- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT05837221
Microbiome dans le carcinome épidermoïde de la tête et du cou
Rôle du microbiome humain dans le cancer de la tête et du cou
Aperçu de l'étude
Statut
Intervention / Traitement
Description détaillée
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Kristi Engle Folchert
- Numéro de téléphone: (303) 724-9528
- E-mail: kristi.englefolchert@cuanschutz.edu
Sauvegarde des contacts de l'étude
- Nom: Yosr Doghri
- Numéro de téléphone: (303) 724-6550
- E-mail: yosr.doghri@cuanschutz.edu
Lieux d'étude
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Colorado
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Aurora, Colorado, États-Unis, 80045
- Recrutement
- University of Colorado Cancer Center
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Chercheur principal:
- Shi-Long Lu, MD, PhD
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Contact:
- Yosr Doghri
- Numéro de téléphone: (303) 724-6550
- E-mail: yosr.doghri@cuanschutz.edu
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Sujets égaux ou supérieurs à l'âge de 18 ans.
- Patients vus et évalués par un prestataire de la clinique d'oto-rhino-laryngologie pour adultes de l'Université du Colorado Health.
- Les patients qui présentent un diagnostic de CCCO.
- Un nombre égal de patients appariés selon l'âge qui visitent la clinique pour des raisons autres que les diagnostics de CCCO, en tant que groupe témoin.
- Capacité à comprendre et volonté de signer un document écrit de consentement éclairé
Critère d'exclusion:
- Sujets de moins de 18 ans ou de plus de 100 ans
- Sujets refusant de participer
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Groupe d'échantillons de salive de carcinome épidermoïde de la bouche
La salive sera recueillie au moins 30 minutes après que les sujets auront cessé de manger, de boire, de mâcher de la gomme et de fumer. Les sujets seront invités à cracher de la salive dans un tube de collecte. La salive sera divisée en deux aliquotes, l'une immédiatement congelée à -80C et un qui est mélangé 1:1 avec du bouillon de soja trypsique pré-réduit, de la L-cystéine et du glycérol puis congelé à -80C pour préserver la viabilité des micro-organismes. |
Le séquençage métagénomique Shotgun caractérisera les changements associés au cancer dans la capacité fonctionnelle microbienne et les profils taxonomiques au niveau des espèces/souches.
La métagénomique fournira des données sur la capacité fonctionnelle microbienne ainsi que des classifications taxonomiques plus larges.
L'analyse métabolique sera effectuée à l'aide d'une analyse métabolique basée sur LC/MS.
Une approche ciblée quantifiera un panel de 30 composés, y compris les produits de la voie Trp, tandis qu'une approche non ciblée, lorsqu'elle est appliquée à la fois aux composés en phase lipidique et aqueuse, établira le profil des changements relatifs dans les composés qui peuvent influencer l'hôte.
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Groupe d'échantillons de salive de carcinome épidermoïde non oral
La salive sera recueillie au moins 30 minutes après que les sujets auront cessé de manger, de boire, de mâcher de la gomme et de fumer. Les sujets seront invités à cracher de la salive dans un tube de collecte. La salive sera divisée en deux aliquotes, l'une immédiatement congelée à -80C et un qui est mélangé 1:1 avec du bouillon de soja trypsique pré-réduit, de la L-cystéine et du glycérol puis congelé à -80C pour préserver la viabilité des micro-organismes. |
Le séquençage métagénomique Shotgun caractérisera les changements associés au cancer dans la capacité fonctionnelle microbienne et les profils taxonomiques au niveau des espèces/souches.
La métagénomique fournira des données sur la capacité fonctionnelle microbienne ainsi que des classifications taxonomiques plus larges.
L'analyse métabolique sera effectuée à l'aide d'une analyse métabolique basée sur LC/MS.
Une approche ciblée quantifiera un panel de 30 composés, y compris les produits de la voie Trp, tandis qu'une approche non ciblée, lorsqu'elle est appliquée à la fois aux composés en phase lipidique et aqueuse, établira le profil des changements relatifs dans les composés qui peuvent influencer l'hôte.
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Groupe d'échantillons de selles de carcinome épidermoïde oral
Les méthodes de collecte des selles peuvent différer selon le patient.
L'objectif est de collecter des échantillons de selles fraîches, ceux qui sont disponibles seront collectés lors de la visite d'étude.
Si un patient n'est pas en mesure de donner un échantillon lors de la visite, des échantillons peuvent être prélevés à domicile à l'aide des kits OMNIgene-GUT et OMNImet-GUT (DNA Genotek, Inc.).
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Le séquençage métagénomique Shotgun caractérisera les changements associés au cancer dans la capacité fonctionnelle microbienne et les profils taxonomiques au niveau des espèces/souches.
La métagénomique fournira des données sur la capacité fonctionnelle microbienne ainsi que des classifications taxonomiques plus larges.
L'analyse métabolique sera effectuée à l'aide d'une analyse métabolique basée sur LC/MS.
Une approche ciblée quantifiera un panel de 30 composés, y compris les produits de la voie Trp, tandis qu'une approche non ciblée, lorsqu'elle est appliquée à la fois aux composés en phase lipidique et aqueuse, établira le profil des changements relatifs dans les composés qui peuvent influencer l'hôte.
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Groupe d'échantillons de selles de carcinome épidermoïde non oral
Les méthodes de collecte des selles peuvent différer selon le patient.
L'objectif est de collecter des échantillons de selles fraîches, ceux qui sont disponibles seront collectés lors de la visite d'étude.
Si un patient n'est pas en mesure de donner un échantillon lors de la visite, des échantillons peuvent être prélevés à domicile à l'aide des kits OMNIgene-GUT et OMNImet-GUT (DNA Genotek, Inc.).
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Le séquençage métagénomique Shotgun caractérisera les changements associés au cancer dans la capacité fonctionnelle microbienne et les profils taxonomiques au niveau des espèces/souches.
La métagénomique fournira des données sur la capacité fonctionnelle microbienne ainsi que des classifications taxonomiques plus larges.
L'analyse métabolique sera effectuée à l'aide d'une analyse métabolique basée sur LC/MS.
Une approche ciblée quantifiera un panel de 30 composés, y compris les produits de la voie Trp, tandis qu'une approche non ciblée, lorsqu'elle est appliquée à la fois aux composés en phase lipidique et aqueuse, établira le profil des changements relatifs dans les composés qui peuvent influencer l'hôte.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Caractériser la dysbiose humaine
Délai: Jour 1
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Des échantillons de selles et de salive seront collectés auprès des participants, ce qui nous permettra de reproduire la dysbiose humaine et d'analyser si le HNSCC affecte la composition de son microbiome.
Le séquençage métagénomique sera effectué en utilisant l'extraction d'ADN, la génération de bibliothèques et le séquençage Illumina.
Au moins 30 millions de lectures métagénomiques appariées 2x150bp seront générées par échantillon à l'aide de la plateforme Illumina NovaSeq.
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Jour 1
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Caractériser la métabolomique humaine
Délai: Jour 1
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Grâce à nos échantillons de selles et de salive, nous pourrons caractériser les signatures métagénomiques et métaboliques chez les patients OSCC et non OSCC naïfs de traitement.
L'analyse métabolique sera effectuée à l'aide d'une analyse métabolique basée sur LC/MS.
Une approche ciblée quantifiera un panel de 30 composés, y compris les produits de la voie Trp, tandis qu'une approche non ciblée, lorsqu'elle est appliquée à la fois aux composés lipidiques et en phase aqueuse, établira le profil des changements relatifs dans les composés qui peuvent influencer l'hôte, les statuts métaboliques et immunitaires.
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Jour 1
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Analyse intégrative de données multi-omiques et découverte de biomarqueurs
Délai: Jour 365
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Nous nous attendons à ce que des ensembles spécifiques de facteurs microbiens et hôtes interagissent les uns avec les autres pour promouvoir l'OSCC.
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Jour 365
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Impact de la dysbiose humaine sur le développement de l'OSCC chez la souris
Délai: Jour 10-Jour 100
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Des échantillons de salive et de selles fraîchement prélevés sur 10 sujets de chaque catégorie de traitement seront utilisés pour reconstituer le microbiote.
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Jour 10-Jour 100
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Surveiller la taille de la tumeur
Délai: Jour 10-Jour 100
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La taille de la tumeur (poids et taille) sera surveillée à l'aide de l'imagerie Bli.
Ces mesures seront évaluées entre les groupes de traitement par ANOVA ou analyse de variance.
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Jour 10-Jour 100
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Shi-Long E Lu, MD, PhD, University of Colorado, Denver
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Maladies de la bouche
- Maladies stomatognathiques
- Tumeurs par site
- Tumeurs
- Maladies oto-rhino-laryngologiques
- Tumeurs oto-rhino-laryngologiques
- Maladies pharyngées
- Maladies des lèvres
- Tumeurs de la tête et du cou
- Tumeurs de la bouche
- Tumeurs des lèvres
- Tumeurs pharyngées
- Techniques d'investigation
- Techniques de laboratoire clinique
- Techniques et procédures de diagnostic
- Diagnostic
- Techniques cytologiques
- Analyse des Flux Métaboliques
Autres numéros d'identification d'étude
- 23-0016.cc
- P50CA261605 (Subvention/contrat des NIH des États-Unis)
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .