Влияние развития вирома раннего возраста на бронхолёгочную дисплазию у недоношенных новорождённых (ELVIRE)

Бронхолегочная дисплазия (БЛД) является наиболее частым респираторным осложнением у глубоко недоношенных детей. Это приводит к значительной смертности и долгосрочной заболеваемости. Патогенез БЛД является многофакторным, включая воспаление и окислительный стресс, вызванные неонатальными воздействиями, такими как искусственная вентиляция легких и инфекции.

Предыдущие исследования подчеркнули роль респираторной бактериальной микробиоты в развитии БЛД, при этом причинно-следственные эффекты были продемонстрированы на мышиных моделях. Более того, кишечно-легочная ось вовлечена в БЛД, при этом изменения кишечного бактериома и микобиома наблюдались у недоношенных детей в первые недели жизни, у которых позже развилась БЛД.

Несмотря на его критическую роль в формировании иммунитета и микробной экологии, виром у недоношенных детей в значительной степени недостаточно изучен. Наши недавние наблюдения выявили существование обнаруживаемого респираторного вирома при рождении у большинства глубоко недоношенных детей, и было обнаружено, что определенные профили вирома и бактериома связаны с различными рисками развития БЛД.

Гипотеза:

Раннее приобретение и динамика респираторного и кишечного вирома в первые недели жизни влияют на структуру микробиома и развитие легочного иммунитета, способствуя патогенезу БЛД. Эта динамика может определять различные эндотипы БЛД с последствиями для прогноза и терапии.

Цели:

• Основная: Охарактеризовать эволюцию респираторного и кишечного вирома в течение первых 3 недель жизни у детей, рожденных на сроке <30 недель гестации, сравнивая тех, у кого развивается БЛД, с теми, у кого нет.

• Вторичные:

  • Определить различные эндотипы БЛД и оценить их связь с демографическими и клиническими характеристиками.
  • Охарактеризовать структуру микробиома в каждом эндотипе.
  • Сравнить эволюцию вирома, бактериома и микобиома внутри и между анатомическими участками.

Дизайн исследования:

Моноцентрическое проспективное наблюдательное когортное исследование 40 недоношенных детей (<30 недель ГС), требующих респираторной поддержки при рождении. Дети классифицируются в возрасте 36 недель постменструального возраста (ПМВ) на группы с БЛД и без БЛД на основе зависимости от кислорода.

Сбор образцов:

• Орофарингеальные аспираты: собираются на 0, 7, 14 и 21 день.
• Образцы стула: собираются на 7, 14 и 21 день.

Методы:

• Анализ вирома: вирусная метагеномика.
• Метатранскриптомика: оценка транскрипционно активных бактерий/грибов и экспрессии генов хозяина.
• Интеграция данных: многоуровневый факторный анализ и неконтролируемая кластеризация для идентификации эндотипов БЛД; экологический сетевой анализ для оценки структуры и взаимодействий микробиома.

Исходы:

• Основные: Качественная и количественная оценка состава и разнообразия вирома, включая динамику и персистенцию во временных точках.
• Вторичные: Определение эндотипов на основе микробиома; сети взаимодействий между вирусами, бактериями и грибами; и продольные сравнения микробного разнообразия и состава между анатомическими участками.