Virukseen liittyvä kasvainmikroympäristö (VIRONMENT)
Virukseen liittyvä kasvaimen mikroympäristö: kasvainten vastaisten hoitojen resistenssin karakterisointi ja immunologiset mekanismit
Virusten esiintyminen tai puuttuminen vaikuttaa syövän ominaisuuksiin, vasteeseen syöpähoitoihin ja taudin ennusteeseen. Syöpäkasvain koostuu syöpäsoluista sekä useista ei-syöpäsoluista ja molekyyleistä, joita kutsutaan yhteisesti tuumorimikroympäristöksi. Tutkimalla näitä kasvainten mikroympäristöjä ja ymmärtämällä, kuinka immuunijärjestelmämme on vuorovaikutuksessa viruksiin liittyvien ja ei-viruksiin liittyvien syöpien kanssa, tutkijat voivat löytää uusia lähestymistapoja tehokkaampien syövänvastaisten hoitojen kehittämiseen. Tämän tutkimuksen tarkoituksena on karakterisoida kasvainten mikroympäristöjä, jotka liittyvät erityisesti viruksiin.
Tämä on ei-interventiivinen, ambispektiivinen monikeskustutkimus, jossa on 5 täydentävää työpakettia (WP); WP1-klinikka, WP2-anatomopatologia, WP3-molekyylianalyysi, WP4-proteomianalyysit kuvapohjaisella massasytometrialla HYPERION-kuvausjärjestelmään kytketyissä kudosleikkeissä sekä WP5-bioinformatiikka- ja biostatistiikka-analyysit. Tätä tutkimusta varten kerätään ja käytetään lääketieteellisiä tietoja. Tutkimukseen tarvittavat biologiset resurssit ovat yksi tai kaksi ylimääräistä verinäytettä, jonka tilavuus on minimaalinen tai jotka ovat jo saatavilla tutkimukseen osallistuvissa eri kasvainpankeissa. Verinäytteet ja arkistoidut biopsiat kuljetetaan CIMI:lle yksityisellä kuljettajalla. Kliiniset tiedot keräävät yksinomaan potilaan tietokonepohjaisesta sairauskertomuksesta ja syöttävät ne sähköiseen tapausraporttilomakkeeseen (e-CRF) kunkin rekrytointiosaston kliinisen tutkimuksen koordinaattorin toimesta, jonka tutkivat lääkärit tunnistavat.
Analyysissä tutkijat vertailevat aluksi viruksiin liittyviä ja ei-viruksiin liittyviä ryhmiä syöpätyypin mukaan, mutta tutkijat voivat myös perustaa globaalin testin syöpätyypin perusteella. Tutkijat käyttävät suoria vertailuja RNASeq-analyysin lukemissa, mutta myös koostumusanalyysejä. Loput tilastolliset arvioinnit keskittyvät ensisijaisesti kuvaukseen ja tutkimiseen, ja ne esitellään sen mukaisesti. Nämä sisältävät tavanomaisia menetelmiä, kuten prosenttiosuuksien, keskiarvojen ja korrelaatioiden laskemista, sekä selviytymisanalyysitekniikoita, kuten Kaplan-Meier ja Cox-regressio.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Vuosikymmeniä kestäneen kasvainsoluihin kohdistuvan syöpätutkimuksen jälkeen tuumorimikroympäristöön (TME) terapeuttisiin tarkoituksiin tähtäävät strategiat laajenevat nopeasti. On osoitettu, että TME:n koostumuksella ja laadulla on suuri ennustevaikutus ja ne vaikuttavat vasteeseen kasvainten vastaisiin hoitoihin, kuten immuunitarkastuspisteestäjiin (ICI) ja sytotoksisiin kemoterapioihin. TME:hen liittyvät immuunimekanismit, jotka liittyvät resistenssiin kasvainten vastaisia hoitoja vastaan, on kuvattu vain osittain, ja ne johtavat tällä hetkellä lupaavien uusien hoitomenetelmien kehittämiseen. Viruksiin liittyvät syövät ovat yleisiä ja muodostavat suuren kansanterveysongelman. Useiden virusten on kuvattu liittyvän syöpään, joko suoraan osallisena karsinogeneesiin (onkovirukset, esim. Ihmisen papilloomavirus (HPV)) tai epäsuorasti indusoimalla esimerkiksi immunodepressiota, joka edistää syövän puhkeamista (esim. Ihmisen immuunikatovirus (HIV)). Nämä virukset näyttävät pystyvän vaikuttamaan näiden syöpien molekyyliprofiiliin ja TME:hen, mikä muuttaa niiden herkkyyttä kasvainten vastaisille hoidoille. Joitakin viruksiin liittyviä TME:itä on kuvattu osittain, pääasiassa käyttämällä transkriptomisia lähestymistapoja ja keskittyen T-lymfosyytteihin. Erityisesti viruksiin liittyviä immuunimekanismeja, jotka liittyvät vastustuskykyyn kasvainten vastaisia hoitoja, kuten ICI:itä ja kemoterapiaa vastaan, ei ole vielä kuvattu. TME:n ja immunomolekulaaristen mekanismien karakterisointi, joka liittyy resistenssiin kasvainten vastaisia hoitoja vastaan sekä viruksiin liittyvien että ei-virukseen liittyvien syöpien osalta, voi paljastaa uusia molekyyli- ja immuunikohteita. Nämä löydöt voivat muodostaa perustan tuleville terapeuttisille strategioille, jotka kohdistuvat viruksiin liittyvien syöpien TME:hen.
