- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT05837221
Mikrobiom im Kopf-Hals-Plattenepithelkarzinom
Rolle des menschlichen Mikrobioms bei Kopf- und Halskrebs
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: Kristi Engle Folchert
- Telefonnummer: (303) 724-9528
- E-Mail: kristi.englefolchert@cuanschutz.edu
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Yosr Doghri
- Telefonnummer: (303) 724-6550
- E-Mail: yosr.doghri@cuanschutz.edu
Studienorte
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Colorado
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Aurora, Colorado, Vereinigte Staaten, 80045
- Rekrutierung
- University of Colorado Cancer Center
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Hauptermittler:
- Shi-Long Lu, MD, PhD
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Kontakt:
- Yosr Doghri
- Telefonnummer: (303) 724-6550
- E-Mail: yosr.doghri@cuanschutz.edu
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Probanden gleich oder älter als 18 Jahre.
- Patienten, die von einem Anbieter in der HNO-Klinik für Erwachsene an der University of Colorado Health untersucht und untersucht werden.
- Patienten mit OSCC-Diagnose.
- Eine gleiche Anzahl von Patienten gleichen Alters, die die Klinik aus anderen Gründen als OSCC-Diagnosen aufsuchen, als Kontrollgruppe.
- Fähigkeit, ein schriftliches Einverständniserklärungsdokument zu verstehen und bereit zu sein, es zu unterzeichnen
Ausschlusskriterien:
- Personen unter 18 Jahren oder über 100 Jahren
- Probanden, die nicht teilnehmen möchten
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Orale Plattenepithelkarzinom-Speichel-Probengruppe
Speichel wird mindestens 30 Minuten, nachdem die Probanden aufgehört haben zu essen, zu trinken, Kaugummi zu kauen und zu rauchen, gesammelt. Die Probanden werden angewiesen, Speichel in ein Sammelröhrchen zu spucken. Der Speichel wird in zwei Aliquots aufgeteilt, von denen eines sofort eingefroren wird -80 °C und eine, die 1:1 mit vorreduzierter tryptischer Sojabrühe, L-Cystein und Glycerin gemischt und dann bei -80 °C eingefroren wird, um die Lebensfähigkeit von Mikroorganismen zu erhalten. |
Die metagenomische Shotgun-Sequenzierung wird krebsassoziierte Veränderungen der mikrobiellen Funktionskapazität und der taxonomischen Profile auf Spezies-/Stammebene charakterisieren.
Die Metagenomik wird Daten zur mikrobiellen Funktionskapazität zusammen mit breiteren taxonomischen Klassifikationen liefern.
Die Stoffwechselanalyse wird mittels LC/MS-basierter Stoffwechselanalyse durchgeführt.
Ein zielgerichteter Ansatz wird ein Panel von 30 Verbindungen quantifizieren, einschließlich Trp-Wegprodukten, während ein nicht zielgerichteter Ansatz, wenn er sowohl auf Lipid- als auch auf wässrige Phasenverbindungen angewendet wird, relative Änderungen in Verbindungen profiliert, die den Wirt beeinflussen können
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Nicht-oraler Plattenepithelkarzinom-Speichel-Probengruppe
Speichel wird mindestens 30 Minuten, nachdem die Probanden aufgehört haben zu essen, zu trinken, Kaugummi zu kauen und zu rauchen, gesammelt. Die Probanden werden angewiesen, Speichel in ein Sammelröhrchen zu spucken. Der Speichel wird in zwei Aliquots aufgeteilt, von denen eines sofort eingefroren wird -80 °C und eine, die 1:1 mit vorreduzierter tryptischer Sojabrühe, L-Cystein und Glycerin gemischt und dann bei -80 °C eingefroren wird, um die Lebensfähigkeit von Mikroorganismen zu erhalten. |
Die metagenomische Shotgun-Sequenzierung wird krebsassoziierte Veränderungen der mikrobiellen Funktionskapazität und der taxonomischen Profile auf Spezies-/Stammebene charakterisieren.
Die Metagenomik wird Daten zur mikrobiellen Funktionskapazität zusammen mit breiteren taxonomischen Klassifikationen liefern.
Die Stoffwechselanalyse wird mittels LC/MS-basierter Stoffwechselanalyse durchgeführt.
Ein zielgerichteter Ansatz wird ein Panel von 30 Verbindungen quantifizieren, einschließlich Trp-Wegprodukten, während ein nicht zielgerichteter Ansatz, wenn er sowohl auf Lipid- als auch auf wässrige Phasenverbindungen angewendet wird, relative Änderungen in Verbindungen profiliert, die den Wirt beeinflussen können
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Orale Plattenepithelkarzinom-Stuhl-Probengruppe
Die Methoden zur Stuhlentnahme können je nach Patient unterschiedlich sein.
Ziel ist es, frische Stuhlproben zu sammeln, die verfügbaren werden während des Studienbesuchs gesammelt.
Wenn ein Patient beim Besuch keine Probe abgeben kann, können die Proben zu Hause mit den OMNIgene-GUT- und OMNImet-GUT-Kits (DNA Genotek, Inc.) entnommen werden.
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Die metagenomische Shotgun-Sequenzierung wird krebsassoziierte Veränderungen der mikrobiellen Funktionskapazität und der taxonomischen Profile auf Spezies-/Stammebene charakterisieren.
