Mutationsudforskning i ikke-erhvervede, genetiske lidelser og dens indvirkning på sundhedsøkonomi og livskvalitet (MENDEL)
MENDEL-studiet vil undersøge, om brugen af genpanel eller helgenom-sekventering (WGS) vil:
- forbedre diagnosehastigheden og gennem dette sammenligne ydeevnen af de to diagnostiske tilgange (genpanel vs. WGS),
- undersøge, om brugen af nævnte sekventeringsmetoder tidligt i den diagnostiske proces resulterer i reducerede sundhedsudgifter, og
- resultere i en forbedret livskvalitet for patienterne og deres forældre.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Patienter vil blive rekrutteret fra in- og ambulante klinikker på Otto Heubner Center, Berlin Center for Sjældne Sygdomme og Institut for Medicinsk Genetik og Human Genetik ved Charité-Universitätsmedizin Berlin, Tyskland. Efter informeret samtykke indhentes 5 ml EDTA-blod fra indekset og 10 ml blod fra hver forælder. Sygdomsrelaterede fænotypeoplysninger og resultatet af tidligere diagnostiske tests og procedurer vil blive registreret som en del af studiebesøg #1.
[1] Studiebesøg #1
- En medicinsk genetik fysisk vil blive udført. Detaljerede kliniske symptomer (fænotype) vil blive registreret ved hjælp af Human Phenotype Ontology (HPO) terminologi.
- Der vil blive tegnet en detaljeret stamtavle.
- Alder for sygdomsdebut vil blive bestemt.
- Resultater fra tidligere diagnostiske tests og procedurer samt hospitalsophold vil blive registreret.
- Forældrene vil blive bedt om at udfylde et valideret, standardiseret livskvalitetsspørgeskema tilpasset til sjældne sygdomme. Spørgeskemaet er tilgængeligt online eller i papirform.
[2] Studiebesøg #2a (valgfrit)
Dette studiebesøg vil kun finde sted i tilfælde af, at genpanelsekventering identificerer en variant af usikker betydning, hvor yderligere information ville være nødvendig for at bestemme dens patogenicitet (f. bekræftende biokemisk testning, indsamling af yderligere information). Relevante forskningsresultater vil blive diskuteret, og arten og nødvendigheden af den yderligere test vil blive forklaret.
[3] Studiebesøg #2b (valgfrit)
Dette studiebesøg vil kun finde sted i tilfælde af, at WGS identificerer en variant af usikker betydning, hvor yderligere information er nødvendig for at bestemme dens patogenicitet > se undersøgelsesbesøg #2a.
[4] Studiebesøg #3 (resultatsession)
Resultater vil blive returneret i forbindelse med en genetisk rådgivningssession.
[5] Studiebesøg #4 (6 måneder efter Studiebesøg #3)
Forældrene vil blive bedt om at udfylde det validerede, standardiserede livskvalitetsspørgeskema tilpasset til sjælden sygdom igen.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Berlin, Tyskland, 13353
- Department of General Pediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Tyskland, 13353
- Department of Neuropediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Tyskland, 13353
- Institute of Medical Genetics and Human Genetics, Charité-Universitätsmedizin
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Indekspatienter: Børn (nyfødte til 18 år), som har en mistænkt genetisk lidelse
Forældre: biologisk mor og far i hver indekssag.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Diagnose: Mistanke om genetisk sygdom. (Kun et af følgende kriterier er påkrævet.) [1.1] Familiemedlem(mer) med lignende fænotype ELLER [1.2] Mindst to berørte organsystemer ELLER [1.3] Et påvirket organsystem, der vides at være forbundet med flere sygdomsfremkaldende gener (f. langt QT-syndrom) ELLER [1,4] Flere fødselsdefekter
- Begge forældre skal være tilgængelige for blodudtagning for at bekræfte fase (segregationsanalyse) eller for at udføre WGS af trioen på et senere tidspunkt.
- Alder: fra fødslen til 18 år
- Køn: Begge køn vil blive inkluderet
Ekskluderingskriterier:
- Mistanke om, at fænotypen skyldes en erhvervet sygdom
- Manglende informeret samtykke fra begge forældre eller fra alle juridiske værger til genetisk testning i forbindelse med et klinisk forsøg.
- Klinisk diagnosticering af en sygdom med kendt monogen årsag, f.eks. Fenylketonuri eller cystisk fibrose.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Familiebaseret
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Indeks patienter
Børn mellem fødslen og 18 år, der viser sig med en formodet genetisk lidelse. Undersøgelse: Første genpanel-sekventering, og hvis der ikke findes nogen mutation > Whole Genome Sequencing (WGS) |
Berigelse for og panelsekventering af 2942 sygdomsgener opført i databasen Online Mendelian Inheritance of Man (OMIM).
Whole Genome Sequencing af indekstilfældet og af begge forældre i tilfælde af, at Gene Panel Sequencing ikke identificerede en sygdomsfremkaldende mutation.
|
|
Forældre til indekspatienten
Begge forældre til indekspatienten. Undersøgelse: Whole Genome Sequencing (WGS), hvis der ikke findes nogen mutation ved Gene Panel Sequencing af indekspatienten. |
Whole Genome Sequencing af indekstilfældet og af begge forældre i tilfælde af, at Gene Panel Sequencing ikke identificerede en sygdomsfremkaldende mutation.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Diagnostisk udbytte gennem genpanelsekventering af 3089 kendte sygdomsgener.
Tidsramme: 6 måneder.
|
Antallet af bekræftede sygdomsfremkaldende mutationer, der kan identificeres hos 200 patienter efter genpanelsekventering og analyse med PhenIX-softwaren.
|
6 måneder.
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Livskvalitet
Tidsramme: 2 år
|
Vurdering af forældrenes livskvalitet før og efter molekylær diagnostik og modtagelse af en molekylærgenetisk diagnose.
|
2 år
|
|
Håndterbarhed af en næste generations sekventeringspipeline (NGS) i rutinemæssig klinisk diagnostik
Tidsramme: 2 år
|
Beregning af varigheden [måneder] mellem rekruttering af en familie og den endelige genetiske rådgivning.
|
2 år
|
|
Sundhedsøkonomi af NGS
Tidsramme: 2 år
|
Sammenligning af omkostningerne ved "standarddiagnostik" versus brugen af genpanel-sekventering eller WGS på et tidligt stadium i den diagnostiske proces.
Sundhedsøkonomisk analyse af de omkostninger, der afholdes for hver patient gennem "den standard diagnostiske tilgang" sammenlignet med omkostninger, der afholdes ved brug af genpanel-sekventering/WGS.
|
2 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Markus Schuelke, M.D., Department of Neuropediatrics, Charité
- Ledende efterforsker: Stefan Mundlos, M.D., Institute of Medical Genetics and of Human Genetics, Charité
- Ledende efterforsker: Heiko Krude, M.D., Department of General Pediatrics, Charité
Publikationer og nyttige links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- EA2_107_14
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .