- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT04261582
Genetik und Genomik von Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) (AERD)
30. August 2021 aktualisiert von: National Jewish Health
Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) ist eine relativ homogene Erkrankung, die durch schweres Asthma im Erwachsenenalter, die Entwicklung nicht krebsartiger Wucherungen im Nasenkanal (d. h.
Nasenpolypen) und Aspirinallergie.
Die Ursache von AERD ist unbekannt, resultiert aber wahrscheinlich aus Umwelteinflüssen in Kombination mit genetischer Anfälligkeit.
Die Homogenität der AERD-Krankheit erhöht die Möglichkeit, eng definierte genetische Mitwirkende zu entdecken, und macht sie zu einer idealen Population, um die genetischen und epigenetischen Veränderungen zu untersuchen, die Asthma verursachen.
Forscher entdeckten kürzlich, dass die Genexpression von epithelialen Wachstums- und Reparaturgenen (EGR) in bronchialen Atemwegsepithelzellen von schweren Asthmatikern im Vergleich zu weniger schweren Asthmatikern und gesunden Kontrollpersonen wesentlich verringert ist.
Dieser neue Befund weist darauf hin, dass die epitheliale Integrität und damit verbundene Prozesse von primärer Bedeutung für die Entwicklung von schwerem Asthma und möglicherweise des Subtyps von schwerem Asthma, AERD, sein könnten.
Dieser Befund wurde später in einem nachfolgenden Labormodell gestützt, das zeigte, dass die Blockierung eines zentralen epithelialen Reparatur- und Differenzierungsgens, des humanen epidermalen Wachstumsfaktorrezeptors 2 (ERBB2), die Heilungszeit von Bronchialepithelzellen nach einer Verletzung verkürzte.
Ziel der vorgeschlagenen Studie ist es daher festzustellen, ob das EGR-Gen auch bei AERD, einem homogenen Subtyp von schwerem Asthma, herunterreguliert wird.
Als Erweiterung werden die Forscher auch bestimmen, ob genetische Mutationen und/oder epigenetische Veränderungen mit dieser Herunterregulierung von EGR-Genen zusammenhängen und diese möglicherweise erklären.
Insbesondere planen die Forscher, die Genexpression von frisch gebürsteten Epithelzellen der nasalen Atemwege von 140 AERD-Patienten, 70 nicht-Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und 35 gesunden Kontrollpersonen zu erhalten, wobei sie feststellten, dass kürzlich gezeigt wurde, dass die nasale epitheliale Genexpression Veränderungen des Lungenepithels widerspiegelt asthmatische Atemwege.
Das Abtupfen des Nasenkanals auf Epithelzellen ermöglicht die nicht-invasive Bewertung der Genexpression der Epithelzellen der Atemwege.
Unser experimentelles Design vergleicht AERD-Genexpressionsprofile mit gesunden Kontrollen und bestimmt, ob EGR-Gene bei AERD im Vergleich zu Gesundheitskontrollen deprimiert sind.
Als logische Folge versuchen die Forscher, ein AERD-spezifisches Genexpressionsprofil zu entdecken, das eines Tages bei der Diagnose helfen und das aktuelle Wissen über Krankheitsmechanismen erweitern könnte.
Als Erweiterung werden die Forscher Änderungen der Genexpression, insbesondere jeden Fund herunterregulierter EGR-Gene, mit Methylierungsänderungen (d. h.
epigenetische Veränderungen) und genetische Mutationen.
Studienübersicht
Status
Suspendiert
Studientyp
Beobachtungs
Einschreibung (Voraussichtlich)
245
Kontakte und Standorte
Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.
Studienorte
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Colorado
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Denver, Colorado, Vereinigte Staaten, 80206
- National Jewish Health
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Teilnahmekriterien
Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
18 Jahre bis 75 Jahre (Erwachsene, Älterer Erwachsener)
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Nein
Studienberechtigte Geschlechter
Alle
Probenahmeverfahren
Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe
Studienpopulation
AERD-Teilnehmer, ein Subtyp von schwerem Asthma, der durch eine Entzündung der Nasenhöhle, die Entwicklung von gutartigen Wucherungen und eine Allergie gegen Aspirin gekennzeichnet ist; 35 gesunde Kontrollteilnehmer.
Die Populationen werden aus Klinikbesuchen oder klinischen Forschungsanfragen rekrutiert, alles Freiwillige.
