Exploration des mutations dans les maladies génétiques non acquises et son impact sur l'économie de la santé et la qualité de vie (MENDEL)
L'étude MENDEL examinera si l'utilisation du panel de gènes ou du séquençage du génome entier (WGS) :
- améliorer le taux de diagnostic et ainsi comparer les performances des deux approches diagnostiques (panel de gènes vs WGS),
- étudier si l'utilisation desdites approches de séquençage au début du processus de diagnostic entraîne une réduction des dépenses de santé, et
- améliorer la qualité de vie des patients et de leurs parents.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Les patients seront recrutés dans des cliniques hospitalières et ambulatoires du Centre Otto Heubner, du Centre des maladies rares de Berlin et de l'Institut de génétique médicale et de génétique humaine de la Charité-Universitätsmedizin Berlin, en Allemagne. Suite au consentement éclairé, 5 ml de sang EDTA seront obtenus du cas index et 10 ml de sang de chaque parent. Les informations sur le phénotype lié à la maladie et les résultats des tests et procédures de diagnostic précédents seront enregistrés dans le cadre de la visite d'étude #1.
[1] Visite d'étude #1
- Un physique de génétique médicale sera effectué. Les symptômes cliniques détaillés (phénotype) seront enregistrés en utilisant la terminologie de l'ontologie du phénotype humain (HPO).
- Un pedigree détaillé sera établi.
- L'âge d'apparition de la maladie sera déterminé.
- Les résultats des tests et procédures de diagnostic antérieurs, ainsi que les séjours à l'hôpital, seront enregistrés.
- Les parents seront invités à remplir un questionnaire de qualité de vie validé et standardisé adapté aux maladies rares. Le questionnaire est disponible en ligne ou sous forme papier.
[2] Visite d'étude #2a (facultatif)
Cette visite d'étude n'aura lieu que dans le cas où le séquençage du panel de gènes identifie une variante de signification incertaine, où des informations supplémentaires seraient nécessaires afin de déterminer sa pathogénicité (par ex. tests biochimiques de confirmation, collecte d'informations complémentaires). Les résultats de recherche pertinents seront discutés et la nature et la nécessité des tests supplémentaires seront expliquées.
[3] Visite d'étude #2b (facultatif)
Cette visite d'étude n'aura lieu que dans le cas où WGS identifie un variant de signification incertaine pour lequel des informations supplémentaires sont nécessaires afin de déterminer sa pathogénicité > voir Visite d'étude #2a.
[4] Visite d'étude #3 (session de résultats)
Les résultats seront rendus dans le cadre d'une séance de conseil génétique.
[5] Visite d'étude #4 (6 mois après la visite d'étude #3)
Les parents seront invités à remplir à nouveau le questionnaire de qualité de vie validé et standardisé adapté aux maladies rares.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Berlin, Allemagne, 13353
- Department of General Pediatrics, Charité-Universitätsmedizin
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Berlin, Allemagne, 13353
- Department of Neuropediatrics, Charité-Universitätsmedizin
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Berlin, Allemagne, 13353
- Institute of Medical Genetics and Human Genetics, Charité-Universitätsmedizin
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Patients index : enfants (de la naissance à 18 ans) qui présentent une suspicion de maladie génétique
Parents : père et mère biologiques de chaque cas index.
La description
Critère d'intégration:
- Diagnostic : suspicion de maladie génétique. (Un seul des critères suivants est requis.) [1.1] Membre(s) de la famille avec un phénotype similaire OU [1.2] Au moins deux systèmes d'organes affectés OU [1.3] Un système d'organes affecté connu pour être associé à plusieurs gènes responsables de maladies (par ex. syndrome du QT long) OU [1,4] Malformations congénitales multiples
- Les deux parents doivent être disponibles pour le prélèvement sanguin afin de confirmer la phase (analyse de ségrégation) ou afin d'effectuer le WGS du trio à un moment ultérieur.
- Âge : de la naissance jusqu'à 18 ans
- Sexe : les deux sexes seront inclus
Critère d'exclusion:
- Suspicion que le phénotype est dû à une maladie acquise
- Absence de consentement éclairé des deux parents ou de tous les tuteurs légaux pour les tests génétiques dans le cadre d'un essai clinique.
- Diagnostic clinique d'une maladie avec une cause monogénique connue, par ex. Phénylcétonurie ou mucoviscidose.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Basé sur la famille
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Patients indexés
Enfants entre la naissance et 18 ans manifestant avec une maladie génétique suspectée. Enquête : Séquençage du premier panel de gènes et si aucune mutation n'est trouvée > Séquençage du génome entier (WGS) |
Enrichissement et séquençage en panel de 2942 gènes pathologiques répertoriés dans la base de données Online Mendelian Inheritance of Man (OMIM).
Séquençage du génome entier du cas index et des deux parents dans le cas où le séquençage du panel de gènes n'a pas identifié de mutation responsable de la maladie.
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Parents du patient index
Les deux parents du patient index. Investigation : séquençage du génome entier (WGS) si aucune mutation n'est détectée par le séquençage du panel de gènes du patient index. |
Séquençage du génome entier du cas index et des deux parents dans le cas où le séquençage du panel de gènes n'a pas identifié de mutation responsable de la maladie.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Rendement diagnostique grâce au séquençage du panel de gènes de 3089 gènes de maladies connus.
Délai: 6 mois.
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Le nombre de mutations pathogènes confirmées qui peuvent être identifiées chez 200 patients suite au séquençage et à l'analyse du panel de gènes avec le logiciel PhenIX.
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6 mois.
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Qualité de vie
Délai: 2 années
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Évaluation de la qualité de vie des parents avant et après diagnostic moléculaire et réception d'un diagnostic génétique moléculaire.
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2 années
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Gérabilité d'un pipeline de séquençage de nouvelle génération (NGS) dans les diagnostics cliniques de routine
Délai: 2 années
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Calcul de la durée [mois] entre le recrutement d'une famille et le conseil génétique final.
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2 années
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Économie de la santé de l'END
Délai: 2 années
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Comparaison du coût des "diagnostics standard" par rapport à l'utilisation du séquençage du panel de gènes ou du WGS à un stade précoce du processus de diagnostic.
Analyse économique de la santé des coûts encourus pour chaque patient par "l'approche diagnostique standard" par rapport aux coûts encourus par l'utilisation du séquençage du panel de gènes/WGS.
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2 années
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Markus Schuelke, M.D., Department of Neuropediatrics, Charité
- Chercheur principal: Stefan Mundlos, M.D., Institute of Medical Genetics and of Human Genetics, Charité
- Chercheur principal: Heiko Krude, M.D., Department of General Pediatrics, Charité
Publications et liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimation)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- EA2_107_14
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