Tämä on ei-interventiivinen, ambispektiivinen monikeskustutkimus, jossa on 5 täydentävää työpakettia (WP); WP1-klinikka, WP2-anatomopatologia, WP3-molekyylianalyysi, WP4-proteomianalyysit kuvapohjaisella massasytometrialla HYPERION-kuvausjärjestelmään kytketyissä kudosleikkeissä sekä WP5-bioinformatiikka- ja biostatistiikka-analyysit. Yhteensä 254 tutkittavaa rekrytoidaan prospektiivisesti ja takautuvasti kahden ja puolen vuoden aikana 17 rekrytointikliinisen keskuksen sisällä. Rekrytoidaan viisi potilasryhmää, joiden tärkeimmät kliiniset ominaisuudet vastaavat ryhmien sisällä. Kaikki tutkimukseen osallistuvat potilaat ovat potilaita, joita seurataan tunnistetuissa AP-HP:n kliinisissä palveluissa syövän varalta. Tämä on tutkimuksen tuleva osa, ja potilaat, joilla on de novo syöpädiagnoosi, rekrytoidaan kuulemalla tutkimusta tutkivia lääkäreitä. Tutkivat lääkärit tiedottavat ja saavat tutkimukseen osallistuvien potilaiden vastustuksen kuulemisen aikana.
Kliiniset tiedot kerätään yksinomaan potilaan tietokonepohjaisesta sairauskertomuksesta ja syötetään sähköiseen tapausraporttilomakkeeseen (e-CRF) kunkin rekrytointiosaston kliinisen tutkimuksen teknikon toimesta, jotka tutkivat lääkärit ovat tunnistaneet. e-CRF:n rakentaa Saint-Antoinen sairaalan kansanterveysosasto Pierre Louisin epidemiologian ja kansanterveyden instituutissa (INSERM UMR S 1136) professori Pierre-Yves BOELLEN vastuulla, minkä jälkeen sen on validoinut Tutkimuskoordinaattorit. Osallistuvat biologiset alustat keräävät Omics-tiedot ja käsittelevät ne samassa paikassa. Tutkimukseen tarvittavat biologiset resurssit ovat yksi tai kaksi ylimääräistä verinäytettä, jonka tilavuus on minimaalinen tai jotka ovat jo saatavilla tutkimukseen osallistuvissa eri kasvainpankeissa. Verinäytteet ja arkistoidut biopsiat kuljetetaan CIMI:lle yksityisellä kuljettajalla.
Analyysissä tutkijat vertailevat aluksi viruksiin liittyviä ja ei-viruksiin liittyviä ryhmiä syöpätyypin mukaan, mutta tutkijat voivat myös perustaa globaalin testin syöpätyypin perusteella. tutkijat käyttävät suoria vertailuja RNASeq-analyysin lukemissa, mutta myös koostumusanalyysejä. Loput tilastolliset arvioinnit keskittyvät ensisijaisesti kuvaukseen ja tutkimiseen, ja ne esitellään sen mukaisesti. Näihin sisältyy
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: PHILIPPE SPANO
- Puhelinnumero: 01 42 16 04 72
- Sähköposti: jean-philippe@aphp.fr
Opiskelupaikat
-
-
-
Paris, Ranska, 75018
- Rekrytointi
- Service d'ORL - Oto-Rhino-Laryngologie et chirurgie cervico faciale, Hôpital Bichat - Claude-Bernard
-
Ottaa yhteyttä:
- Diane EVRARD
- Sähköposti: diane.evrard@aphp.fr
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Potilaat seurattiin jollakin seuraavista AP-HP:n kliinisistä osastoista: Lääketieteellinen onkologia - Pitié-Salpêtrière, Kliininen hematologia - Pitié-Salpêtrière, Hepato-Gastroenterologia - Pitié-Salpêtrière, Maxillo-kasvokirurgia - Pitié-Salpêtrière - Radiationtrié on-Salpêtrière , Pneumologia - Tenon, Lääketieteellinen onkologia - Tenon, Säteilyonkologia - Tenon, Lääketieteellinen onkologia - Saint-Antoine, Kliininen hematologia - Saint-Antoine, Pneumologia - Bichat, ENT ja kohdunkaulan-kasvokirurgia - Bichat, Pneumologia - Cochin, Lääketieteellinen onkologia - HEGP , Lääketieteellinen onkologia - Saint Louis, Pneumologia - Ambroise Paré, Lääketieteellinen onkologia - Avicennes
Histologisesti vahvistettu diagnoosi:
- HPV:hen liittyvä suunielun okasolusyöpä (positiivinen HPV PCR).
- Ei-HPV:hen liittyvä suunielun okasolusyöpä (negatiivinen HPV PCR).
- HIV:hen liittyvä ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) (positiivinen HIV-serologia).
- HPV:hen liittyvä NSCLC (toistuvan hengitysteiden papillomatoosin pahanlaatuinen transformaatio positiivisella HPV PCR:llä).
- NSCLC ei liity HPV:hen (negatiivinen HPV PCR) eikä HIV:hen liittyvä (negatiivinen HIV-serologia).
- Suurisoluinen B-lymfooma (diffuusi suursoluinen NOS B-lymfooma, korkea-asteen B-lymfooma, keskushermoston primaarinen B-lymfooma):
- Elinsiirron jälkeinen lymfooma (PTL), joka liittyy tai ei Epstein-Barr-virukseen (EBV) (EBER-positiivinen tai negatiivinen kasvainkudoksessa).
- Liittyy HIV:hen (positiivinen HIV-serologia) ja EBV:hen liittyvään tai ei (positiivinen tai negatiivinen EBER kasvainkudoksessa).
- Ei liity HIV:hen eikä EBV:hen (negatiivinen HIV-serologia, negatiivinen EBER negatiivisessa kasvainkudoksessa).
- HPV:hen liittyvä peräaukon okasolusyöpä (positiivinen HPV PCR) ja liittyy HIV:hen (positiivinen HIV-serologia).
- HPV:hen liittyvä peräaukon okasolusyöpä (positiivinen HPV PCR), joka ei liity HIV:hen (negatiivinen HIV-serologia).
- Potilaat, jotka kuuluvat virukseen liittyvien syöpien ja ei-virukseen liittyvien syöpien ryhmiin, vertaillaan tärkeiden kliinisten ominaisuuksien perusteella ryhmissä:
- Suunnielun levyepiteelisyöpä: kasvainvaihe (I/II tai III/IV 8. TNM:n mukaan (85)), tupakointitila (tupakoija tai tupakoimaton) ja suunniteltu tai saatu systeeminen kasvainten vastainen hoito (sytotoksinen kemoterapia tai immuunitarkastuspisteen estäjät ( ICI) (anti PD1) tai sytotoksinen kemoterapia ja ICI (anti PD1)).
- NSCLC: histologia (levyepiteelisyöpä tai adenokarsinooma), kasvainvaihe (I/II tai III/IV 8. TNM:n mukaan (85)), tupakointitila (tupakoija tai tupakoimaton) ja suunniteltu tai saatu systeeminen kasvainten vastainen hoito (ICI) (anti PD1) tai sytotoksinen kemoterapia ja ICI (anti PD1)).
- NHL: potilaat vertaillaan 2:2 (LPT EBV+ vs EBV- ja HIV+ EBV+ vs EBV-) sijainnin mukaan (systeeminen vs aivot), suorituskykytila (PS 0-1 vs 2-4) aivolymfoomien osalta ja iän mukaan. IPI-pisteet (LDH, suorituskykytila, vaihe: 0-1 vs 2-3) systeemisille lymfoomille.
- Anaalikanavan okasolusyöpä: kasvainvaihe (I/II tai III/IV 8. TNM:n mukaan (85)) ja suunniteltu tai saatu kasvainten vastainen hoito (sytotoksinen kemoterapia tai sytotoksinen kemoterapia ja sädehoito).