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Ärztliche Diagnose von Asthma
- Ärztliche Diagnose einer chronischen Nasenerkrankung mit Nasenpolypen
- Empfindlichkeit gegenüber Aspirin, bestätigt durch eine provokative Herausforderung mit Aspirin in der Klinik
- Gesunder Kontrollteilnehmer
Ausschlusskriterien:
- Aktives Rauchen
- Schwangerschaft
- Vorgeschichte von mehr als oder gleich 10 Packungsjahren des Rauchens
- Alle signifikanten komorbiden Zustände, die die Studienergebnisse versehentlich beeinträchtigen könnten
- Bedingungen, die orale Kortikosteroide erfordern
- Andere bedeutende Lungenerkrankungen
- Andere Erkrankungen verbieten nach Ansicht des Prüfarztes die Teilnahme an der Studie
Studienplan
Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Fallkontrolle
- Zeitperspektiven: Interessent
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
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AERD-Teilnehmer
Teilnehmer mit Aspirin verschlimmerten Atemwegserkrankungen.
Erwachsene mit Aspirin-Allergie, Nasenpolypen und schwerem Asthma im Erwachsenenalter.
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Gesunde Kontrollen
Gesunde Teilnehmer, die kein Asthma haben.
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Nicht-Aspirin-empfindliche Asthma-Teilnehmer
Teilnehmer mit Asthma, die jedoch nicht empfindlich auf Aspirin reagieren.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Bewertung der EGR-bezogenen Genexpression bei AERD
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Die Forscher werden die globale Genexpression von frisch gebürsteten Epithelzellen der nasalen Atemwege von AERD-Patienten, nicht Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und gesunden Patienten erhalten, indem sie Nasenabstrichproben verwenden und RNAseq auf den gesammelten Zellen laufen lassen.
Die Forscher werden AERD-Genprofile mit nicht-Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und gesunden Patienten vergleichen und bestimmen, ob bei AERD eine Herunterregulierung von EGR-Genen gefunden wird.
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Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Beziehung der EGR-Genexpression zur epigenetischen Genmethylierung
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Um zu bestimmen, ob das Methylierungsprofil des gesamten Genoms in Verbindung mit herunterregulierten EGR-Genen verändert wird.
Die Forscher werden komplementäre Methylierungsprofile des gesamten Genoms der Studienteilnehmer erhalten und durch eine zusammengesetzte Analyse, die Expressions- und epigenetische Daten integriert, bewerten, ob herunterregulierte EGR-Gene bei AERD-Patienten mit Methylierungsunterschieden assoziiert sind.
Das Softwareprogramm MethylMix R wird verwendet, um Methylierungsänderungen im Zusammenhang mit Änderungen der Genexpression zu identifizieren.
MethylMix integriert DNA-Methylierung aus normalen und Krankheitsproben mit übereinstimmender Genexpression.
Zusammenfassend definiert MethylMix hyper- und hypomethylierte Gene durch den Vergleich der Methylierungswerte von krankem Gewebe mit normalem.
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Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Einfluss der genetischen Variation auf die EGR-bezogene Genexpression
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Um zu bestimmen, ob genetische Mutationen mit einer herunterregulierten EGR-Genexpression bei AERD-Patienten assoziiert sind.
Wir werden Genotypen von denselben Studienteilnehmern erhalten und durch eine zusammengesetzte Analyse, die Expression und Genotypen integriert, auswerten, ob herunterregulierte EGR-Gene mit Mutationen assoziiert sind.
Der Affymetrix-Genotypisierungs-Workflow besteht aus 4 Schritten; Die ersten 3 Schritte verwenden eine Reihe von eigenständigen Softwarepaketen und der 4. Schritt verwendet das R-Paket SNPolisher.
Die Proben-QC wird anhand der Dish-QC-Statistik ausgewertet, wobei Proben mit einer standardmäßigen Dish-QC > 82 % beibehalten werden.
Genotypisierte Proben mit einer Aufrufrate unter dem Standardwert von 97 % werden ausgeschlossen.
Platewise QC wird durch manuelle Berechnung der Statistiken „Plate Pass Rate“ und „Average Plate Call Rate“ mit Standard-Cutoff-Werten von 95 und 99 % ausgewertet.
Der Genotypisierungsschritt wird für Proben wiederholt, die die Qualitätskriterien erfüllen.
SNPolisher bewertet die Qualität des Signals und klassifiziert jede SNP-Sonde.
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Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Mitarbeiter und Ermittler
Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.
Sponsor
Mitarbeiter
Studienaufzeichnungsdaten
Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
6. November 2018
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
1. April 2022
Studienabschluss (Voraussichtlich)
1. April 2022
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
5. Dezember 2019
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
5. Februar 2020
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
10. Februar 2020
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
1. September 2021
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
30. August 2021
Zuletzt verifiziert
1. August 2021
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- HS-3200sIRB
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Nein
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Nein
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