Uno studio retrospettivo sui biomarcatori nel carcinoma polmonare non a piccole cellule

Lo scopo di questo studio è:

1. Per caratterizzare i tipi e la frequenza delle alterazioni molecolari della via del recettore del fattore di crescita epidermico (EGFR), FGFR4 e EML-ALK in pazienti asiatici con carcinoma polmonare non a piccole cellule
2. Identificare biomarcatori candidati di importanza nelle vie dell'EGFR e degli estrogeni

La maggior parte, se non tutte, le neoplasie umane, incluso il cancro del polmone, sono causate da alterazioni somatiche del genoma, che portano all'attivazione di oncogeni o all'inattivazione di geni oncosoppressori e ai conseguenti effetti oncogeni. Oltre alle mutazioni, l'aumento del numero di copie cromosomiche (mediante amplificazione o polisomia) e la metilazione del DNA sono altri meccanismi rispettivamente di attivazione dell'oncogene e di inattivazione del gene oncosoppressore.

Poco si sa sulla relazione tra questi oncogeni della famiglia EGFR e gli oncogeni recentemente descritti FGFR4 e il gene di fusione EML4-ALK. Dati recenti suggeriscono che esistono sottogruppi molecolarmente definiti di carcinoma polmonare non a piccole cellule (NSCLC) e possono essere utilizzati per prevedere la sensibilità agli agenti mirati (erlotinib o gefitinib) o alla chemioterapia citotossica (pemetrexato, gemcitabina, agenti del platino). Le scoperte che i recettori degli estrogeni sono presenti nei tumori polmonari e che gli estrogeni possono stimolare la crescita e la proliferazione dei tumori polmonari in vitro e in vivo sono provocatorie. Sono necessari ulteriori studi per valutare il ruolo degli estrogeni e di altri ormoni sessuali nel cancro del polmone.

Un'ulteriore comprensione degli indicatori molecolari della prognosi del cancro del polmone e la previsione del trattamento migliorerebbero lo sviluppo di farmaci e la selezione del trattamento del paziente.

Il tessuto tumorale NSCLC archiviato incluso in paraffina e fresco congelato sarà ottenuto rispettivamente tramite il Department of Pathology e il National University Tissue Repository. Le caratteristiche clinico-patologiche saranno ottenute dalla cartella clinica, dalla patologia e dal deposito dei tessuti. Il DNA sarà isolato utilizzando tecniche standard. Sequenziamento dei geni nella via di segnalazione dell'EGFR: EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K e BRAF nonché FGFR4. I vetrini non colorati dal tessuto incluso in paraffina saranno ottenuti e sottoposti a ibridazione fluorescente in vitro (FISH) per breakpoint nei geni EML4 e ALK come descritto in precedenza. Per i casi che sono stati congelati a scatto, l'RNA verrà estratto e le fusioni EML4-ALK saranno confermate utilizzando RT-PCR e primer pre-specificati. Analizzare l'espressione di proteine ​​di presunta rilevanza per la funzione dell'EGFR (come EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, ciclina D1, C/EBPa), effetti a valle dell'EGFR: proliferazione cellulare (Ki-67 ), angiogenesi (CD34, VEGF-A), apoptosi (bcl-2), metastasi e influenza ormonale (recettori per estrogeni e progesterone, aromatasi), verrà utilizzata la tecnologia TMA. Verrà analizzato lo stato dei geni oncosoppressori PTEN e C/EBPa.