Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Genetika a genomika aspirinem exacerbovaného respiračního onemocnění (AERD) (AERD)

30. srpna 2021 aktualizováno: National Jewish Health
Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) je relativně homogenní onemocnění charakterizované těžkým astmatem v dospělosti, rozvojem nerakovinných růstů v nosním kanálu (tj. nosní polypy) a alergie na aspirin. Příčina AERD není známa, i když pravděpodobně vyplývá z environmentálních urážek v kombinaci s genetickou náchylností. Homogenita onemocnění AERD zvyšuje možnost objevení úzce definovaných genetických přispěvatelů a činí z něj ideální populaci pro studium genetických a epigenetických změn, které způsobují astma. Výzkumníci nedávno zjistili, že genová exprese genů pro růst a opravu epitelu (EGR) je podstatně snížena v buňkách epitelu bronchiálních dýchacích cest u těžkých astmatiků ve srovnání s méně závažnými astmatiky a zdravými kontrolami. Toto nové zjištění ukazuje, že integrita epitelu a související procesy mohou mít primární význam pro rozvoj těžkého astmatu a potenciálně podtypu těžkého astmatu, AERD. Toto zjištění bylo později podpořeno následným laboratorním modelem, který ukázal, že blokování centrálního epiteliálního reparačního a diferenciačního genu, lidského receptoru epidermálního růstového faktoru 2 (ERBB2), zkrátilo dobu hojení bronchiálních epiteliálních buněk po poranění. Cílem navrhované studie je tedy určit, zda jsou geny EGR také down-regulovány u AERD, homogenního podtypu těžkého astmatu. Jako rozšíření vědci také určí, zda se genetické mutace a/nebo epigenetické změny týkají a potenciálně vysvětlují tuto down-regulaci genů EGR. Konkrétně vědci plánují získat genovou expresi čerstvě vyčištěných epiteliálních buněk nosních cest u 140 pacientů s AERD, 70 pacientů s astmatem necitlivých na aspirin a 35 zdravých kontrol, přičemž se nedávno ukázalo, že genová exprese nosního epitelu odráží změny plicního epitelu astmatické dýchací cesty. Výtěr epiteliálních buněk z nosního kanálu umožňuje neinvazivně vyhodnotit expresi genu epiteliálních buněk dýchacích cest. Náš experimentální design kontrastuje profily genové exprese AERD proti zdravým kontrolám a určuje, zda jsou geny EGR u AERD ve srovnání se zdravotními kontrolami v depresi. Jako důsledek se výzkumníci snaží objevit profil genové exprese specifický pro AERD, který by mohl jednoho dne pomoci při diagnostice a rozšířit současné znalosti o mechanismech onemocnění. Jako rozšíření budou výzkumníci korelovat změny genové exprese, konkrétně jakýkoli nález down-regulovaných genů EGR, se změnami methylace (tj. epigenetické změny) a genetické mutace.

Přehled studie

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

245

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

    • Colorado
      • Denver, Colorado, Spojené státy, 80206
        • National Jewish Health

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 75 let (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Účastníci AERD, podtyp těžkého astmatu charakterizovaný zánětem nosní dutiny, rozvojem nerakovinných růstů a alergií na aspirin; 35 zdravých účastníků kontroly. Populace se budou rekrutovat z návštěv na klinikách nebo z klinických výzkumných dotazů, všichni dobrovolníci.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Diagnostika astmatu lékařem
  • Lékař diagnostika chronického onemocnění nosu s nosními polypy
  • Citlivost na aspirin ověřena provokativní výzvou aspirinu na klinice
  • Zdravý účastník kontroly

Kritéria vyloučení:

  • Aktivní kouření
  • Těhotenství
  • Anamnéza více než nebo rovna 10 balíčkových let kouření
  • Jakékoli významné komorbidní stavy, které by mohly neúmyslně narušit výsledky studie
  • Stavy, které vyžadují návaly perorálních kortikosteroidů
  • Další významná plicní onemocnění
  • Jiné onemocnění podle názoru výzkumníka zakazuje účast ve studii

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Case-Control
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Účastníci AERD
Účastníci s aspirinem zhoršili respirační onemocnění. Dospělí s alergií na aspirin, nosními polypy a těžkým astmatem v dospělosti.
Zdravé kontroly
Zdraví účastníci, kteří nemají astma.
Účastníci astmatu necitliví na aspirin
Účastníci s astmatem, kteří však nemají citlivost na aspirin.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Hodnocení genové exprese související s EGR v AERD
Časové okno: Po ukončení studia 3 roky
Výzkumníci získají globální genovou expresi čerstvě vyčištěných epiteliálních buněk nosních dýchacích cest pacientů s AERD, pacientů s astmatem necitlivých na aspirin a zdravých pacientů pomocí vzorků nosních výtěrů a aplikací RNAseq na odebrané buňky. Výzkumníci porovnají profily genů AERD s pacienty s astmatem a zdravými pacienty necitlivými na aspirin a určí, zda je u AERD zjištěna down-regulace genů EGR.
Po ukončení studia 3 roky

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Vztah exprese genu EGR k epigenetické genové methylaci
Časové okno: Po ukončení studia 3 roky
Určit, zda je profilování metylace celého genomu změněno ve spojení s down-regulovanými geny EGR. Výzkumníci získají komplementární profily metylace celého genomu účastníků studie a vyhodnotí, zda jsou down-regulované geny EGR u pacientů s AERD spojeny s methylačními rozdíly, pomocí kompozitní analýzy integrující expresi a epigenetická data. Softwarový program MethylMix R bude použit k identifikaci metylačních změn spojených se změnami genové exprese. MethylMix integruje metylaci DNA z normálních a nemocných vzorků s odpovídající genovou expresí. Stručně řečeno, MethylMix definuje hyper a hypomethylované geny porovnáním hodnot metylace nemocné tkáně vs. normální.
Po ukončení studia 3 roky
Vliv genetické variace na genovou expresi související s EGR
Časové okno: Po ukončení studia 3 roky
Zjistit, zda genetické mutace souvisí s down-regulovanou expresí genu EGR u pacientů s AERD. Získáme genotypy na těchto stejných účastnících studie a vyhodnotíme, zda jsou down-regulované geny EGR asociovány s mutacemi pomocí kompozitní analýzy integrující expresi a genotypy. Pracovní postup genotypizace Affymetrix se skládá ze 4 kroků; první 3 kroky používají sadu samostatných softwarových balíčků a 4. krok používají R balíček SNPolisher. Kontrola kvality vzorků bude vyhodnocena statistikou Dish-QC, přičemž budou zachovány vzorky s výchozí hodnotou Dish-QC > 82 %. Genotypované vzorky s četností hovorů nižší než výchozí hodnota 97 % budou vyloučeny. Platewise QC bude vyhodnocena ručním výpočtem statistik 'Plate Pass Rate' a 'Average Plate Call Rate', s výchozími limitními hodnotami 95 a 99 %. Krok genotypizace bude opakován pro vzorky splňující kritéria kvality. SNPolisher vyhodnotí kvalitu signálu a klasifikuje každou SNP sondu.
Po ukončení studia 3 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

6. listopadu 2018

Primární dokončení (Očekávaný)

1. dubna 2022

Dokončení studie (Očekávaný)

1. dubna 2022

Termíny zápisu do studia

První předloženo

5. prosince 2019

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

5. února 2020

První zveřejněno (Aktuální)

10. února 2020

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

1. září 2021

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

30. srpna 2021

Naposledy ověřeno

1. srpna 2021

Více informací

Termíny související s touto studií

Další identifikační čísla studie

  • HS-3200sIRB

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Předplatit