Mutasjonsutforskning i ikke-ervervede, genetiske lidelser og dens innvirkning på helseøkonomi og livskvalitet (MENDEL)
MENDEL-studien vil undersøke om bruk av genpanel eller helgenomsekvensering (WGS) vil:
- forbedre diagnosehastigheten og gjennom dette sammenligne ytelsen til de to diagnostiske tilnærmingene (genpanel vs. WGS),
- undersøke om bruk av nevnte sekvenseringstilnærminger tidlig i den diagnostiske prosessen resulterer i reduserte helsekostnader, og
- gi økt livskvalitet for pasientene og deres foreldre.
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Pasienter vil bli rekruttert fra poliklinikker og poliklinikker ved Otto Heubner-senteret, Berlin-senteret for sjeldne sykdommer og Institutt for medisinsk genetikk og menneskelig genetikk ved Charité-Universitätsmedizin Berlin, Tyskland. Etter informert samtykke innhentes 5 ml EDTA-blod fra indekskassen og 10 ml blod fra hver forelder. Sykdomsrelatert fenotypeinformasjon og utfallet av tidligere diagnostiske tester og prosedyrer vil bli registrert som en del av studiebesøk #1.
[1] Studiebesøk nr. 1
- En medisinsk genetikk fysisk vil bli utført. Detaljerte kliniske symptomer (fenotype) vil bli registrert ved bruk av Human Phenotype Ontology (HPO) terminologi.
- En detaljert stamtavle vil bli tegnet.
- Alder for sykdomsdebut vil bli bestemt.
- Resultater fra tidligere diagnostiske tester og prosedyrer, samt sykehusopphold, vil bli registrert.
- Foreldrene vil bli bedt om å fylle ut et validert, standardisert livskvalitetsspørreskjema tilpasset for sjelden sykdom. Spørreskjemaet er tilgjengelig online eller i papirform.
[2] Studiebesøk #2a (valgfritt)
Dette studiebesøket vil bare finne sted i tilfelle genpanelsekvensering identifiserer en variant av usikker betydning, der tilleggsinformasjon vil være nødvendig for å bestemme dens patogenisitet (f. bekreftende biokjemisk testing, innsamling av tilleggsinformasjon). Relevante forskningsfunn vil bli diskutert og arten og nødvendigheten av tilleggstestingen vil bli forklart.
[3] Studiebesøk #2b (valgfritt)
Dette studiebesøket vil kun finne sted i tilfelle WGS identifiserer en variant av usikker betydning der tilleggsinformasjon er nødvendig for å fastslå patogenisiteten > se studiebesøk #2a.
[4] Studiebesøk nr. 3 (resultatøkt)
Resultatene vil bli returnert i forbindelse med en genetisk veiledningssesjon.
[5] Studiebesøk #4 (6 måneder etter studiebesøk #3)
Foreldrene vil bli bedt om å fylle ut det validerte, standardiserte livskvalitetsspørreskjemaet tilpasset sjelden sykdom igjen.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Berlin, Tyskland, 13353
- Department of General Pediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Tyskland, 13353
- Department of Neuropediatrics, Charité-Universitätsmedizin
-
Berlin, Tyskland, 13353
- Institute of Medical Genetics and Human Genetics, Charité-Universitätsmedizin
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Indekspasienter: Barn (nyfødt til 18 år) som har en mistenkt genetisk lidelse
Foreldre: biologisk mor og far i hver indekssak.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Diagnose: Mistanke om genetisk sykdom. (Bare ett av følgende kriterier kreves.) [1.1] Familiemedlem(er) med lignende fenotype ELLER [1.2] Minst to berørte organsystemer ELLER [1.3] Et berørt organsystem som er kjent for å være assosiert med flere sykdomsfremkallende gener (f. langt QT-syndrom) ELLER [1,4] Flere fødselsskader
- Begge foreldrene må være tilgjengelige for blodprøvetaking for å bekrefte fase (segregasjonsanalyse) eller for å utføre WGS av trioen på et senere tidspunkt.
- Alder: fra fødsel til 18 år
- Kjønn: Begge kjønn vil bli inkludert
Ekskluderingskriterier:
- Mistanke om at fenotypen skyldes en ervervet sykdom
- Mangler informert samtykke fra begge foreldrene eller fra alle foresatte for genetisk testing i sammenheng med en klinisk studie.
- Klinisk diagnose av en sykdom med kjent monogen årsak, f.eks. Fenylketonuri eller cystisk fibrose.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Familiebasert
- Tidsperspektiver: Potensielle
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Indeks pasienter
Barn mellom fødsel og 18 år med mistanke om genetisk lidelse. Undersøkelse: Første genpanelsekvensering og hvis ingen mutasjon er funnet > Helgenomsekvensering (WGS) |
Berikelse for og panelsekvensering av 2942 sykdomsgener oppført i databasen Online Mendelian Inheritance of Man (OMIM).
Helgenomsekvensering av indekstilfellet og av begge foreldrene i tilfelle Gene Panel Sequencing ikke identifiserte en sykdomsfremkallende mutasjon.
|
|
Foreldre til indekspasienten
Begge foreldrene til indekspasienten. Undersøkelse: Whole Genome Sequencing (WGS) hvis ingen mutasjon er funnet ved Gene Panel Sequencing av indekspasienten. |
Helgenomsekvensering av indekstilfellet og av begge foreldrene i tilfelle Gene Panel Sequencing ikke identifiserte en sykdomsfremkallende mutasjon.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Diagnostisk utbytte gjennom genpanelsekvensering av 3089 kjente sykdomsgener.
Tidsramme: 6 måneder.
|
Antall bekreftede sykdomsfremkallende mutasjoner som kan identifiseres hos 200 pasienter etter genpanelsekvensering og analyse med PhenIX-programvaren.
|
6 måneder.
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Livskvalitet
Tidsramme: 2 år
|
Vurdering av foreldrenes livskvalitet før og etter molekylær diagnostikk og mottak av en molekylærgenetisk diagnose.
|
2 år
|
|
Håndterbarhet av en neste generasjons sekvensering (NGS) pipeline i rutinemessig klinisk diagnostikk
Tidsramme: 2 år
|
Beregning av varigheten [måneder] mellom rekruttering av en familie og endelig genetisk veiledning.
|
2 år
|
|
Helseøkonomi til NGS
Tidsramme: 2 år
|
Sammenligning av kostnadene ved "standard diagnostikk" kontra bruk av genpanelsekvensering eller WGS på et tidlig stadium i den diagnostiske prosessen.
Helseøkonomisk analyse av kostnadene som påløper for hver pasient gjennom "den standard diagnostiske tilnærmingen" sammenlignet med kostnader som påløper ved bruk av genpanelsekvensering/WGS.
|
2 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Markus Schuelke, M.D., Department of Neuropediatrics, Charité
- Hovedetterforsker: Stefan Mundlos, M.D., Institute of Medical Genetics and of Human Genetics, Charité
- Hovedetterforsker: Heiko Krude, M.D., Department of General Pediatrics, Charité
Publikasjoner og nyttige lenker
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Anslag)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- EA2_107_14
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .