset kasvaimet
Kerää biopsia/kirurginen tuore kudos gastroenteropankreaattisista neuroendokriinisista kasvaimista.
|
Kerää NEN- ja PDAC-biopsia tai kirurginen tuore kudos suorittaaksesi yhden solun sekvensoinnin tai mallin rakentamisen.
|
|
Haiman duktaalinen adenokarsinooma
Kerää biopsia/kirurginen tuore kudos haiman kanavan adenokarsinoomasta.
|
Kerää NEN- ja PDAC-biopsia tai kirurginen tuore kudos suorittaaksesi yhden solun sekvensoinnin tai mallin rakentamisen.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Yksisolusekvensointitulosten bioinformatiikkaanalyysi
Aikaikkuna: Puoli vuotta
|
NEN-molekyylibiologian tietojen analyysi käyttämällä yksisolusekvensointitekniikkaa
|
Puoli vuotta
|
|
Mallin rakentaminen
Aikaikkuna: Yksi vuosi
|
Kerää tuoreita NEN-näytteitä primääristen solulinjojen viljelemiseksi, organoidien rakentamiseksi ja NEN-eläinmallien luomiseksi
|
Yksi vuosi
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
NEN-organoidin tutkiminen
Aikaikkuna: Yksi vuosi
|
Tutkia ja optimoida NEN-elimen keskipitkäkaaviota ja tyyppielinten histomorfologisen tunnistamisen menetelmiä
|
Yksi vuosi
|
|
Kasvaimen mikroympäristö
Aikaikkuna: Yksi vuosi
|
NEN:n kasvainmikroympäristö analysoitiin
|
Yksi vuosi
|
|
NEN:n ja PDAC:n mekanismin vertailu
Aikaikkuna: Puoli vuotta
|
Kerää tuoreita näytteitä haiman ductal adenokarsinoomasta (PDAC) yksisolusekvensointia ja organoidirakennetta varten NEN-vertailua varten
|
Puoli vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Xianjun Yu, MD, PhD, Fudan University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Yao JC, Hassan M, Phan A, Dagohoy C, Leary C, Mares JE, Abdalla EK, Fleming JB, Vauthey JN, Rashid A, Evans DB. One hundred years after "carcinoid": epidemiology of and prognostic factors for neuroendocrine tumors in 35,825 cases in the United States. J Clin Oncol. 2008 Jun 20;26(18):3063-72. doi: 10.1200/JCO.2007.15.4377.
- Modlin IM, Oberg K, Chung DC, Jensen RT, de Herder WW, Thakker RV, Caplin M, Delle Fave G, Kaltsas GA, Krenning EP, Moss SF, Nilsson O, Rindi G, Salazar R, Ruszniewski P, Sundin A. Gastroenteropancreatic neuroendocrine tumours. Lancet Oncol. 2008 Jan;9(1):61-72. doi: 10.1016/S1470-2045(07)70410-2.
- Pavel M, Baudin E, Couvelard A, Krenning E, Oberg K, Steinmuller T, Anlauf M, Wiedenmann B, Salazar R; Barcelona Consensus Conference participants. ENETS Consensus Guidelines for the management of patients with liver and other distant metastases from neuroendocrine neoplasms of foregut, midgut, hindgut, and unknown primary. Neuroendocrinology. 2012;95(2):157-76. doi: 10.1159/000335597. Epub 2012 Feb 15. No abstract available.
- Sato T, Vries RG, Snippert HJ, van de Wetering M, Barker N, Stange DE, van Es JH, Abo A, Kujala P, Peters PJ, Clevers H. Single Lgr5 stem cells build crypt-villus structures in vitro without a mesenchymal niche. Nature. 2009 May 14;459(7244):262-5. doi: 10.1038/nature07935. Epub 2009 Mar 29.
- Frilling A, Modlin IM, Kidd M, Russell C, Breitenstein S, Salem R, Kwekkeboom D, Lau WY, Klersy C, Vilgrain V, Davidson B, Siegler M, Caplin M, Solcia E, Schilsky R; Working Group on Neuroendocrine Liver Metastases. Recommendations for management of patients with neuroendocrine liver metastases. Lancet Oncol. 2014 Jan;15(1):e8-21. doi: 10.1016/S1470-2045(13)70362-0.
- Modlin IM, Kidd M, Latich I, Zikusoka MN, Shapiro MD. Current status of gastrointestinal carcinoids. Gastroenterology. 2005 May;128(6):1717-51. doi: 10.1053/j.gastro.2005.03.038.
- Dasari A, Shen C, Halperin D, Zhao B, Zhou S, Xu Y, Shih T, Yao JC. Trends in the Incidence, Prevalence, and Survival Outcomes in Patients With Neuroendocrine Tumors in the United States. JAMA Oncol. 2017 Oct 1;3(10):1335-1342. doi: 10.1001/jamaoncol.2017.0589.
- Hallet J, Law CH, Cukier M, Saskin R, Liu N, Singh S. Exploring the rising incidence of neuroendocrine tumors: a population-based analysis of epidemiology, metastatic presentation, and outcomes. Cancer. 2015 Feb 15;121(4):589-97. doi: 10.1002/cncr.29099. Epub 2014 Oct 13.
