Badanie mutacji w nienabytych chorobach genetycznych i ich wpływ na ekonomię zdrowia i jakość życia (MENDEL)
Badanie MENDEL zbada, czy zastosowanie panelu genów lub sekwencjonowania całego genomu (WGS):
- poprawić wskaźnik diagnozy i dzięki temu porównać wyniki dwóch podejść diagnostycznych (panel genetyczny vs. WGS),
- zbadać, czy zastosowanie wspomnianych metod sekwencjonowania na wczesnym etapie procesu diagnostycznego skutkuje zmniejszeniem wydatków na opiekę zdrowotną, oraz
- skutkują poprawą jakości życia pacjentów i ich rodziców.
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Pacjenci będą rekrutowani z klinik stacjonarnych i ambulatoryjnych Centrum Otto Heubnera, Berlińskiego Centrum Chorób Rzadkich oraz Instytutu Genetyki Medycznej i Genetyki Człowieka na Charité-Universitätsmedizin Berlin, Niemcy. Po uzyskaniu świadomej zgody, 5 ml krwi EDTA zostanie pobrane z przypadku indeksowego i 10 ml krwi od każdego z rodziców. Informacje dotyczące fenotypu choroby oraz wyniki poprzednich testów i procedur diagnostycznych zostaną zapisane w ramach wizyty studyjnej nr 1.
[1] Wizyta studyjna nr 1
- Zostanie przeprowadzone badanie genetyki medycznej. Szczegółowe objawy kliniczne (fenotyp) zostaną zapisane przy użyciu terminologii Human Phenotype Ontology (HPO).
- Zostanie sporządzony szczegółowy rodowód.
- Określony zostanie wiek zachorowania.
- Rejestrowane będą wyniki poprzednich badań i procedur diagnostycznych oraz pobyty w szpitalu.
- Rodzice zostaną poproszeni o wypełnienie zwalidowanego, wystandaryzowanego kwestionariusza jakości życia dostosowanego do rzadkich chorób. Ankieta jest dostępna online lub w formie papierowej.
[2] Wizyta studyjna #2a (opcjonalnie)
Ta wizyta studyjna odbędzie się wyłącznie w przypadku, gdy sekwencjonowanie panelu genów zidentyfikuje wariant o niepewnym znaczeniu, w przypadku gdy potrzebne będą dodatkowe informacje w celu określenia jego patogeniczności (np. potwierdzające testy biochemiczne, zebranie dodatkowych informacji). Omówione zostaną istotne wyniki badań oraz wyjaśniona zostanie natura i konieczność dodatkowych badań.
[3] Wizyta studyjna #2b (opcjonalnie)
Ta wizyta studyjna odbędzie się tylko w przypadku, gdy WGS zidentyfikuje wariant o niepewnym znaczeniu, w przypadku którego potrzebne są dodatkowe informacje w celu określenia jego patogeniczności > patrz Wizyta studyjna nr 2a.
[4] Wizyta studyjna nr 3 (sesja wynikowa)
Wyniki zostaną zwrócone w kontekście sesji poradnictwa genetycznego.
[5] Wizyta studyjna nr 4 (6 miesięcy po wizycie studyjnej nr 3)
Rodzice zostaną poproszeni o ponowne wypełnienie zwalidowanego, wystandaryzowanego kwestionariusza jakości życia dostosowanego do rzadkich chorób.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Berlin, Niemcy, 13353
- Department of General Pediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Niemcy, 13353
- Department of Neuropediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Niemcy, 13353
- Institute of Medical Genetics and Human Genetics, Charité-Universitätsmedizin
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Indeksuj pacjentów: Dzieci (w wieku od noworodka do 18 lat) z podejrzeniem choroby genetycznej
Rodzice: biologiczna matka i ojciec każdego przypadku indeksowego.
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Diagnoza: Podejrzenie choroby genetycznej. (Wymagane jest tylko jedno z poniższych kryteriów.) [1.1] Członek rodziny o podobnym fenotypie LUB [1.2] Co najmniej dwa dotknięte układy narządów LUB [1.3] Jeden dotknięty układ narządu, o którym wiadomo, że jest powiązany z wieloma genami powodującymi choroby (np. zespół długiego QT) LUB [1.4] Mnogie wady wrodzone
- Oboje rodzice muszą być dostępni do pobrania krwi w celu potwierdzenia fazy (analiza segregacji) lub w celu wykonania WGS trio w późniejszym czasie.
- Wiek: od urodzenia do 18 roku życia
- Płeć: Obie płcie zostaną uwzględnione
Kryteria wyłączenia:
- Podejrzenie, że fenotyp jest spowodowany chorobą nabytą
- Brak świadomej zgody obojga rodziców lub wszystkich opiekunów prawnych na wykonanie badań genetycznych w ramach badania klinicznego.
- Rozpoznanie kliniczne choroby o znanej przyczynie monogenowej, np. Fenyloketonuria lub mukowiscydoza.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Oparte na rodzinie
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Indeksuj pacjentów
Dzieci w wieku od urodzenia do 18 lat z podejrzeniem choroby genetycznej. Dochodzenie: Pierwsze sekwencjonowanie panelu genów i jeśli nie znaleziono mutacji > Sekwencjonowanie całego genomu (WGS) |
Wzbogacanie i sekwencjonowanie panelowe 2942 genów chorobowych wymienionych w bazie danych Online Mendelian Inheritance of Man (OMIM).
Sekwencjonowanie całego genomu przypadku indeksu i obojga rodziców w przypadku, gdy sekwencjonowanie panelu genów nie zidentyfikowało mutacji powodującej chorobę.
|
|
Rodzice pacjenta indeksu
Oboje rodzice pacjenta z indeksu. Badanie: Sekwencjonowanie całego genomu (WGS), jeśli nie zostanie wykryta żadna mutacja za pomocą sekwencjonowania panelu genów pacjenta z indeksem. |
Sekwencjonowanie całego genomu przypadku indeksu i obojga rodziców w przypadku, gdy sekwencjonowanie panelu genów nie zidentyfikowało mutacji powodującej chorobę.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Wydajność diagnostyczna dzięki sekwencjonowaniu panelu genów 3089 genów znanych chorób.
Ramy czasowe: 6 miesięcy.
|
Liczba potwierdzonych mutacji powodujących chorobę, które można zidentyfikować u 200 pacjentów po sekwencjonowaniu panelu genów i analizie za pomocą oprogramowania PhenIX.
|
6 miesięcy.
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Jakość życia
Ramy czasowe: 2 lata
|
Ocena jakości życia rodziców przed i po diagnostyce molekularnej oraz odbiór molekularnej diagnozy genetycznej.
|
2 lata
|
|
Łatwość zarządzania potokiem sekwencjonowania nowej generacji (NGS) w rutynowej diagnostyce klinicznej
Ramy czasowe: 2 lata
|
Obliczenie czasu trwania [miesięcy] pomiędzy rekrutacją rodziny a ostatecznym poradnictwem genetycznym.
|
2 lata
|
|
Ekonomia zdrowia NGS
Ramy czasowe: 2 lata
|
Porównanie kosztów „diagnostyki standardowej” z wykorzystaniem sekwencjonowania panelu genów lub WGS na wczesnym etapie procesu diagnostycznego.
Analiza ekonomiczna zdrowia kosztów ponoszonych przez każdego pacjenta w ramach „standardowego podejścia diagnostycznego” w porównaniu z kosztami ponoszonymi w wyniku zastosowania sekwencjonowania panelu genów/WGS.
|
2 lata
|
Współpracownicy i badacze
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Markus Schuelke, M.D., Department of Neuropediatrics, Charité
- Główny śledczy: Stefan Mundlos, M.D., Institute of Medical Genetics and of Human Genetics, Charité
- Główny śledczy: Heiko Krude, M.D., Department of General Pediatrics, Charité
Publikacje i pomocne linki
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Oszacować)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- EA2_107_14
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .