Esplorazione delle mutazioni nei disturbi genetici non acquisiti e il suo impatto sull'economia sanitaria e sulla qualità della vita (MENDEL)
Lo studio MENDEL indagherà se l'uso del pannello genico o del sequenziamento dell'intero genoma (WGS) consentirà di:
- migliorare il tasso di diagnosi e attraverso questo confrontare le prestazioni dei due approcci diagnostici (pannello genetico vs. WGS),
- indagare se l'uso di detti approcci di sequenziamento all'inizio del processo diagnostico si traduca in una riduzione della spesa sanitaria, e
- migliorare la qualità della vita dei pazienti e dei loro genitori.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
I pazienti verranno reclutati dalle cliniche ospedaliere e ambulatoriali presso il Centro Otto Heubner, il Centro per le malattie rare di Berlino e l'Istituto di genetica medica e genetica umana presso la Charité-Universitätsmedizin di Berlino, Germania. Dopo il consenso informato, verranno prelevati 5 ml di sangue EDTA dal caso indice e 10 ml di sangue da ciascun genitore. Le informazioni sul fenotipo relative alla malattia e l'esito di precedenti test e procedure diagnostici saranno registrati come parte della visita di studio n. 1.
[1] Visita di studio n. 1
- Verrà eseguito un fisico di genetica medica. I sintomi clinici dettagliati (fenotipo) saranno registrati utilizzando la terminologia dell'ontologia del fenotipo umano (HPO).
- Verrà redatto un pedigree dettagliato.
- Sarà determinata l'età di insorgenza della malattia.
- Verranno registrati i risultati di precedenti test e procedure diagnostiche, nonché le degenze ospedaliere.
- Ai genitori verrà chiesto di completare un questionario convalidato e standardizzato sulla qualità della vita adattato per le malattie rare. Il questionario è disponibile online o in formato cartaceo.
[2] Visita di studio #2a (opzionale)
Questa visita di studio avrà luogo solo nel caso in cui il sequenziamento del pannello genetico identifichi una variante di significato incerto, per la quale sarebbero necessarie ulteriori informazioni per determinarne la patogenicità (ad es. test biochimici di conferma, raccolta di informazioni aggiuntive). Verranno discussi i risultati della ricerca pertinente e verranno spiegate la natura e la necessità dei test aggiuntivi.
[3] Visita di studio n. 2b (facoltativa)
Questa visita di studio avrà luogo solo nel caso in cui WGS identifichi una variante di significato incerto per la quale sono necessarie ulteriori informazioni per determinarne la patogenicità > vedere Visita di studio n. 2a.
[4] Visita di studio n. 3 (sessione risultati)
I risultati saranno restituiti nel contesto di una sessione di consulenza genetica.
[5] Visita di studio n. 4 (6 mesi dopo la visita di studio n. 3)
Ai genitori verrà chiesto di completare nuovamente il questionario convalidato e standardizzato sulla qualità della vita adattato per le malattie rare.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Berlin, Germania, 13353
- Department of General Pediatrics, Charité-Universitätsmedizin
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Berlin, Germania, 13353
- Department of Neuropediatrics, Charité-Universitätsmedizin
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Berlin, Germania, 13353
- Institute of Medical Genetics and Human Genetics, Charité-Universitätsmedizin
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Pazienti indice: bambini (dai neonati ai 18 anni) che presentano una sospetta malattia genetica
Genitori: madre e padre biologici di ciascun caso indice.
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Diagnosi: sospetto di malattia genetica. (È richiesto solo uno dei seguenti criteri.) [1.1] Membri della famiglia con fenotipo simile OPPURE [1.2] Almeno due sistemi di organi interessati OPPURE [1.3] Un sistema di organi interessato noto per essere associato a più geni che causano malattie (ad es. sindrome del QT lungo) OPPURE [1.4] Difetti congeniti multipli
- Entrambi i genitori devono essere disponibili per il prelievo di sangue al fine di confermare la fase (analisi di segregazione) o per eseguire WGS del trio in un secondo momento.
- Età: dalla nascita fino all'età di 18 anni
- Sesso: saranno inclusi entrambi i sessi
Criteri di esclusione:
- Sospetto che il fenotipo sia dovuto a una malattia acquisita
- Consenso informato mancante di entrambi i genitori o di tutti i tutori legali per i test genetici nell'ambito di una sperimentazione clinica.
- Diagnosi clinica di una malattia con causa monogenica nota, ad es. Fenilchetonuria o fibrosi cistica.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Basato sulla famiglia
- Prospettive temporali: Prospettiva
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Indice pazienti
Bambini di età compresa tra la nascita e i 18 anni che manifestano una sospetta malattia genetica. Indagine: primo sequenziamento del pannello genico e se non viene trovata alcuna mutazione > sequenziamento dell'intero genoma (WGS) |
Arricchimento e sequenziamento del pannello di 2942 geni della malattia elencati nel database Online Mendelian Inheritance of Man (OMIM).
Sequenziamento dell'intero genoma del caso indice e di entrambi i genitori nel caso in cui il sequenziamento del pannello genico non abbia identificato una mutazione patogenetica.
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Genitori del paziente indice
Entrambi i genitori del paziente indice. Indagine: Sequenziamento dell'intero genoma (WGS) se non viene trovata alcuna mutazione mediante il sequenziamento del pannello genico del paziente indice. |
Sequenziamento dell'intero genoma del caso indice e di entrambi i genitori nel caso in cui il sequenziamento del pannello genico non abbia identificato una mutazione patogenetica.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Rendimento diagnostico attraverso il sequenziamento del pannello genico di 3089 geni noti della malattia.
Lasso di tempo: 6 mesi.
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Il numero di mutazioni confermate che causano malattie che possono essere identificate in 200 pazienti in seguito al sequenziamento e all'analisi del pannello genico con il software PhenIX.
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6 mesi.
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Qualità della vita
Lasso di tempo: 2 anni
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Valutazione della qualità di vita dei genitori prima e dopo la diagnostica molecolare e ricezione di una diagnosi genetica molecolare.
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2 anni
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Gestibilità di una pipeline di sequenziamento di nuova generazione (NGS) nella diagnostica clinica di routine
Lasso di tempo: 2 anni
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Calcolo della durata [mesi] tra il reclutamento di una famiglia e la consulenza genetica finale.
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2 anni
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Economia sanitaria di NGS
Lasso di tempo: 2 anni
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Confronto del costo della "diagnostica standard" rispetto all'uso del sequenziamento del pannello genico o WGS in una fase iniziale del processo diagnostico.
Analisi economica sanitaria dei costi sostenuti per ciascun paziente attraverso "l'approccio diagnostico standard" rispetto ai costi sostenuti attraverso l'uso del sequenziamento del pannello genico/WGS.
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2 anni
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Collaboratori e investigatori
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Markus Schuelke, M.D., Department of Neuropediatrics, Charité
- Investigatore principale: Stefan Mundlos, M.D., Institute of Medical Genetics and of Human Genetics, Charité
- Investigatore principale: Heiko Krude, M.D., Department of General Pediatrics, Charité
Pubblicazioni e link utili
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Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Effettivo)
Completamento dello studio (Effettivo)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stima)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- EA2_107_14
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