Caractérisation des cellules souches intestinales (BIODIGE)

Les organoïdes intestinaux sont des mini-intestins 3D produits in vitro sur la base des capacités des cellules souches intestinales (ISC). Ces organoïdes contiennent toutes les cellules épithéliales intestinales. Le renouvellement des deux types d'ISC, présents au fond des cryptes intestinales, est contrôlé par la voie Wnt/APC/bêta-caténine. Des mutations de gènes impliqués dans cette voie sont retrouvées dans les polyposes intestinales comme la polypose adénomateuse familiale (gène FAP, APC).

Ce modèle est intéressant pour étudier les événements physiopathologiques précoces se produisant au sein de l'épithélium intestinal, dans le contexte de la PAF et des maladies inflammatoires de l'intestin (MICI). Une prolifération excessive ou une cicatrisation anormale est retrouvée respectivement dans la FAP et la MICI. Les enquêteurs ont émis l'hypothèse qu'il pourrait impliquer spécifiquement l'un des 2 ISC. Les cellules basales cylindriques (CBC) et les ISC situées en position +4 à partir du bas de la crypte (ISC+4) peuvent toutes deux se différencier en cellules épithéliales intestinales absorbantes ou sécrétoires. Cependant, CBC et ISC + 4 pourraient avoir des fonctions métaboliques, migratoires ou de survie au stress différentes.

Les chercheurs ont conçu une étude pilote monocentrique pour développer des organoïdes intestinaux à partir de biopsies endoscopiques de MII (Crohn et colite ulcéreuse), de patients atteints de PAF et de témoins sains. Les chercheurs prévoient d'étudier les caractéristiques morphologiques des organoïdes, l'expression des gènes et des protéines de la voie Wnt/APC/bêta-caténine au sein des deux ISC. Seront également étudiées l'expression de gènes clés de l'initiation tumorale (PTEN, BMPR1A, p53 et KRAS) et de paramètres inflammatoires (cytokines et médiateurs lipidiques).

Les résultats de cette étude pourraient améliorer la compréhension du renouvellement intestinal. Plus tard, le développement de nouveaux médicaments pourrait bénéficier aux patients atteints de MII et de PAF.