- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT04261582
Genetikk og genomikk av aspirin forverret luftveissykdom (AERD) (AERD)
30. august 2021 oppdatert av: National Jewish Health
Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) er en relativt homogen sykdom karakterisert ved alvorlig astma i voksen alder, utvikling av ikke-kreftfremkallende vekster i nesekanalen (dvs.
nesepolypper) og aspirinallergi.
Årsaken til AERD er ukjent, men sannsynligvis skyldes miljøfornærmelser i kombinasjon med genetisk følsomhet.
AERD-sykdomshomogenitet øker muligheten for å oppdage snevert definerte genetiske bidragsytere, og gjør den til en ideell populasjon for å studere de genetiske og epigenetiske endringene som forårsaker astma.
Forskere har nylig oppdaget at genuttrykk av epitelvekst- og reparasjonsgener (EGR) er betydelig redusert i epitelceller i bronkiale luftveier hos alvorlige astmatikere sammenlignet med mindre alvorlige astmatikere og friske kontroller.
Dette nye funnet indikerer at epitelintegritet og relaterte prosesser kan være av primær betydning for utviklingen av alvorlig astma, og potensielt den alvorlige astma-subtypen, AERD.
Dette funnet ble senere støttet i en påfølgende laboratoriemodell, som viste at blokkering av et sentralt epitelreparasjons- og differensieringsgen, human epidermal vekstfaktorreseptor 2 (ERBB2), reduserte helbredelsestiden for bronkiale epitelceller etter skade.
Dermed er målet med den foreslåtte studien å avgjøre om EGR-genet også er nedregulert i AERD, en homogen alvorlig astma-subtype.
Som en forlengelse vil forskerne også finne ut om genetiske mutasjoner og/eller epigenetiske endringer relaterer seg til og potensielt forklarer denne nedreguleringen av EGR-gener.
Spesifikt planlegger forskerne å oppnå genuttrykk av nybørstede epitelceller fra neseluftveiene til 140 AERD-pasienter, 70 ikke-aspirinsensitive astmapasienter og 35 friske kontroller, og bemerker at genuttrykk fra nasalt epitel nylig har vist seg å speile lungeepitelforandringer i astmatiske luftveier.
Vapping av nesekanalen for epitelceller gjør det mulig å evaluere luftveisepitelcelle-genekspresjonen ikke-invasivt.
Vårt eksperimentelle design kontrasterer AERD-genekspresjonsprofiler mot friske kontroller, og bestemmer om EGR-gener er deprimert i AERD i forhold til helsekontroller.
Som en konsekvens ser forskerne etter å oppdage en AERD-spesifikk genekspresjonsprofil som kan hjelpe en dag med diagnose og utvide dagens kunnskap om sykdomsmekanismer.
Som en utvidelse vil forskerne korrelere genuttrykksendringer, spesifikt alle funn av nedregulerte EGR-gener, med metyleringsendringer (dvs.
epigenetiske endringer) og genetiske mutasjoner.
Studieoversikt
Status
Suspendert
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Forventet)
245
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiesteder
-
-
Colorado
-
Denver, Colorado, Forente stater, 80206
- National Jewish Health
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
18 år til 75 år (Voksen, Eldre voksen)
Tar imot friske frivillige
Nei
Kjønn som er kvalifisert for studier
Alle
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
AERD-deltakere, en undertype av alvorlig astma preget av betennelse i nesehulen, utvikling av ikke-kreftfremkallende vekster og allergi mot aspirin; 35 friske kontrolldeltakere.
Populasjoner vil bli rekruttert fra klinikkbesøk eller kliniske forskningshenvendelser, alle frivillige.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Legens diagnose av astma
- Legediagnose av kronisk nesesykdom med nesepolypper
- Følsomhet for aspirin bekreftet av en aspirin-provoserende utfordring i klinikken
- Frisk kontrolldeltaker
Ekskluderingskriterier:
- Aktiv røyking
- Svangerskap
- Historie med mer enn eller lik 10 pakkeår med røyking
- Eventuelle signifikante komorbide tilstander som utilsiktet kan forstyrre studieresultatene
- Tilstander som krever utbrudd av orale kortikosteroider
- Andre betydelige lungesykdommer
- Annen sykdom etter etterforskerens syn forbyr deltakelse i studien
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Case-Control
- Tidsperspektiver: Potensielle
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
---|
AERD-deltakere
Deltakere med aspirin forverret luftveissykdom.
