지적 장애 진단에서 전체 게놈 시퀀싱과 결합된 고처리량 RNA 시퀀싱의 기여 (DI-WA)

지적 장애(ID)는 종종 진단적 오디세이를 초래하는 임상적 및 유 전적으로 이질적인 상태입니다.

높은 처리량 시퀀싱(HTS) 및 특히 엑솜 시퀀싱(WES)의 배치로 ID를 담당하는 많은 유전자를 식별할 수 있게 되었습니다. 그러나 WES는 예를 들어 모든 엑손의 고르지 않은 깊이와 적용 범위 또는 비엑손 영역의 변형 위치로 인해 환자의 약 2/3에서 ID의 원인을 식별하지 못합니다. 따라서 더 복잡하고 비용이 많이 들기 때문에 여전히 거의 사용되지 않는 게놈 시퀀싱(WGS)이 약 60%의 진단률로 더 효율적일 것으로 나타났습니다.

희귀 질환을 앓고 있는 환자의 진단에 HTS가 크게 기여함에 따라 프랑스는 WGS, WES 및 RNA 시퀀싱(RNA -seq) 및 이러한 검사를 처방하기 위한 양식을 정의하기 위한 파일럿 연구. 현재의 ID 진단 전략과 비교하여 이러한 기술의 두 가지 비용 효율성 평가가 프랑스에서 현재 진행 중이거나 단기적으로 계획되어 있습니다. 1) 대형 DI459 패널과 WES를 비교하는 PRME DISSEQ, 2) DEFIDIAG 파일럿 PFMG2025 연구에서 트리오 대 솔로 WGS와 현재 전략을 비교했습니다. 그러나 ID 진단 결정 트리에서 RNA-seq의 위치를 ​​조사한 연구는 없습니다.

그러나 일부 병원성 변이는 전사에 영향을 미칠 가능성이 있습니다. WES/WGS는 이들을 검출할 수 있지만 게놈 DNA에 초점을 맞추기 때문에 병원성을 확인할 수 없습니다. RNA-seq만이 후보 유전자의 전사를 대규모로 연구할 수 있게 하여 인간 병리학에서 알려진 유전자(OMIM)와 후보 유전자 모두에 대한 추가적인 증거를 제공합니다.

RNA-seq는 1차 접근법(WES 포함)을 사용하는 음성 환자의 WGS 외에 진단율을 10%에서 35%로 증가시켜 개인화된 치료 경로의 일부로 진단 지연을 줄임으로써 관리를 최적화합니다.