アスピリン増悪性呼吸器疾患 (AERD) の遺伝学とゲノミクス (AERD)
2021年8月30日 更新者:National Jewish Health
アスピリン増悪呼吸器疾患(AERD)は、成人発症の重度の喘息、鼻腔内の非癌性増殖(すなわち、
鼻ポリープ)とアスピリンアレルギー。
AERD の原因は不明ですが、遺伝的感受性と組み合わされた環境による侮辱に起因する可能性があります。
AERD 疾患の均一性は、狭義の遺伝的要因を発見する可能性を高め、喘息を引き起こす遺伝的およびエピジェネティックな変化を研究するための理想的な集団にします。
研究者は最近、重度の喘息患者の気管支上皮細胞では、軽度の喘息患者や健康なコントロールと比較して、上皮の成長と修復(EGR)遺伝子の遺伝子発現が大幅に減少していることを発見しました。
この新しい発見は、上皮の完全性および関連するプロセスが、重度の喘息、および潜在的に重度の喘息サブタイプである AERD の発症にとって最も重要である可能性があることを示しています。
この発見は、その後のラボモデルで裏付けられ、中枢上皮の修復および分化遺伝子であるヒト上皮成長因子受容体 2 (ERBB2) をブロックすると、損傷後の気管支上皮細胞の治癒時間が短縮されることが示されました。
したがって、提案された研究の目的は、EGR遺伝子が均一な重度の喘息サブタイプであるAERDでもダウンレギュレートされているかどうかを判断することです。
拡張として、研究者はまた、遺伝子突然変異および/またはエピジェネティックな変化がこの EGR 遺伝子のダウンレギュレーションに関連し、潜在的に説明するかどうかを決定します。
具体的には、研究者らは、140 人の AERD 患者、70 人の非アスピリン感受性喘息患者、および 35 人の健常対照者の、ブラシをかけたばかりの鼻気道上皮細胞の遺伝子発現を取得することを計画しており、鼻上皮遺伝子発現が肺上皮の変化を反映していることが最近示されていることに注目しています。喘息気道。
鼻腔の上皮細胞を拭き取ることで、気道上皮細胞の遺伝子発現を非侵襲的に評価できます。
私たちの実験計画は、AERD遺伝子発現プロファイルを健康な対照と対比し、健康な対照と比較してAERDでEGR遺伝子が抑制されているかどうかを判断します。
当然の結果として、研究者は、いつの日か診断に役立ち、疾患メカニズムの現在の知識を拡大する可能性のある AERD 固有の遺伝子発現プロファイルを発見しようとしています。
拡張として、研究者は遺伝子発現の変化、特にダウンレギュレートされた EGR 遺伝子の発見をメチル化の変化と関連付けます (つまり、
エピジェネティックな変化)と遺伝子変異。
調査の概要
状態
一時停止
研究の種類
観察的
入学 (予想される)
245
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
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Colorado
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Denver、Colorado、アメリカ、80206
- National Jewish Health
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参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年~75年 (大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
受講資格のある性別
全て
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
AERD参加者、鼻腔の炎症、非癌性腫瘍の発生、およびアスピリンに対するアレルギーを特徴とする重度の喘息のサブタイプ。 35人の健康な対照参加者。
集団は、診療所の訪問または臨床研究の問い合わせから募集され、すべてボランティアです。
説明
包含基準:
- 喘息の医師の診断
- 鼻茸を特徴とする慢性鼻疾患の医師の診断
- クリニックでのアスピリン挑発チャレンジによって検証されたアスピリンに対する感受性
- 健康な対照参加者
除外基準:
- 積極的な喫煙
- 妊娠
- -10パック年以上の喫煙歴
- -不注意に研究結果を妨げる可能性のある重大な併存疾患
- 経口コルチコステロイドのバーストが必要な状態
- その他の重大な肺疾患
- 研究者の見解における他の疾患は、研究への参加を禁止します
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースコントロール
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
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AERD参加者
アスピリンの参加者は呼吸器疾患を悪化させました。
アスピリンアレルギー、鼻ポリープ、および成人発症の重度の喘息を有する成人。
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健康管理
喘息のない健康な参加者。
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-アスピリンに敏感でない喘息の参加者
-喘息を患っているが、アスピリンに対する感受性がない参加者。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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AERDにおけるEGR関連遺伝子発現の評価
時間枠:修業年限3年
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研究者は、鼻スワブサンプルを使用し、収集した細胞で RNAseq を実行して、AERD 患者、アスピリン非感受性喘息患者、および健康な患者のブラシをかけたばかりの鼻気道上皮細胞のグローバルな遺伝子発現を取得します。
研究者は、AERD 遺伝子プロファイルを非アスピリン感受性喘息患者および健康な患者と比較し、EGR 遺伝子のダウンレギュレーションが AERD に見られるかどうかを判断します。
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修業年限3年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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EGR遺伝子発現とエピジェネティックな遺伝子メチル化の関係
時間枠:修業年限3年
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ダウンレギュレートされた EGR 遺伝子に関連して全ゲノムメチル化プロファイリングが変化するかどうかを判断する。
研究者は、研究参加者の相補的な全ゲノムメチル化プロファイルを取得し、AERD 患者のダウンレギュレートされた EGR 遺伝子がメチル化の違いと関連しているかどうかを、発現とエピジェネティックなデータを統合した複合分析によって評価します。
MethylMix R ソフトウェア プログラムを使用して、遺伝子発現の変化に関連するメチル化の変化を特定します。
MethylMix は、正常および疾患サンプルからの DNA メチル化を、一致する遺伝子発現と統合します。
要約すると、MethylMix は、疾患組織と正常組織のメチル化値を比較することにより、高メチル化遺伝子と低メチル化遺伝子を定義します。
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修業年限3年
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EGR関連遺伝子発現に対する遺伝的変異の影響
時間枠:修業年限3年
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遺伝子変異がAERD患者のEGR遺伝子発現の下方制御と関連しているかどうかを判断すること。
これらの同じ研究参加者の遺伝子型を取得し、発現と遺伝子型を統合した複合分析により、ダウンレギュレートされた EGR 遺伝子が突然変異と関連しているかどうかを評価します。
Affymetrix ジェノタイピング ワークフローは 4 つのステップで構成されています。最初の 3 つのステップでは一連のスタンドアロン ソフトウェア パッケージを使用し、4 番目のステップでは R パッケージ SNPolisher を使用します。
サンプル QC は Dish-QC 統計によって評価され、デフォルトの Dish-QC > 82% のサンプルが保持されます。
コール率がデフォルト値の 97% よりも低いジェノタイピングされたサンプルは除外されます。
Platewise QC は、デフォルトのカットオフ値 95 および 99% を使用して、'Plate Pass Rate' および 'Average Plate Call Rate' 統計を手動で計算することによって評価されます。
ジェノタイピングステップは、品質基準に合格したサンプルに対して再実行されます。
SNPolisher はシグナルの品質を評価し、各 SNP プローブを分類します。
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修業年限3年
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2018年11月6日
一次修了 (予想される)
2022年4月1日
研究の完了 (予想される)
2022年4月1日
試験登録日
最初に提出
2019年12月5日
QC基準を満たした最初の提出物
2020年2月5日
最初の投稿 (実際)
2020年2月10日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2021年9月1日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2021年8月30日
最終確認日
2021年8月1日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。