MET:n ominaisuuksien analysointia varten diagnoosin yhteydessä: saatavilla oleva kasvainmateriaali (biopsia tai kirurginen näyte), joka on peräisin ennen syövän vastaisten hoitojen käyttöönottoa. Tämän kasvainmateriaalin on oltava peräisin kasvaimen alkuperäelimestä potilailla, jotka ovat suunielun, NSCLC:n ja peräaukon kohortteissa.
- Systeemisille kasvainhoitoille vastustuskykymekanismien analysointia varten: kasvainmateriaali (biopsia tai kirurginen näyte), joka on saatavilla ennen syöpähoitojen käyttöönottoa ja kasvainmateriaali (biopsia tai kirurginen näyte), joka on otettu kasvaimen etenemisen jälkeen hoidon aikana ja ennen hoitoa uuden systeemisen kasvainten vastaisen hoidon käyttöönotto. Tämän kasvainmateriaalin on oltava peräisin kasvaimen alkuperäelimestä potilailla, jotka ovat suunielun, NSCLC:n ja peräaukon kohortteissa.
- Syöpä, jolle on tehty leikkausleikkaus tai biopsia tai jolle on määrä tehdä.
- Tietoinen osallistumissuostumus allekirjoitetaan ennen minkään erityisen tutkimusmenettelyn suorittamista.
- Liittyminen Ranskan sosiaaliturvajärjestelmään.
Poissulkemiskriteerit:
- Muut kuin tutkimuksessa mukana olevat syövät.
- NHL:lle: plasmablastinen lymfooma, polymorfinen lymfooma, follikulaarinen lymfooma, vaippasolulymfooma, lymfoplasmasyyttinen lymfooma, marginaalivyöhykkeen lymfooma, tuntematon kasvaimen EBV-status, tuntematon HIV-status.
- Keuhkosyövät: NSCLC, jonka histologia on muu kuin adenokarsinooma tai levyepiteelisyöpä, pienisoluinen keuhkosyöpä, EGFR-mutaatio, ALK-uudelleenjärjestely.
- Kasvainmateriaalin puuttuminen ennen systeemisten kasvainhoitojen aloittamista.
- Suunielun, NSCLC:n ja peräaukon osalta: kasvainmateriaali, joka ei ole peräisin kasvaimen alkuperäelimestä.
- Kiinnostava kasvainmateriaali loppunut: riittämätön tutkimuksessa suunniteltuihin analyyseihin.
- Anaalikanavan, suunielun ja NSCLC:n kohortit: immunosuppressiohoito (kortikosteroidit <10 mg prednisonia ekvivalenttia päivässä sallittu).
- Aikuiset huoltajina tai huoltajina.
- Kieltäytyminen tutkimukseen osallistumisesta
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Kasvainmikroympäristön solu- ja molekyylikoostumus diagnoosin yhteydessä
Aikaikkuna: Opintojakson läpi, 3 vuotta ja puoli
|
Kasvainmikroympäristön solu- ja molekyylikoostumus diagnoosin yhteydessä, analysoituna käyttämällä:
|
Opintojakson läpi, 3 vuotta ja puoli
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Muutokset kasvaimen mikroympäristön solu- ja molekyylikoostumuksessa, jossa on resistenssiä systeemisessä antituumorihoidossa verrattuna diagnoosiin.
Aikaikkuna: Opintojakson läpi, 3 vuotta ja puoli
|
Muutokset kasvaimen mikroympäristön solu- ja molekyylikoostumuksessa, jossa on resistenssiä systeemisessä kasvainten vastaisessa hoidossa verrattuna diagnoosiin, analysoitu käyttäen:
|
Opintojakson läpi, 3 vuotta ja puoli
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- APHP241217
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Tiedot ovat saatavilla kohtuullisesta pyynnöstä Ranskan tietosuojaviranomaisen (CNIL, Commission nationale de l'informatique et des libertés) kanssa suoritetut menettelyt eivät edellytä tietokannan välittämistä, eivätkä myöskään potilaiden allekirjoittamat tiedot ja suostumusasiakirjat. .
Toimituslautakunnan tai kiinnostuneiden tutkijoiden kuulemista yksittäisistä osallistujadatasta, jotka ovat artikkelissa raportoitujen tulosten taustalla identifioinnin poistamisen jälkeen, voidaan kuitenkin harkita edellyttäen, että tällaisen kuulemisen ehdot on määritetty etukäteen ja sovellettavien säännösten noudattaminen.
IPD-jaon aikakehys
IPD-jaon käyttöoikeuskriteerit
IPD-jakamista tukeva tietotyyppi
- STUDY_PROTOCOL
- MAHLA
- ICF
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .