Epigenetisk signatur til tidlig opsporing af kolorektal cancer (epiCED)

CRCMAP er en ikke-invasiv, blodbaseret tilgang, der sigter mod tidlig opsporing af tyktarmskraft (CRC) ved hjælp af cirkulerende cellerfrit DNA (cfDNA) 5-methylcytosin (5mC) og 5-hydroxymethylcytosin (5hmC) epigenetiske markører. Tidlig opsporing af CRC er afgørende for at forbedre patienters udfald, men nuværende diagnostiske værktøjer - herunder koloskopi, CT og MRI - er enten invasive, dyre eller utilstrækkeligt følsomme for tidlig sygdom, hvilket begrænser deres anvendelse til befolkningsdækkende screening.

Denne undersøgelse vil anvende retrospektive, multicentriske kohorter bestående af voksne deltagere (≥18 år) med bekræftet CRC og ikke-kræft kontrolgrupper, herunder sunde frivillige og personer med godartede mave-tarmtilstande. Blodprøver vil blive udsat for cfDNA-ekstraktion og lille-skala epigenetisk sekventering for at profilere 5mC og 5hmC-mønstre.

I opdagelsesfasen vil differentiel methyleringsanalyse og maskinlæringsbaseret funktionsselektion blive anvendt til at identificere et minimalt sæt af cfDNA-methyleringsmarkører, der optimalt skelner CRC fra ikke-kræft individer. I trænings- og valideringsfasen vil den identificerede signatur blive evalueret på tværs af uafhængige internationale multicentriske kohorter for at sikre reproducerbarhed, robusthed og tidlig opsporingsydelse.

De primære mål er at:

Udvikle en cfDNA-methyleringspanel i stand til præcist at skelne CRC-patienter fra ikke-kræft kontrolgrupper.

Validere panelets evne til at detektere tidligstadiet CRC.

Sekundære mål inkluderer evaluering af associationen mellem methyleringssignaturen og kliniske parametre, tumorstadium og demografiske faktorer. Ved at integrere højopløselig cfDNA-methyleringsprofilering med avanceret beregningsmodellering sigter CRCMAP mod at levere et skalerbart, omkostningseffektivt og klinisk praktisk værktøj til ikke-invasiv tidlig opsporing af tyktarmskraft.