Significato clinico dell'infezione da virus respiratorio acquisito in comunità e analisi longitudinale del microbioma polmonare nel trapianto di polmone

Titolo: Significato clinico dell'infezione da virus respiratorio acquisito in comunità e analisi longitudinale del microbioma polmonare nel trapianto di polmone.

Sfondo: L'infezione influisce sulla prognosi a breve termine dei pazienti con trapianto di polmone e la disfunzione cronica del trapianto polmonare (CLAD) limita la loro sopravvivenza a lungo termine. È importante fornire un supporto più teorico per la diagnosi precoce e il trattamento dell'infezione acuta del tratto respiratorio e del CLAD in pazienti con trapianto di polmone.

Obiettivi dello studio: valutare il significato clinico dell'infezione da virus respiratorio acquisito in comunità (CARV) nei pazienti con trapianto di polmone; esplorare le dinamiche del microbioma polmonare entro un anno dal trapianto di polmone; trovare la relazione tra microbioma polmonare e CLAD.

Disegno dello studio: uno studio prospettico e longitudinale, che segue i pazienti per 3 anni.

Dimensione del campione: 100 casi. Metodi di studio: il rilevamento di CARV per i campioni respiratori viene eseguito durante l'infezione acuta e la ripetizione del test di routine nei pazienti dopo il trapianto di polmone, seguendo i pazienti che hanno risultati positivi per analizzare i tassi di progressione verso l'infezione del tratto respiratorio inferiore, il tasso di mortalità entro 90 giorni e il rischio fattori associati alla progressione e alla morte. Per HRV/CoVs/HBoV che rilevano pazienti positivi, raccogliere consecutivamente campioni respiratori per quantificare la carica virale e combinare la sierologia del virus per confermare ulteriormente la loro patogenicità sull'ospite. Completare un'indagine longitudinale sull'RNA ribosomiale 16S e sulla metagenomica del microbioma polmonare su campioni respiratori raccolti da test di routine o da ripetere il test (prima dell'operazione, 24 ore dopo l'operazione, giorno 3, giorno 7, settimana 2, settimana 3, mese 1, mese 3, mese 6, mese 9, mese 12, mese 18, mese 24, mese 30, mese 36) per esplorare la dinamica del microbioma polmonare entro un anno dal trapianto di polmone e trovare la relazione tra microbioma polmonare e CLAD dopo 3 anni di follow-up. Inoltre, raccogliere il sangue periferico di alcuni pazienti per il trascrittoma e/o sequenziamento dell'intero genoma per lo screening dei geni di suscettibilità dell'ospite.