아스피린 악화 호흡기 질환(AERD)의 유전학 및 유전체학 (AERD)
2021년 8월 30일 업데이트: National Jewish Health
아스피린 악화 호흡기 질환(AERD)은 성인 발병 중증 천식, 비강 내 비암성 성장(즉,
비용종) 및 아스피린 알레르기.
AERD의 원인은 알려지지 않았지만 유전적 감수성과 결합된 환경 손상의 결과일 가능성이 높습니다.
AERD 질병 동질성은 좁게 정의된 유전적 기여자를 발견할 가능성을 높이고 천식을 유발하는 유전적 및 후성적 변화를 연구하기에 이상적인 모집단을 만듭니다.
연구원들은 최근에 상피 성장 및 복구(EGR) 유전자의 유전자 발현이 덜 심각한 천식 환자 및 건강한 대조군에 비해 중증 천식 환자의 기관지 기도 상피 세포에서 실질적으로 감소한다는 것을 발견했습니다.
이 새로운 발견은 상피 완전성 및 관련 과정이 중증 천식 및 잠재적으로 중증 천식 하위 유형인 AERD의 발달에 가장 중요할 수 있음을 나타냅니다.
이 발견은 나중에 중앙 상피 복구 및 분화 유전자인 인간 표피 성장 인자 수용체 2(ERBB2)를 차단하면 손상 후 기관지 상피 세포의 치유 시간이 감소한다는 것을 보여준 후속 연구실 모델에서 뒷받침되었습니다.
따라서 제안된 연구의 목적은 EGR 유전자가 균질한 중증 천식 하위 유형인 AERD에서도 하향 조절되는지 여부를 확인하는 것입니다.
연장선으로 연구자들은 유전적 돌연변이 및/또는 후생유전학적 변화가 EGR 유전자의 하향 조절과 관련이 있고 잠재적으로 설명하는지 여부를 결정할 것입니다.
구체적으로, 연구자들은 140명의 AERD 환자, 70명의 비아스피린 민감성 천식 환자, 35명의 건강한 대조군의 갓 닦은 비강 기도 상피 세포의 유전자 발현을 얻을 계획입니다. 천식기도.
비강에서 상피 세포를 면봉으로 닦으면 기도 상피 세포 유전자 발현을 비침습적으로 평가할 수 있습니다.
우리의 실험 설계는 AERD 유전자 발현 프로파일을 건강한 대조군과 대조하고 EGR 유전자가 건강 대조군에 비해 AERD에서 우울한지 여부를 결정합니다.
결과적으로 연구자들은 언젠가 진단에 도움이 되고 질병 메커니즘에 대한 현재 지식을 확장할 수 있는 AERD 특정 유전자 발현 프로필을 발견하려고 합니다.
확장으로 연구자들은 유전자 발현 변화, 특히 하향 조절된 EGR 유전자의 발견을 메틸화 변화(즉,
후생유전학적 변화) 및 유전적 돌연변이.
연구 개요
상태
정지된
연구 유형
관찰
등록 (예상)
245
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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Colorado
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Denver, Colorado, 미국, 80206
- National Jewish Health
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
18년 (성인, 고령자)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
AERD 참여자, 비강의 염증, 비암성 성장의 발달 및 아스피린에 대한 알레르기를 특징으로 하는 중증 천식의 하위 유형; 35명의 건강한 대조군 참가자.
인구는 클리닉 방문 또는 임상 연구 문의, 모든 자원 봉사자로부터 모집됩니다.
설명
포함 기준:
- 천식의 의사 진단
- 비용종을 특징으로 하는 만성 비염의 의사 진단
- 임상에서 아스피린 유발 유발검사로 확인된 아스피린 감수성
- 건강한 대조군 참가자
제외 기준:
- 적극적인 흡연
- 임신
- 10갑년 이상의 흡연력
- 본의 아니게 연구 결과를 방해할 수 있는 중대한 동반 질환
- 경구 코르티코스테로이드의 폭발이 필요한 상태
- 기타 중요한 폐 질환
- 연구자가 보기에 다른 질병은 연구 참여를 금지합니다.
