Impacto do Desenvolvimento do Viroma na Primeira Infância na Displasia Broncopulmonar em Neonatos Prematuros (ELVIRE)

A displasia broncopulmonar (DBP) é a complicação respiratória mais frequente em recém-nascidos extremamente prematuros. Está associada a uma mortalidade significativa e a uma morbilidade a longo prazo. A fisiopatologia da DBP é multifatorial, envolvendo inflamação e stresse oxidativo devido a exposições neonatais, como ventilação mecânica e infeções.

Estudos anteriores destacaram o papel da microbiota bacteriana respiratória no desenvolvimento da DBP, tendo sido demonstrados efeitos causais em modelos murinos. Além disso, o eixo intestino-pulmão está implicado na DBP, tendo sido observadas alterações no bacterioma e micobioma intestinal nas primeiras semanas de vida em recém-nascidos prematuros que posteriormente desenvolvem DBP.

Apesar do seu papel crucial na modulação da imunidade e da ecologia microbiana, o viroma tem sido largamente subestudado em recém-nascidos prematuros. As nossas observações recentes revelaram a existência de um viroma respiratório detetável ao nascimento na maioria dos recém-nascidos muito prematuros, e certos perfis de viroma e bacterioma foram associados a diferentes riscos de desenvolver DBP.

Hipótese:

A aquisição precoce e a dinâmica do viroma respiratório e intestinal nas primeiras semanas de vida influenciam a estrutura do microbioma e o desenvolvimento da imunidade pulmonar, contribuindo para a patogénese da DBP. Estas dinâmicas podem definir endotipos distintos de DBP com implicações para o prognóstico e a terapêutica.

Objetivos:

• Primário: Caracterizar a evolução do viroma respiratório e intestinal durante as primeiras 3 semanas de vida em recém-nascidos com <30 semanas de gestação, comparando aqueles que desenvolvem DBP com os que não desenvolvem.

• Secundários:

  • Definir diferentes endotipos de DBP e avaliar a sua associação com características demográficas e clínicas
  • Caracterizar a estrutura do microbioma dentro de cada endotipo.
  • Comparar a evolução do viroma, bacterioma e micobioma dentro e entre locais anatómicos.

Desenho do Estudo:

Uma coorte observacional prospetiva e monocêntrica de 40 recém-nascidos prematuros (<30 semanas de IG) que necessitam de suporte respiratório ao nascimento. Os recém-nascidos são classificados às 36 semanas de idade pós-menstrual (APM) em grupos com DBP e sem DBP com base na dependência de oxigénio.

Colheita de Amostras:

• Aspirados orofaríngeos: Colhidos aos dias 0, 7, 14 e 21.
• Amostras de fezes: Colhidas aos dias 7, 14 e 21.

Métodos:

• Análise do viroma: Metagenómica viral
• Metatranscriptómica: Avaliar bactérias/fungos ativos transcricionalmente e a expressão genética do hospedeiro.
• Integração de dados: Análise fatorial multi-ómica e agrupamento não supervisionado para identificar endotipos de DBP; análise de redes ecológicas para avaliar a estrutura do microbioma e interações.

Resultados:

• Primário: Avaliação qualitativa e quantitativa da composição e diversidade do viroma, incluindo dinâmicas e persistência ao longo dos tempos de colheita.
• Secundários: Definição de endotipos baseados no microbioma; redes de interação entre vírus, bactérias e fungos; e comparações longitudinais da diversidade e composição microbianas entre locais anatómicos.