- Saxena A, Chua TC, Sarkar A, Chu F, Liauw W, Zhao J, Morris DL. Progression and survival results after radical hepatic metastasectomy of indolent advanced neuroendocrine neoplasms (NENs) supports an aggressive surgical approach. Surgery. 2011 Feb;149(2):209-20. doi: 10.1016/j.surg.2010.06.008. Epub 2010 Aug 2.
- Pape UF, Berndt U, Muller-Nordhorn J, Bohmig M, Roll S, Koch M, Willich SN, Wiedenmann B. Prognostic factors of long-term outcome in gastroenteropancreatic neuroendocrine tumours. Endocr Relat Cancer. 2008 Dec;15(4):1083-97. doi: 10.1677/ERC-08-0017. Epub 2008 Jul 4.
- Hanahan D, Coussens LM. Accessories to the crime: functions of cells recruited to the tumor microenvironment. Cancer Cell. 2012 Mar 20;21(3):309-22. doi: 10.1016/j.ccr.2012.02.022.
- Baryawno N, Przybylski D, Kowalczyk MS, Kfoury Y, Severe N, Gustafsson K, Kokkaliaris KD, Mercier F, Tabaka M, Hofree M, Dionne D, Papazian A, Lee D, Ashenberg O, Subramanian A, Vaishnav ED, Rozenblatt-Rosen O, Regev A, Scadden DT. A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia. Cell. 2019 Jun 13;177(7):1915-1932.e16. doi: 10.1016/j.cell.2019.04.040. Epub 2019 May 23.
- Ren X, Kang B, Zhang Z. Understanding tumor ecosystems by single-cell sequencing: promises and limitations. Genome Biol. 2018 Dec 3;19(1):211. doi: 10.1186/s13059-018-1593-z.
- Heath JR, Ribas A, Mischel PS. Single-cell analysis tools for drug discovery and development. Nat Rev Drug Discov. 2016 Mar;15(3):204-16. doi: 10.1038/nrd.2015.16. Epub 2015 Dec 16.
- Lytle NK, Ferguson LP, Rajbhandari N, Gilroy K, Fox RG, Deshpande A, Schurch CM, Hamilton M, Robertson N, Lin W, Noel P, Wartenberg M, Zlobec I, Eichmann M, Galvan JA, Karamitopoulou E, Gilderman T, Esparza LA, Shima Y, Spahn P, French R, Lewis NE, Fisch KM, Sasik R, Rosenthal SB, Kritzik M, Von Hoff D, Han H, Ideker T, Deshpande AJ, Lowy AM, Adams PD, Reya T. A Multiscale Map of the Stem Cell State in Pancreatic Adenocarcinoma. Cell. 2019 Apr 18;177(3):572-586.e22. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.010. Epub 2019 Apr 4.
- Kumar MP, Du J, Lagoudas G, Jiao Y, Sawyer A, Drummond DC, Lauffenburger DA, Raue A. Analysis of Single-Cell RNA-Seq Identifies Cell-Cell Communication Associated with Tumor Characteristics. Cell Rep. 2018 Nov 6;25(6):1458-1468.e4. doi: 10.1016/j.celrep.2018.10.047.
- Jung P, Sato T, Merlos-Suarez A, Barriga FM, Iglesias M, Rossell D, Auer H, Gallardo M, Blasco MA, Sancho E, Clevers H, Batlle E. Isolation and in vitro expansion of human colonic stem cells. Nat Med. 2011 Sep 4;17(10):1225-7. doi: 10.1038/nm.2470.
- Karthaus WR, Iaquinta PJ, Drost J, Gracanin A, van Boxtel R, Wongvipat J, Dowling CM, Gao D, Begthel H, Sachs N, Vries RGJ, Cuppen E, Chen Y, Sawyers CL, Clevers HC. Identification of multipotent luminal progenitor cells in human prostate organoid cultures. Cell. 2014 Sep 25;159(1):163-175. doi: 10.1016/j.cell.2014.08.017. Epub 2014 Sep 4.
- Chua CW, Shibata M, Lei M, Toivanen R, Barlow LJ, Bergren SK, Badani KK, McKiernan JM, Benson MC, Hibshoosh H, Shen MM. Single luminal epithelial progenitors can generate prostate organoids in culture. Nat Cell Biol. 2014 Oct;16(10):951-61, 1-4. doi: 10.1038/ncb3047. Epub 2014 Sep 21.
- Kessler M, Hoffmann K, Brinkmann V, Thieck O, Jackisch S, Toelle B, Berger H, Mollenkopf HJ, Mangler M, Sehouli J, Fotopoulou C, Meyer TF. The Notch and Wnt pathways regulate stemness and differentiation in human fallopian tube organoids. Nat Commun. 2015 Dec 8;6:8989. doi: 10.1038/ncomms9989.
- Yoshihara K, Shahmoradgoli M, Martinez E, Vegesna R, Kim H, Torres-Garcia W, Trevino V, Shen H, Laird PW, Levine DA, Carter SL, Getz G, Stemke-Hale K, Mills GB, Verhaak RG. Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data. Nat Commun. 2013;4:2612. doi: 10.1038/ncomms3612.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- CSPAC-NEN-1
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .