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Genetik und Genomik von Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) (AERD)

30. August 2021 aktualisiert von: National Jewish Health
Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) ist eine relativ homogene Erkrankung, die durch schweres Asthma im Erwachsenenalter, die Entwicklung nicht krebsartiger Wucherungen im Nasenkanal (d. h. Nasenpolypen) und Aspirinallergie. Die Ursache von AERD ist unbekannt, resultiert aber wahrscheinlich aus Umwelteinflüssen in Kombination mit genetischer Anfälligkeit. Die Homogenität der AERD-Krankheit erhöht die Möglichkeit, eng definierte genetische Mitwirkende zu entdecken, und macht sie zu einer idealen Population, um die genetischen und epigenetischen Veränderungen zu untersuchen, die Asthma verursachen. Forscher entdeckten kürzlich, dass die Genexpression von epithelialen Wachstums- und Reparaturgenen (EGR) in bronchialen Atemwegsepithelzellen von schweren Asthmatikern im Vergleich zu weniger schweren Asthmatikern und gesunden Kontrollpersonen wesentlich verringert ist. Dieser neue Befund weist darauf hin, dass die epitheliale Integrität und damit verbundene Prozesse von primärer Bedeutung für die Entwicklung von schwerem Asthma und möglicherweise des Subtyps von schwerem Asthma, AERD, sein könnten. Dieser Befund wurde später in einem nachfolgenden Labormodell gestützt, das zeigte, dass die Blockierung eines zentralen epithelialen Reparatur- und Differenzierungsgens, des humanen epidermalen Wachstumsfaktorrezeptors 2 (ERBB2), die Heilungszeit von Bronchialepithelzellen nach einer Verletzung verkürzte. Ziel der vorgeschlagenen Studie ist es daher festzustellen, ob das EGR-Gen auch bei AERD, einem homogenen Subtyp von schwerem Asthma, herunterreguliert wird. Als Erweiterung werden die Forscher auch bestimmen, ob genetische Mutationen und/oder epigenetische Veränderungen mit dieser Herunterregulierung von EGR-Genen zusammenhängen und diese möglicherweise erklären. Insbesondere planen die Forscher, die Genexpression von frisch gebürsteten Epithelzellen der nasalen Atemwege von 140 AERD-Patienten, 70 nicht-Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und 35 gesunden Kontrollpersonen zu erhalten, wobei sie feststellten, dass kürzlich gezeigt wurde, dass die nasale epitheliale Genexpression Veränderungen des Lungenepithels widerspiegelt asthmatische Atemwege. Das Abtupfen des Nasenkanals auf Epithelzellen ermöglicht die nicht-invasive Bewertung der Genexpression der Epithelzellen der Atemwege. Unser experimentelles Design vergleicht AERD-Genexpressionsprofile mit gesunden Kontrollen und bestimmt, ob EGR-Gene bei AERD im Vergleich zu Gesundheitskontrollen deprimiert sind. Als logische Folge versuchen die Forscher, ein AERD-spezifisches Genexpressionsprofil zu entdecken, das eines Tages bei der Diagnose helfen und das aktuelle Wissen über Krankheitsmechanismen erweitern könnte. Als Erweiterung werden die Forscher Änderungen der Genexpression, insbesondere jeden Fund herunterregulierter EGR-Gene, mit Methylierungsänderungen (d. h. epigenetische Veränderungen) und genetische Mutationen.

Studienübersicht

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Voraussichtlich)

245

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

    • Colorado
      • Denver, Colorado, Vereinigte Staaten, 80206
        • National Jewish Health

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre bis 75 Jahre (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

AERD-Teilnehmer, ein Subtyp von schwerem Asthma, der durch eine Entzündung der Nasenhöhle, die Entwicklung von gutartigen Wucherungen und eine Allergie gegen Aspirin gekennzeichnet ist; 35 gesunde Kontrollteilnehmer. Die Populationen werden aus Klinikbesuchen oder klinischen Forschungsanfragen rekrutiert, alles Freiwillige.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Ärztliche Diagnose von Asthma
  • Ärztliche Diagnose einer chronischen Nasenerkrankung mit Nasenpolypen
  • Empfindlichkeit gegenüber Aspirin, bestätigt durch eine provokative Herausforderung mit Aspirin in der Klinik
  • Gesunder Kontrollteilnehmer

Ausschlusskriterien:

  • Aktives Rauchen
  • Schwangerschaft
  • Vorgeschichte von mehr als oder gleich 10 Packungsjahren des Rauchens
  • Alle signifikanten komorbiden Zustände, die die Studienergebnisse versehentlich beeinträchtigen könnten
  • Bedingungen, die orale Kortikosteroide erfordern
  • Andere bedeutende Lungenerkrankungen
  • Andere Erkrankungen verbieten nach Ansicht des Prüfarztes die Teilnahme an der Studie

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Fallkontrolle
  • Zeitperspektiven: Interessent

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
AERD-Teilnehmer
Teilnehmer mit Aspirin verschlimmerten Atemwegserkrankungen. Erwachsene mit Aspirin-Allergie, Nasenpolypen und schwerem Asthma im Erwachsenenalter.
Gesunde Kontrollen
Gesunde Teilnehmer, die kein Asthma haben.
Nicht-Aspirin-empfindliche Asthma-Teilnehmer
Teilnehmer mit Asthma, die jedoch nicht empfindlich auf Aspirin reagieren.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Bewertung der EGR-bezogenen Genexpression bei AERD
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
Die Forscher werden die globale Genexpression von frisch gebürsteten Epithelzellen der nasalen Atemwege von AERD-Patienten, nicht Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und gesunden Patienten erhalten, indem sie Nasenabstrichproben verwenden und RNAseq auf den gesammelten Zellen laufen lassen. Die Forscher werden AERD-Genprofile mit nicht-Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und gesunden Patienten vergleichen und bestimmen, ob bei AERD eine Herunterregulierung von EGR-Genen gefunden wird.
Bis Studienabschluss 3 Jahre

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Beziehung der EGR-Genexpression zur epigenetischen Genmethylierung
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
Um zu bestimmen, ob das Methylierungsprofil des gesamten Genoms in Verbindung mit herunterregulierten EGR-Genen verändert wird. Die Forscher werden komplementäre Methylierungsprofile des gesamten Genoms der Studienteilnehmer erhalten und durch eine zusammengesetzte Analyse, die Expressions- und epigenetische Daten integriert, bewerten, ob herunterregulierte EGR-Gene bei AERD-Patienten mit Methylierungsunterschieden assoziiert sind. Das Softwareprogramm MethylMix R wird verwendet, um Methylierungsänderungen im Zusammenhang mit Änderungen der Genexpression zu identifizieren. MethylMix integriert DNA-Methylierung aus normalen und Krankheitsproben mit übereinstimmender Genexpression. Zusammenfassend definiert MethylMix hyper- und hypomethylierte Gene durch den Vergleich der Methylierungswerte von krankem Gewebe mit normalem.
Bis Studienabschluss 3 Jahre
Einfluss der genetischen Variation auf die EGR-bezogene Genexpression
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
Um zu bestimmen, ob genetische Mutationen mit einer herunterregulierten EGR-Genexpression bei AERD-Patienten assoziiert sind. Wir werden Genotypen von denselben Studienteilnehmern erhalten und durch eine zusammengesetzte Analyse, die Expression und Genotypen integriert, auswerten, ob herunterregulierte EGR-Gene mit Mutationen assoziiert sind. Der Affymetrix-Genotypisierungs-Workflow besteht aus 4 Schritten; Die ersten 3 Schritte verwenden eine Reihe von eigenständigen Softwarepaketen und der 4. Schritt verwendet das R-Paket SNPolisher. Die Proben-QC wird anhand der Dish-QC-Statistik ausgewertet, wobei Proben mit einer standardmäßigen Dish-QC > 82 % beibehalten werden. Genotypisierte Proben mit einer Aufrufrate unter dem Standardwert von 97 % werden ausgeschlossen. Platewise QC wird durch manuelle Berechnung der Statistiken „Plate Pass Rate“ und „Average Plate Call Rate“ mit Standard-Cutoff-Werten von 95 und 99 % ausgewertet. Der Genotypisierungsschritt wird für Proben wiederholt, die die Qualitätskriterien erfüllen. SNPolisher bewertet die Qualität des Signals und klassifiziert jede SNP-Sonde.
Bis Studienabschluss 3 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

6. November 2018

Primärer Abschluss (Voraussichtlich)

1. April 2022

Studienabschluss (Voraussichtlich)

1. April 2022

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

5. Dezember 2019

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

5. Februar 2020

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

10. Februar 2020

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

1. September 2021

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

30. August 2021

Zuletzt verifiziert

1. August 2021

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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