A korai élet virom fejlődésének hatása a bronchopulmonális dysplasia kialakulására koraszülött újszülötteknél (ELVIRE)

A bronchopulmonális dysplasia (BPD) a legelterjedtebb légzési szövődmény rendkívül koraszülött csecsemőknél. Jelentős mortalitáshoz és hosszú távú morbiditáshoz vezet. A BPD patofiziológiája multifaktoriális, gyulladást és oxidatív stresszt foglal magában, amely a neonatális expozícióknak köszönhető, mint például a mechanikus lélegeztetés és a fertőzések.

Korábbi tanulmányok rávilágítottak a légzőszervi bakteriális mikrobiotának a BPD kialakulásában játszott szerepére, az oki hatásokat egér modellekben igazolták. Továbbá, a bél-tüdő tengely érintett a BPD-ben, a bélbakterióm és mikobióm megváltozásait megfigyelték az élet első heteiben a koraszülötteknél, akik később BPD-t fejlesztenek ki.

A szervezet immunitásának és mikrobális ökológiájának alakításában betöltött kritikus szerepe ellenére, a viromot nagyrészt alulvizsgálták koraszülött csecsemőknél. Legutóbbi megfigyeléseink kimutatták egy észlelhető légzőszervi virom létezését születéskor a legtöbb nagyon koraszülöttnél, és bizonyos virom és bakterióm profilokat találtak, amelyek különböző BPD kialakulási kockázatokhoz kapcsolódnak.

Hipotézis:

Az élet első heteiben a légzőszervi és bél virom korai megszerzése és dinamikája befolyásolja a mikrobiot szerkezetét és a tüdő immunfejlődést, hozzájárulva a BPD patogeneziséhez. Ezek a dinamikák különálló BPD endotípusokat határozhatnak meg, amelyek prognózisra és terápiára vonatkozó implikációkkal rendelkeznek.

Célok:

• Elsődleges: Jellemezni a légzőszervi és bél virom evolúcióját az élet első 3 hete alatt a <30 hét terhességi korban született csecsemőknél, összehasonlítva azokat, akik BPD-t fejlesztenek ki, azokkal, akik nem.

• Másodlagos:

  • Meghatározni különböző BPD endotípusokat és felmérni azok társulását demográfiai és klinikai jellemzőkkel.
  • Jellemezni a mikrobiot szerkezetét minden endotípuson belül.
  • Összehasonlítani a virom, bakterióm és mikobióm evolúcióját anatómiai helyeken belül és között.

Vizsgálati Terv:

Egy monocentrikus, prospektív megfigyelési kohorsz 40 koraszülött csecsemőből (<30 hét GA), akik születéskor légzési támogatást igényelnek. A csecsemőket 36 hetes posztmenstruális korban (PMA) BPD és nem-BPD csoportokba sorolják oxigénfüggőség alapján.

Mintagyűjtés:

• Oropharyngealis aspirátumok: Gyűjtve 0., 7., 14. és 21. napon.
• Széklet minták: Gyűjtve 7., 14. és 21. napon.

Módszerek:

• Virom analízis: Vírusos metagenomika
• Metatranszkriptomika: Értékelni a transzkripciósan aktív baktériumokat/gombákat és a gazdagén expresszióját.
• Adatintegráció: Multi-omics faktoranalízis és felügyelet nélküli klaszterezés a BPD endotípusok azonosításához; ökológiai hálózatelemzés a mikrobiot szerkezet és interakciók értékelésére.

Eredmények:

• Elsődleges: A virom összetételének és diverzitásának kvalitatív és kvantitatív értékelése, beleértve a dinamikát és perzisztenciát az időpontok között.
• Másodlagos: Mikrobiot alapú endotípusok definíciója; interakciós hálózatok vírusok, baktériumok és gombák között; és mikrobális diverzitás és összetétel longitudinális összehasonlítása anatómiai helyek között.