Mutaatioiden tutkiminen hankkimattomissa geneettisissä häiriöissä ja sen vaikutukset terveystalouteen ja elämänlaatuun (MENDEL)
MENDEL-tutkimuksessa selvitetään, onko geenipaneelin tai koko genomin sekvensoinnin (WGS) käyttö:
- parantaa diagnoosin määrää ja vertailla tätä kautta kahden diagnostisen lähestymistavan suorituskykyä (geenipaneeli vs. WGS),
- tutkia, johtaako mainittujen sekvensointimenetelmien käyttö diagnoosiprosessin varhaisessa vaiheessa terveydenhuoltokulujen vähenemiseen, ja
- parantaa potilaiden ja heidän vanhempiensa elämänlaatua.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Potilaat rekrytoidaan Otto Heubner -keskuksen, Berliinin harvinaisten sairauksien keskuksen sekä Charité-Universitätsmedizin Berlinin lääketieteellisen genetiikan ja ihmisgenetiikan instituutin poliklinikoista, Saksasta. Tietoisen suostumuksen jälkeen otetaan 5 ml EDTA-verta indeksitapauksesta ja 10 ml verta kummaltakin vanhemmalta. Tautiin liittyvät fenotyyppitiedot ja aikaisempien diagnostisten testien ja toimenpiteiden tulokset tallennetaan osana tutkimuskäyntiä #1.
[1] Opintokäynti #1
- Lääketieteellinen geneettinen fyysinen tutkimus suoritetaan. Yksityiskohtaiset kliiniset oireet (fenotyyppi) kirjataan käyttäen Human Phenotype Ontology (HPO) -terminologiaa.
- Tarkempi sukutaulu arvotaan.
- Taudin alkamisikä määritetään.
- Aiempien diagnostisten testien ja toimenpiteiden tulokset sekä sairaalassaolot kirjataan.
- Vanhempia pyydetään täyttämään validoitu, standardoitu elämänlaatukysely, joka on mukautettu harvinaisia sairauksia varten. Kyselylomake on saatavilla verkossa tai paperimuodossa.
[2] Opintokäynti #2a (valinnainen)
Tämä tutkimuskäynti tehdään vain siinä tapauksessa, että geenipaneelisekvensointi tunnistaa epävarman merkityksen variantin, josta tarvittaisiin lisätietoja sen patogeenisuuden määrittämiseksi (esim. vahvistava biokemiallinen testaus, lisätietojen kerääminen). Asiaankuuluvista tutkimustuloksista keskustellaan ja lisätestauksen luonne ja tarpeellisuus selitetään.
[3] Opintokäynti #2b (valinnainen)
Tämä tutkimuskäynti suoritetaan vain siinä tapauksessa, että WGS tunnistaa epävarman merkityksen muunnelman, josta tarvitaan lisätietoja sen patogeenisyyden määrittämiseksi > katso tutkimuskäynti #2a.
[4] Opintokäynti #3 (tulosistunto)
Tulokset palautetaan geneettisen neuvonnan yhteydessä.
[5] Opintokäynti #4 (6 kuukautta opintokäynnin #3 jälkeen)
Vanhempia pyydetään täyttämään uudelleen validoitu, standardoitu harvinaisiin sairauksiin mukautettu elämänlaatukysely.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Berlin, Saksa, 13353
- Department of General Pediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Saksa, 13353
- Department of Neuropediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Saksa, 13353
- Institute of Medical Genetics and Human Genetics, Charité-Universitätsmedizin
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Indeksipotilaat: Lapset (vastasyntyneistä 18-vuotiaisiin), joilla on epäilty geneettinen sairaus
Vanhemmat: jokaisen indeksitapauksen biologinen äiti ja isä.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Diagnoosi: geneettisen sairauden epäily. (Vain yksi seuraavista kriteereistä vaaditaan.) [1.1] Perheenjäsen(et), joilla on samanlainen fenotyyppi TAI [1.2] Vähintään kaksi vahingoittunutta elinjärjestelmää TAI [1.3] Yksi vahingoittunut elinjärjestelmä, jonka tiedetään liittyvän useisiin sairauksia aiheuttaviin geeneihin (esim. pitkä QT-oireyhtymä) TAI [1.4] Useita synnynnäisiä epämuodostumia
- Molempien vanhempien on oltava käytettävissä verikokeessa vaiheen (segregaatioanalyysi) vahvistamiseksi tai kolmikon WGS:n suorittamiseksi myöhempänä ajankohtana.