Die Metagenomik wird Daten zur mikrobiellen Funktionskapazität zusammen mit breiteren taxonomischen Klassifikationen liefern.
Die Stoffwechselanalyse wird mittels LC/MS-basierter Stoffwechselanalyse durchgeführt.
Ein zielgerichteter Ansatz wird ein Panel von 30 Verbindungen quantifizieren, einschließlich Trp-Wegprodukten, während ein nicht zielgerichteter Ansatz, wenn er sowohl auf Lipid- als auch auf wässrige Phasenverbindungen angewendet wird, relative Änderungen in Verbindungen profiliert, die den Wirt beeinflussen können
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Nicht orale Plattenepithelkarzinom-Stuhlprobengruppe
Die Methoden zur Stuhlentnahme können je nach Patient unterschiedlich sein.
Ziel ist es, frische Stuhlproben zu sammeln, die verfügbaren werden während des Studienbesuchs gesammelt.
Wenn ein Patient beim Besuch keine Probe abgeben kann, können die Proben zu Hause mit den OMNIgene-GUT- und OMNImet-GUT-Kits (DNA Genotek, Inc.) entnommen werden.
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Die metagenomische Shotgun-Sequenzierung wird krebsassoziierte Veränderungen der mikrobiellen Funktionskapazität und der taxonomischen Profile auf Spezies-/Stammebene charakterisieren.
Die Metagenomik wird Daten zur mikrobiellen Funktionskapazität zusammen mit breiteren taxonomischen Klassifikationen liefern.
Die Stoffwechselanalyse wird mittels LC/MS-basierter Stoffwechselanalyse durchgeführt.
Ein zielgerichteter Ansatz wird ein Panel von 30 Verbindungen quantifizieren, einschließlich Trp-Wegprodukten, während ein nicht zielgerichteter Ansatz, wenn er sowohl auf Lipid- als auch auf wässrige Phasenverbindungen angewendet wird, relative Änderungen in Verbindungen profiliert, die den Wirt beeinflussen können
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Charakterisieren Sie die menschliche Dysbiose
Zeitfenster: Tag 1
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Stuhl- und Speichelproben werden von den Teilnehmern gesammelt, was es uns ermöglicht, die menschliche Dysbiose zu reproduzieren und zu analysieren, ob HNSCC die Zusammensetzung des Mikrobioms beeinflusst.
Die metagenomische Sequenzierung wird mithilfe von DNA-Extraktion, Generierung von Bibliotheken und Illumina-Sequenzierung durchgeführt.
Mit der Illumina NovaSeq-Plattform werden pro Probe mindestens 30 Millionen Paired-End-Metagenom-Reads mit 2 x 150 bp generiert.
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Tag 1
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Charakterisieren Sie die menschliche Metabolomik
Zeitfenster: Tag 1
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Durch unsere Stuhl- und Speichelproben werden wir in der Lage sein, metagenomische und metabolische Signaturen bei behandlungsnaiven OSCC- und Nicht-OSCC-Patienten zu charakterisieren.
Die Stoffwechselanalyse wird mittels LC/MS-basierter Stoffwechselanalyse durchgeführt.
Ein zielgerichteter Ansatz wird ein Panel von 30 Verbindungen quantifizieren, darunter Produkte des Trp-Wegs, während ein nicht zielgerichteter Ansatz, wenn er sowohl auf Lipid- als auch auf Verbindungen in der wässrigen Phase angewendet wird, relative Änderungen in Verbindungen profiliert, die den Wirts- und Stoffwechsel- und Immunstatus beeinflussen können.
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Tag 1
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Integrative Multi-Omic-Datenanalyse und Entdeckung von Biomarkern
Zeitfenster: Tag 365
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Wir gehen davon aus, dass bestimmte Gruppen von mikrobiellen und Wirtsfaktoren miteinander interagieren, um OSCC zu fördern.
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Tag 365
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Einfluss der menschlichen Dysbiose auf die OSCC-Entwicklung bei Mäusen
Zeitfenster: Tag 10 – Tag 100
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Frisch gesammelte Speichel- und Stuhlproben von 10 Probanden jeder Behandlungskategorie werden zur Rekonstitution der Mikrobiota verwendet.
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Tag 10 – Tag 100
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Überwachen Sie die Tumorgröße
Zeitfenster: Tag 10 – Tag 100
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Die Tumorgröße (sowohl Gewicht als auch Größe) wird mittels Bli-Bildgebung überwacht.
Diese Maßnahmen werden zwischen den Behandlungsgruppen durch ANOVA oder Analyse von Varianztests bewertet.
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Tag 10 – Tag 100
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Mitarbeiter
Ermittler
- Hauptermittler: Shi-Long E Lu, MD, PhD, University of Colorado, Denver
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
- Mundkrankheiten
- Stomatognathe Erkrankungen
- Neubildungen nach Standort
- Neubildungen
- Otorhinolaryngologische Erkrankungen
- Otorhinolaryngologische Neubildungen
- Rachenkrankheiten
- Lippenkrankheiten
- Kopf-Hals-Neubildungen
- Neubildungen im Mund
- Lippentumoren
- Rachenneoplasmen
- Untersuchungstechniken
- Klinische Labortechniken
- Diagnosetechniken und Verfahren
- Diagnose
- Zytologische Techniken
- Analyse des metabolischen Flusses
Andere Studien-ID-Nummern
- 23-0016.cc
- P50CA261605 (US NIH Stipendium/Vertrag)
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
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