Influence de la préparation mécanique de l'intestin sur le microbiote gastro-intestinal

La procédure de préparation mécanique de l'intestin (BP), qui précède directement l'endoscopie colique, entraîne une réduction significative des symptômes signalés pour plusieurs troubles intestinaux (par exemple, le syndrome du côlon irritable (IBS)), mais pour l'instant, il existe peu de preuves à l'appui fondées sur la recherche. Cette proposition utilisera une conception expérimentale robuste pour explorer à la fois la composition du microbiote et, surtout, son activité métabolique pour évaluer les interactions avec les hôtes humains après BP. L'objectif de cette étude pilote est de générer des données démontrant les effets déstabilisateurs du PB sur la composition et l'activité métabolique du microbiote intestinal.

Si l'hypothèse est avérée, cette étude montrera que BP génère une "fenêtre d'opportunité" pour influencer le rétablissement ultérieur du microbiote. Ceci dans le but éventuel de corriger la dysbiose et de prévenir le développement d'une maladie diverticulaire symptomatique non compliquée chez les patients atteints de diverticulose.

Contexte La maladie diverticulaire, caractérisée par une faiblesse du tissu conjonctif de soutien de la paroi du côlon conduisant à la formation de diverticules1, est quelque peu négligée et ne reçoit pas l'attention scientifique que d'autres troubles inflammatoires de l'intestin ont. Malgré cette condition affectant 50% de notre population vieillissante, dont environ 1/5 développera une maladie diverticulaire non compliquée symptomatique débilitante (SUDD)2, il y a un manque de connaissances dans ce domaine.

Les facteurs déterminant la transition de la diverticulose asymptomatique au SUDD ne sont pas clairs. Cependant, le microbiote intestinal a été impliqué dans une étude récente à petite échelle qui a corrélé la diverticulose avec l'épuisement du groupe Clostridium IV. Clostridium cluster IX, Fusobacterium et Lactobacillaceae, qui peuvent tous exercer des effets anti-inflammatoires. Les patients qui présentent des douleurs abdominales non spécifiques du côté gauche et une diarrhée sont évalués par endoscopie colique. Une étude à petite échelle a montré que cette procédure entraînait également une réduction significative des Lactobacillaceae dans la population témoin après 1 mois (n = 10).

BP est reçu 14 et 20 heures avant la coloscopie et implique l'administration orale avec une variété de laxatifs stimulants (par exemple Moviprep - polyéthylène glycol) entraînant une diarrhée sévère et une élimination complète des matières fécales de l'intestin. Il est probable que cette PA soit impliquée dans toute réduction des symptômes rapportés par opposition à la procédure endoscopique elle-même, bien que les mécanismes sous-jacents putatifs n'aient pas encore été identifiés.

Hypothèse : La préparation intestinale pour l'endoscopie déstabilisera le microbiote intestinal chez les patients atteints de diverticulose. Le rétablissement de ce microbiote suit une trajectoire de développement altérée entraînant des changements soutenus dans la composition du microbiote. De plus, ces changements observés auront des conséquences fonctionnelles telles qu'identifiées par des interactions métaboliques altérées à l'interface microbe-hôte.

Buts et objectifs:

1. Quantifier les changements d'observation soutenus qui se produisent au sein des groupes fonctionnels du microbiote intestinal après BP (technologie HTP FISHflow).
2. Les conséquences fonctionnelles de tels changements sur le métabolisme de l'hôte, le co-métabolisme hôte-microbe et la production d'acides gras à chaîne courte seront évaluées (spectroscopie par résonance magnétique nucléaire et chromatographie en phase gazeuse respectivement).
3. Des techniques d'intégration de données statistiques identifieront les liens entre le microbiote altéré et les profils métaboliques pour commencer à déterminer les mécanismes sous-jacents à l'influence du microbiote intestinal dans la diverticulose.
4. Les résultats ci-dessus permettront d'identifier si une "fenêtre d'opportunité" se produit après la PA qui pourrait être exploitée pour rectifier la dysbiose comme base d'une étude ultérieure à plus grande échelle.

Conception expérimentale

Afin d'évaluer les effets de la BP sur le microbiote colique dans la diverticulose, des femmes ménopausées souffrant de douleurs abdominales gauches légères non spécifiques et de diarrhée, qui ont été référées à l'unité colorectale du Royal Berkshire Hospital, seront recrutées par le candidats (KT, PC). Les patients qui n'ont pas reçu d'antibiotiques au cours des 3 mois précédents rempliront un questionnaire pour évaluer les symptômes gastro-intestinaux, qui sera basé sur ceux utilisés dans nos précédents essais sur le syndrome du côlon irritable (IBS) humain. L'urine sera collectée à t=0 (avant BP), t=2j (24h après BP), t=8j (1 semaine après BP) et t=3 mois (lors du rappel à l'hôpital). Les fèces seront collectées aux mêmes moments sauf t = 2d, à la place le premier vide suivant BP sera demandé. Les patients reçoivent des BP oraux par la poste ou les récupèrent à l'unité d'endoscopie, et nous en profiterons pour livrer des pots d'échantillons fécaux. Des échantillons seront fournis soit à l'hôpital et immédiatement congelés, soit les patients seront invités à congeler et à apporter avec eux à leur rendez-vous. Les échantillons ultérieurs (t-8j, t = 3 mois) seront conservés congelés à domicile puis collectés par le personnel de l'Université de Reading une fois les deux échantillons collectés. Lors de la collecte, les patients recevront le questionnaire (et l'enveloppe auto-adressée) pour permettre la comparaison de leurs symptômes 2 semaines et 3 mois post BP avec ceux rapportés auparavant (t=0).