Signature épigénétique pour la détection précoce du CCR (epiCED)

CRCMAP est une approche non invasive basée sur le sang visant la détection précoce du cancer colorectal (CCR) en utilisant des marqueurs épigénétiques de l'ADN circulant libre (cfDNA) 5-méthylcytosine (5mC) et 5-hydroxyméthylcytosine (5hmC). La détection précoce du CCR est cruciale pour améliorer les résultats des patients, mais les outils de diagnostic actuels - incluant la coloscopie, la tomodensitométrie et l'IRM - sont soit invasifs, coûteux, ou insuffisamment sensibles pour la maladie à un stade précoce, limitant leur utilisation pour le dépistage à l'échelle de la population.

Cette étude utilisera des cohortes rétrospectives multicentriques comprenant des participants adultes (≥18 ans) avec un CCR confirmé et des témoins non cancéreux, incluant des volontaires sains et des individus présentant des affections gastro-intestinales bénignes. Les échantillons sanguins seront soumis à l'extraction de cfDNA et au séquençage épigénétique à petite échelle pour profiler les motifs 5mC et 5hmC.

Pendant la phase de découverte, l'analyse de méthylation différentielle et la sélection de caractéristiques basée sur l'apprentissage automatique seront appliquées pour identifier un ensemble minimal de marqueurs de méthylation du cfDNA qui discriminent de manière optimale le CCR des individus non cancéreux. Dans la phase d'entraînement et de validation, la signature identifiée sera évaluée sur des cohortes multicentriques internationales indépendantes pour assurer la reproductibilité, la robustesse et les performances de détection précoce.

Les objectifs principaux sont :

Développer un panel de méthylation du cfDNA capable de distinguer précisément les patients atteints de CCR des témoins non cancéreux.

Valider la capacité du panel à détecter le CCR à un stade précoce.

Les objectifs secondaires incluent l'évaluation de l'association de la signature de méthylation avec les paramètres cliniques, le stade tumoral et les facteurs démographiques. En intégrant le profilage de méthylation du cfDNA à haute résolution avec la modélisation computationnelle avancée, CRCMAP vise à fournir un outil évolutif, rentable et cliniquement pratique pour la détection précoce non invasive du cancer colorectal.