Voksne med aspirinallergi, nesepolypper og alvorlig astma i voksen alder.
|
Sunne kontroller
Friske deltakere som ikke har astma.
|
Ikke-aspirinsensitive astmadeltakere
Deltakere med astma, men som ikke har en følsomhet for aspirin.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Evaluering av EGR-relatert genuttrykk i AERD
Tidsramme: Gjennom studiegjennomføring, 3 år
|
Forskere vil oppnå globalt genuttrykk av nybørstede epitelceller fra neseluftveiene til AERD-pasienter, ikke-aspirinsensitive astmapasienter og friske pasienter ved å bruke neseprøver og kjøre RNAseq på de innsamlede cellene.
Forskere vil sammenligne AERD-genprofiler mot ikke-aspirinsensitive astmapasienter og friske pasienter og avgjøre om nedregulering av EGR-gener finnes i AERD.
|
Gjennom studiegjennomføring, 3 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Forholdet mellom EGR-genuttrykk og epigenetisk genmetylering
Tidsramme: Gjennom studiegjennomføring, 3 år
|
For å bestemme om metyleringsprofilering av hele genomet er endret i forbindelse med nedregulerte EGR-gener.
Forskere vil få komplementære helgenommetyleringsprofiler til studiedeltakerne og vil evaluere om nedregulerte EGR-gener hos AERD-pasienter er assosiert med metyleringsforskjeller ved en sammensatt analyse som integrerer uttrykk og epigenetiske data.
MethylMix R-programvare vil bli brukt til å identifisere metyleringsendringer assosiert med genuttrykksendringer.
MethylMix integrerer DNA-metylering fra normale prøver og sykdomsprøver med matchet genuttrykk.
Oppsummert definerer MethylMix hyper- og hypometylerte gener ved å sammenligne metyleringsverdier av sykdomsvev vs. normalt.
|
Gjennom studiegjennomføring, 3 år
|
Påvirkning av genetisk variasjon på EGR-relatert genuttrykk
Tidsramme: Gjennom studiegjennomføring, 3 år
|
For å bestemme om genetiske mutasjoner assosieres med nedregulert EGR-genuttrykk hos AERD-pasienter.
Vi vil skaffe genotyper på de samme studiedeltakerne og evaluere om nedregulerte EGR-gener er assosiert med mutasjoner ved en sammensatt analyse som integrerer uttrykk og genotyper.
Arbeidsflyten for Affymetrix genotyping består av 4 trinn; de første 3 trinnene bruker et sett med frittstående programvarepakker, og det 4. trinnet bruker R-pakken SNPolisher.
Prøve-QC vil bli evaluert av Dish-QC-statistikk, og beholder prøver med standard Dish-QC > 82 %.
Genotypeprøver med en ringefrekvens lavere enn standardverdien på 97 % vil bli ekskludert.
Platewise QC vil bli evaluert ved å manuelt beregne 'Plate Pass Rate' og 'Average Plate Call Rate'-statistikk, med standard grenseverdier på 95 og 99 %.
Genotypingstrinnet vil bli kjørt på nytt for prøver som består kvalitetskriterier.
SNPolisher vil evaluere kvaliteten på signalet og klassifisere hver SNP-sonde.
|
Gjennom studiegjennomføring, 3 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Samarbeidspartnere
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
6. november 2018
Primær fullføring (Forventet)
1. april 2022
Studiet fullført (Forventet)
1. april 2022
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
5. desember 2019
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
5. februar 2020
Først lagt ut (Faktiske)
10. februar 2020
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
1. september 2021
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
30. august 2021
Sist bekreftet
1. august 2021
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- HS-3200sIRB
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på Nesepolypper
-
Nanfang Hospital of Southern Medical UniversityUkjent
-
Carol Davila University of Medicine and PharmacyRekrutteringBlør | Polyp kolorektalRomania
-
Unity Health TorontoHar ikke rekruttert ennåPolyp kolorektal
-
Shanghai Ninth People's Hospital Affiliated to...Fullført
-
Wake Forest University Health SciencesAvsluttet
-
Peking Union Medical College HospitalFullført
-
Lawson Health Research InstituteLondon Health Sciences CentreFullførtNasal intubasjonCanada
-
Shanghai Ninth People's Hospital Affiliated to...Ukjent
-
Suez Canal UniversityUkjent
-
Seoul National Uinversity Dental HospitalFullførtNasal fiberoptisk intubasjonKorea, Republikken