知的障害の診断における全ゲノム配列決定と組み合わせたハイスループット RNA 配列決定の貢献 (DI-WA)

知的障害 (ID) は、臨床的および遺伝的に異質な状態であり、診断のオデッセイをもたらすことがよくあります。

ハイスループット シーケンシング (HTS) および特にエクソーム シーケンシング (WES) の展開により、ID の原因となる多くの遺伝子を特定することが可能になりました。 ただし、WES は、たとえば、すべてのエクソンの不均一な深さとカバレッジ、または非エクソン領域のバリアントの位置により、患者の約 3 分の 2 で ID の原因を特定しません。 このように、より複雑でコストがかかるためにまだめったに使用されていないゲノム配列決定 (WGS) がより効率的であり、約 60% の診断率が期待されることが示されています。

希少疾患に苦しむ患者の診断における HTS の多大な貢献に応えて、フランスは、WGS、WES、および RNA シーケンス (RNA -seq)、およびこれらの検査を処方するためのモダリティを定義するパイロット研究。 現在の ID 診断戦略と比較して、これらの技術の 2 つの費用対効果評価が現在進行中であるか、フランスで短期的に計画されています。 PFMG2025 の研究で、WGS をトリオ対ソロ、現在の戦略と比較しています。 ただし、ID 診断決定ツリーで RNA シーケンスの場所を調べる研究はありません。

ただし、いくつかの病原性変異は、転写に影響を与える可能性があります。 WES/WGS はそれらを検出できますが、ゲノム DNA に焦点を当てているため、病原性を断言することはできません。 RNA-seq のみが、候補遺伝子の転写を大規模に研究することを可能にし、ヒト病理学における既知の遺伝子 (OMIM) と候補遺伝子の両方に関するさらなるレベルの証拠を提供します。

RNA-seq は、WGS に加えて、第一選択のアプローチ (WES を含む) を使用した陰性患者の診断率を 10% から 35% に高め、個別化されたケア経路の一部として診断の遅延を減らすことで管理を最適化します。