非後天性遺伝性疾患における突然変異の探索とその健康経済と生活の質への影響 (MENDEL)
MENDEL 研究では、遺伝子パネルまたは全ゲノム配列決定 (WGS) の使用が次のことを行うかどうかを調査します。
- 診断率を向上させ、これにより 2 つの診断アプローチのパフォーマンスを比較します (遺伝子パネルと WGS)。
- 診断プロセスの早い段階で前記配列決定アプローチを使用すると、医療費が削減されるかどうかを調査し、
- その結果、患者とその両親の生活の質が向上します。
調査の概要
詳細な説明
患者は、オットー ヒューブナー センター、ベルリン希少疾患センター、ドイツのベルリンシャリテ大学医学研究所の遺伝医学およびヒト遺伝学研究所の入院および外来診療所から募集されます。 インフォームド コンセントに続いて、発端者から 5 ml の EDTA 血液を、各親から 10 ml の血液を採取します。 疾患関連の表現型情報、および以前の診断テストと手順の結果は、調査訪問＃1の一部として記録されます。
[1] 視察 #1
- 医学的遺伝学の身体検査が行われます。 詳細な臨床症状 (表現型) は、ヒト表現型オントロジー (HPO) 用語を使用して記録されます。
- 詳細な血統書が描かれます。
- 病気の発症年齢が決定されます。
- 以前の診断テストと手順の結果、および入院が記録されます。
- 両親は、希少疾患に適応した検証済みの標準化された生活の質に関する質問票に記入するよう求められます。 アンケートは、オンラインまたは紙の形式で入手できます。
[2] スタディビジット #2a (オプション)
この研究訪問は、遺伝子パネル配列決定により、重要性が不明なバリアントが特定された場合にのみ行われます。この場合、その病原性を判断するために追加情報が必要になります (例: 確認生化学検査、追加情報の収集）。 関連する調査結果が議論され、追加のテストの性質と必要性が説明されます。
[3] スタディビジット #2b (オプション)
この研究訪問は、WGS が、その病原性を判断するために追加情報が必要な不確かな重要性のバリアントを特定した場合にのみ行われます > 研究訪問 #2a を参照してください。
[4]視察#3（成果発表会）
結果は、遺伝カウンセリング セッションのコンテキストで返されます。
[5] 研究訪問 #4 (研究訪問 #3 の 6 か月後)
両親は、希少疾患に適応した検証済みの標準化された生活の質に関する質問票に再び記入するよう求められます。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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Berlin、ドイツ、13353
- Department of General Pediatrics, Charité-Universitätsmedizin
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Berlin、ドイツ、13353
- Department of Neuropediatrics, Charité-Universitätsmedizin
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Berlin、ドイツ、13353
- Institute of Medical Genetics and Human Genetics, Charité-Universitätsmedizin
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
指標患者：遺伝性疾患の疑いのある子供（新生児から18歳まで）
両親：各指標症例の生物学的母親と父親。
説明
包含基準:
- 診断：遺伝性疾患の疑い。 (以下の基準のうち 1 つだけが必要です。) [1.1] 類似の表現型を持つ家族または[1.2] 少なくとも2つの影響を受けた臓器系または[1.3] 複数の疾患原因遺伝子に関連することが知られている 1 つの影響を受けた臓器系 (例: QT延長症候群）または[1.4] 複数の先天異常
- フェーズ (分離分析) を確認するため、または後の時点でトリオの WGS を実行するために、両方の親が採血に利用できる必要があります。
- 年齢：誕生から18歳まで
- 性別: 両方の性別が含まれます
除外基準:
- 表現型が後天性疾患によるものであるという疑い
- 臨床試験の設定における遺伝子検査について、両親またはすべての法定後見人からのインフォームドコンセントがない。
- 既知の単一遺伝子の原因による疾患の臨床診断。 フェニルケトン尿症または嚢胞性線維症。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：家族ベース
- 時間の展望：見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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インデックス患者
遺伝性疾患の疑いがある出生から 18 歳までの子供。 調査: 最初の遺伝子パネル シーケンスおよび変異が見つからない場合 > 全ゲノム シーケンス (WGS) |
Online Mendelian Inheritance of Man (OMIM) データベースにリストされている 2942 の疾患遺伝子の濃縮およびパネル シーケンス。
Gene Panel Sequencing で疾患の原因となる変異が特定されなかった場合は、発端者と両親の全ゲノムシーケンス。
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初発患者の両親
初発患者の両親。 調査: 初発患者の遺伝子パネル配列決定により変異が見つからない場合は、全ゲノム配列決定 (WGS)。 |
Gene Panel Sequencing で疾患の原因となる変異が特定されなかった場合は、発端者と両親の全ゲノムシーケンス。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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3089 の既知の疾患遺伝子の遺伝子パネル シーケンスによる診断結果。
時間枠：6ヶ月。
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PhenIX ソフトウェアを使用した遺伝子パネル シーケンスおよび解析により、200 人の患者で特定できる変異を引き起こすことが確認された疾患の数。
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6ヶ月。
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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生活の質
時間枠：2年
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分子遺伝学的診断および分子遺伝学的診断を受ける前後の両親の生活の質の評価。
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2年
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ルーチンの臨床診断における次世代シーケンス (NGS) パイプラインの管理性
時間枠：2年
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家族の募集から最終的な遺伝カウンセリングまでの期間[月]の計算。
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2年
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NGSの健康経済
時間枠：2年
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「標準診断」のコストと、診断プロセスの初期段階での遺伝子パネル配列決定または WGS の使用の比較。
遺伝子パネル シーケンス/WGS の使用によって発生したコストと比較した、「標準的な診断アプローチ」によって各患者に発生したコストの健康経済分析。
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2年
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者：Markus Schuelke, M.D.、Department of Neuropediatrics, Charité
- 主任研究者：Stefan Mundlos, M.D.、Institute of Medical Genetics and of Human Genetics, Charité
- 主任研究者：Heiko Krude, M.D.、Department of General Pediatrics, Charité
出版物と役立つリンク
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- EA2_107_14
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