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 케이스 컨트롤
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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AERD 참가자
아스피린을 복용한 참가자는 호흡기 질환을 악화시켰습니다.
아스피린 알레르기, 비용종 및 성인 발병 중증 천식이 있는 성인.
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건강한 통제
천식이 없는 건강한 참가자.
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비 아스피린 민감성 천식 참가자
천식이 있지만 아스피린에 민감하지 않은 참가자.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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AERD에서 EGR 관련 유전자 발현 평가
기간: 학업 수료까지 3년
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연구자들은 비강 면봉 샘플을 사용하고 수집된 세포에서 RNAseq를 실행하여 AERD 환자, 비아스피린 민감성 천식 환자 및 건강한 환자의 새로 닦은 비강 기도 상피 세포의 전체 유전자 발현을 얻을 것입니다.
연구자들은 AERD 유전자 프로파일을 비 아스피린 민감성 천식 환자 및 건강한 환자와 대조하고 EGR 유전자의 하향 조절이 AERD에서 발견되는지 여부를 결정할 것입니다.
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학업 수료까지 3년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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EGR 유전자 발현과 후성 유전자 메틸화의 관계
기간: 학업 수료까지 3년
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하향 조절된 EGR 유전자와 관련하여 전체 게놈 메틸화 프로파일링이 변경되는지 여부를 결정합니다.
연구원은 연구 참가자의 보완적인 전체 게놈 메틸화 프로필을 얻고 AERD 환자의 하향 조절된 EGR 유전자가 메틸화 차이와 관련이 있는지 여부를 발현 및 후생유전학적 데이터를 통합하는 복합 분석을 통해 평가할 것입니다.
MethylMix R 소프트웨어 프로그램은 유전자 발현 변화와 관련된 메틸화 변화를 식별하는 데 사용됩니다.
MethylMix는 정상 및 질병 샘플의 DNA 메틸화를 일치하는 유전자 발현과 통합합니다.
요약하면, MethylMix는 질병 조직과 정상 조직의 메틸화 값을 비교하여 과메틸화 및 저메틸화 유전자를 정의합니다.
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학업 수료까지 3년
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유전적 변이가 EGR 관련 유전자 발현에 미치는 영향
기간: 학업 수료까지 3년
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유전적 돌연변이가 AERD 환자에서 하향 조절된 EGR 유전자 발현과 연관되는지 여부를 결정하기 위해.
우리는 이러한 동일한 연구 참여자에 대한 유전자형을 얻고 발현 및 유전자형을 통합하는 복합 분석에 의해 하향 조절된 EGR 유전자가 돌연변이와 연관되어 있는지 여부를 평가할 것입니다.
Affymetrix 유전자형 분석 작업 흐름은 4단계로 구성됩니다. 처음 3단계는 독립 실행형 소프트웨어 패키지 세트를 사용하고 4단계는 R 패키지 SNPolisher를 사용합니다.
샘플 QC는 기본 Dish-QC > 82%인 샘플을 유지하면서 Dish-QC 통계에 의해 평가됩니다.
호출 비율이 기본값인 97%보다 낮은 유전자형 샘플은 제외됩니다.
Platewise QC는 기본 컷오프 값 95 및 99%로 '플레이트 통과율' 및 '평균 플레이트 호출율' 통계를 수동으로 계산하여 평가됩니다.
유전자형 분석 단계는 품질 기준을 통과한 샘플에 대해 다시 실행됩니다.
SNPolisher는 신호의 품질을 평가하고 각 SNP 프로브를 분류합니다.
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학업 수료까지 3년
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2018년 11월 6일
기본 완료 (예상)
2022년 4월 1일
연구 완료 (예상)
2022년 4월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
2019년 12월 5일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2020년 2월 5일
처음 게시됨 (실제)
2020년 2월 10일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2021년 9월 1일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2021년 8월 30일
마지막으로 확인됨
2021년 8월 1일
추가 정보
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