Genetyka i genomika aspiryny zaostrzonej choroby układu oddechowego (AERD) (AERD)

Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) jest stosunkowo jednorodną chorobą charakteryzującą się ciężką astmą rozpoczynającą się w wieku dorosłym, rozwojem nienowotworowych narośli w przewodzie nosowym (tj. polipy nosa) i uczulenie na aspirynę. Przyczyna AERD jest nieznana, chociaż prawdopodobnie wynika z urazów środowiskowych w połączeniu z podatnością genetyczną. Jednorodność choroby AERD zwiększa możliwość odkrycia wąsko zdefiniowanych czynników genetycznych i sprawia, że ​​jest to idealna populacja do badania zmian genetycznych i epigenetycznych powodujących astmę. Naukowcy niedawno odkryli, że ekspresja genów odpowiedzialnych za wzrost i naprawę nabłonka (EGR) jest znacznie zmniejszona w komórkach nabłonka dróg oddechowych u osób z ciężką astmą w porównaniu z astmatykami o lżejszym przebiegu i zdrowymi osobami z grupy kontrolnej. To nowe odkrycie wskazuje, że integralność nabłonka i powiązane procesy mogą mieć pierwszorzędne znaczenie dla rozwoju ciężkiej astmy i potencjalnie ciężkiego podtypu astmy, AERD. Odkrycie to zostało później potwierdzone w kolejnym modelu laboratoryjnym, który wykazał, że zablokowanie centralnego genu naprawy i różnicowania nabłonka, receptora ludzkiego naskórkowego czynnika wzrostu 2 (ERBB2), skróciło czas gojenia się komórek nabłonka oskrzeli po urazie. Zatem celem proponowanego badania jest ustalenie, czy gen EGR jest również regulowany w dół w AERD, jednorodnym podtypie ciężkiej astmy. W ramach rozszerzenia naukowcy ustalą również, czy mutacje genetyczne i/lub zmiany epigenetyczne mają związek i potencjalnie wyjaśniają tę regulację w dół genów EGR. W szczególności naukowcy planują uzyskać ekspresję genów świeżo wyszczotkowanych komórek nabłonka dróg oddechowych od 140 pacjentów z AERD, 70 pacjentów z astmą niewrażliwych na aspirynę i 35 zdrowych osób z grupy kontrolnej, zauważając, że ostatnio wykazano, że ekspresja genów nabłonka nosa odzwierciedla zmiany nabłonka płuc w astmatyczne drogi oddechowe. Pobranie wymazu z kanału nosowego w celu wykrycia komórek nabłonka umożliwia nieinwazyjną ocenę ekspresji genów komórek nabłonka dróg oddechowych. Nasz projekt eksperymentalny porównuje profile ekspresji genów AERD ze zdrowymi kontrolami i określa, czy geny EGR są obniżone w AERD w stosunku do kontroli zdrowia. W związku z tym naukowcy chcą odkryć profil ekspresji genów specyficzny dla AERD, który pewnego dnia może pomóc w diagnozie i rozszerzyć obecną wiedzę na temat mechanizmów chorobowych. W ramach rozszerzenia naukowcy skorelują zmiany ekspresji genów, w szczególności wszelkie odkrycia genów EGR o obniżonej regulacji, ze zmianami metylacji (tj. zmiany epigenetyczne) i mutacje genetyczne.