Analyse de biomarqueurs pour les patients atteints d'un cancer colorectal métastatique (MCC)

Il s'agit d'une étude de faisabilité prospective à court terme visant à déterminer l'efficacité avec laquelle les chercheurs peuvent obtenir une analyse de biomarqueurs sur des patients atteints de CCRm dont le consentement éclairé et l'autorisation seront obtenus. L'étude sera réalisée en partenariat avec Quintiles. Les chercheurs recueilleront des données sur le nombre de biomarqueurs cliniquement exploitables qui peuvent être détectés dans chaque population et le nombre de marqueurs exploitables à l'essai qui peuvent être détectés dans ces populations. Les patients atteints d'une maladie métastatique récurrente (c.-à-d. premier diagnostic de maladie métastatique après résection, dernière radiothérapie ou dernière chimiothérapie en situation adjuvante) verront leur échantillon primaire envoyé pour une analyse de biomarqueurs. Les marqueurs exploitables ou les altérations génomiques seront des marqueurs de diagnostic compagnons approuvés par la FDA et des marqueurs utilisés pour le recrutement d'essais dans le cancer colorectal métastatique. Des informations supplémentaires concernant les marqueurs de diagnostic compagnons approuvés par la FDA et les marqueurs utilisés pour le recrutement d'essais dans des indications autres que le CCRm seront également collectées et rapportées.

Les échantillons biologiques de 25 patients qui ont eu une récidive précoce (≤ 12 mois) et de 25 patients qui ont eu une récidive tardive (> 12 mois) de leur cancer colorectal métastatique seront collectés, traités, expédiés et testés de manière appropriée. La fréquence et les sites de mutation peuvent générer des hypothèses pour aider à identifier les patients à risque plus élevé de récidive précoce et aider à identifier les futures options de traitement et à sélectionner de meilleures options de traitement pour ce groupe de mauvais pronostic.

PROCÉDURES D'INSCRIPTION La documentation écrite de l'approbation complète et non conditionnelle de l'IRB doit être au dossier avant qu'un patient puisse être enregistré. Le processus d'inscription commence lorsque le coordinateur a obtenu un consentement éclairé signé. Les données démographiques des patients figureront dans le système de gestion des essais cliniques (CTMS) ; il s'agit du système intranet basé sur le Web pour la diffusion d'informations sur les essais dans l'ensemble de l'USOR. Un numéro de patient unique (UPN) sera attribué au patient à ce moment-là. L'entrée d'un patient dans CTMS ne signifie pas que le patient a été enregistré dans l'étude.

Une fois que le patient a un numéro UPN, le coordinateur peut accéder au rapport du patient et sélectionner le patient à enregistrer. À gauche de l'UPN du patient se trouvent les lettres "Reg" en bleu. Le coordinateur cliquera sur le "Reg" bleu pour ouvrir les informations de ce patient. Chaque page à remplir sera en jaune. Le site répondra aux questions des pages Inclusions, Exclusions et Prestudy Assessment. Une fois que toutes les questions de chaque page auront reçu une réponse, cette page deviendra verte. Un numéro d'identification et un bras d'étude seront directement attribués.

PROCÉDURES D'APPROVISIONNEMENT DES ÉCHANTILLONS Les sites d'étude de l'USOR recevront des kits de collecte de tumeurs par l'intermédiaire de l'US Oncology Investigational Product Center (IPC).

Les échantillons biologiques auront une date d'expédition dans les 4 semaines suivant la signature du consentement du patient afin d'être enrôlé dans l'étude. Les tissus seront envoyés à un laboratoire central. Les détails de l'expédition seront fournis dans les informations sur les essais cliniques (CTI) fournies séparément par l'USOR.

Manuel de laboratoire de référence pour la préparation des tissus et les instructions d'expédition.

ANALYSE DES ÉCHANTILLONS ET CONFIDENTIALITÉ L'USOR et Quintiles ont l'intention de maintenir la confidentialité des patients tout au long de la procédure. L'USOR maintient des normes rigoureuses de confidentialité pour les études cliniques en codant les échantillons avec les initiales du patient et un identifiant unique (numéro UPN/patient/numéro d'identification de l'étude) et le numéro de l'étude. Un patient est en dépistage dès la signature de l'ICF et inscrit au CTMS. Un patient sera considéré comme inscrit à l'étude si un échantillon biologique standard de soins est disponible pour le test de biomarqueurs avec une date d'expédition dans les 4 semaines suivant la signature de l'ICF. Si un échantillon biologique standard de soins n'est pas disponible, pour quelque raison que ce soit, dans les 4 semaines, le patient est considéré comme un échec du dépistage.

ÉVALUATION DES ÉCHANTILLONS DE BIOS Un séquençage à haut débit utilisant la plate-forme Ion Torrent de Life Technologies ou une alternative similaire sera utilisé. Cette méthodologie offre une couverture de séquençage en profondeur de haute qualité, parfaitement adaptée à la détection de SNP et à l'analyse mutationnelle. L'analyse d'identification des mutations ponctuelles comprendra le séquençage ciblé de l'exome entier du tissu tumoral qui couvrira plusieurs centaines d'exons codant pour les protéines humaines. Les résultats du profilage seront compilés et classés en fonction de leur pertinence par rapport à la pratique clinique. Tous les résultats cliniquement exploitables seront renvoyés au médecin en utilisant les mêmes identifiants mentionnés ci-dessus.

ÉCHEC DES TESTS D'ÉCHANTILLONS Les échantillons soumis pour analyse proviendront de tissus FFPE archivés. La capacité à effectuer le test AmpliSeq peut être limitée en fonction de la qualité et de la quantité de l'échantillon disponible. Les raisons des échecs des tests peuvent être dues à une incapacité à extraire une qualité et une quantité suffisantes d'ADN, à l'incapacité de créer une bibliothèque de séquençage ou à l'incapacité d'un échantillon à se séquencer. En cas d'échec du test, la raison de l'échec du test sera enregistrée par le laboratoire et signalée au clinicien. Un patient aura la possibilité, en discussion avec son médecin de l'étude, en fonction de l'espace dans l'étude et de l'approbation du responsable du projet clinique d'oncologie des États-Unis, d'être autorisé à soumettre à nouveau un échantillon supplémentaire pour le séquençage. Si un échantillon d'un patient est un échec de test après 2 tentatives de test, le patient est considéré comme un échec de test permanent et n'aura pas la possibilité de soumettre d'échantillons supplémentaires.