Esofago di Barrett e adenocarcinoma esofageo, alla ricerca di biomarcatori diagnostici affidabili basati sul plasma dell'RNA

Sviluppando nuovi strumenti per la valutazione del rischio dell'esofago di Barrett (BE) e dell'adenocarcinoma esofageo (EAC) in una popolazione a rischio, i ricercatori si aspettano che la diagnosi possa essere fatta in una fase precedente con conseguente miglioramento della sopravvivenza a 5 anni. Verrà condotto uno studio di profilazione dell'RNA proof-of-concept in 20 pazienti BE e EAC in cui verranno confrontati 2 biomateriali (tessuto e plasma) e 2 biotopi di RNA (micro RNA e RNA messaggero). Per ottenere dati di alta qualità verrà utilizzata la metodologia precedentemente convalidata sul sequenziamento della cattura di piccoli RNA e RNA messaggero sia su tessuto che su plasma. L'analisi dell'espressione differenziale sarà effettuata su campioni di tessuto e plasma. Verrà effettuato un ulteriore approfondito data mining, concentrandosi tra l'altro sulle informazioni strutturali codificate nel trascrittoma e costruendo un classificatore multifunzionale. Questi risultati saranno convalidati in un'ampia coorte di convalida, seguita dallo sviluppo di un test quantitativo di reazione a catena della polimerasi (qPCR) di livello clinico, pronto per essere testato in una coorte indipendente.