- Ikä: syntymästä 18 vuoden ikään asti
- Sukupuoli: Molemmat sukupuolet otetaan mukaan
Poissulkemiskriteerit:
- Epäillään, että fenotyyppi johtuu hankitusta sairaudesta
- Molemmilta vanhemmilta tai kaikilta laillisilta huoltajilta puuttuu tietoinen suostumus geneettiseen testaukseen kliinisen tutkimuksen yhteydessä.
- Kliininen diagnoosi sairaudesta, jonka syy on tunnettu monogeeninen, esim. Fenyyliketonuria tai kystinen fibroosi.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Perhepohjainen
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Indeksi potilaat
Lapset syntymästä 18-vuotiaisiin, joilla on epäilty geneettinen sairaus. Tutkimus: Ensimmäinen geenipaneelin sekvensointi ja jos mutaatiota ei löydy > Koko genomisekvenssi (WGS) |
Online Mendelian Heritance of Man (OMIM) -tietokannassa lueteltujen 2942 sairausgeenin rikastus ja paneelisekvensointi.
Indeksitapauksen ja molempien vanhempien koko genomisekvenssi siinä tapauksessa, että geenipaneelisekvensointi ei tunnistanut sairautta aiheuttavaa mutaatiota.
|
|
Indeksipotilaan vanhemmat
Indeksipotilaan molemmat vanhemmat. Tutkimus: Koko genomisekvenssi (WGS), jos indeksipotilaan geenipaneelisekvensointi ei löydä mutaatiota. |
Indeksitapauksen ja molempien vanhempien koko genomisekvenssi siinä tapauksessa, että geenipaneelisekvensointi ei tunnistanut sairautta aiheuttavaa mutaatiota.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Diagnostinen saanto 3089 tunnetun sairausgeenin geenipaneelisekvensoinnilla.
Aikaikkuna: 6 kuukautta.
|
Vahvistettujen tautia aiheuttavien mutaatioiden määrä, joka voidaan tunnistaa 200 potilaasta geenipaneelin sekvensoinnin ja PhenIX-ohjelmistolla tehdyn analyysin jälkeen.
|
6 kuukautta.
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Elämänlaatu
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Vanhempien elämänlaadun arviointi ennen ja jälkeen molekyylidiagnostiikan ja molekyyligeneettisen diagnoosin vastaanottamisen.
|
2 vuotta
|
|
Seuraavan sukupolven sekvensointiputken (NGS) hallittavuus rutiininomaisessa kliinisessä diagnostiikassa
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Perheen rekrytoinnin ja lopullisen geneettisen neuvonnan välisen ajanjakson [kuukautta] laskeminen.
|
2 vuotta
|
|
NGS:n terveystalous
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
"Vakiodiagnostiikan" kustannusten vertailu geenipaneelisekvensoinnin tai WGS:n käyttöön diagnoosiprosessin varhaisessa vaiheessa.
Terveystaloudellinen analyysi kullekin potilaalle "standardin diagnostisen lähestymistavan" avulla aiheutuneista kustannuksista verrattuna kustannuksiin, jotka aiheutuvat geenipaneelisekvensoinnin/WGS:n käytöstä.
|
2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Markus Schuelke, M.D., Department of Neuropediatrics, Charité
- Päätutkija: Stefan Mundlos, M.D., Institute of Medical Genetics and of Human Genetics, Charité
- Päätutkija: Heiko Krude, M.D., Department of General Pediatrics, Charité
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- EA2_107_14
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .