Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Genetica en genomica van door aspirine verergerde luchtwegaandoeningen (AERD) (AERD)

30 augustus 2021 bijgewerkt door: National Jewish Health
Aspirine Exacerbated Respiratory Disease (AERD) is een relatief homogene ziekte die wordt gekenmerkt door ernstige astma die op volwassen leeftijd begint, ontwikkeling van goedaardige gezwellen in het neuskanaal (d.w.z. neuspoliepen) en aspirine-allergie. De oorzaak van AERD is onbekend, hoewel het waarschijnlijk het gevolg is van milieubeledigingen in combinatie met genetische gevoeligheid. Homogeniteit van AERD-ziekte vergroot de mogelijkheid om eng gedefinieerde genetische bijdragers te ontdekken, en maakt het een ideale populatie om de genetische en epigenetische veranderingen die astma veroorzaken te bestuderen. Onderzoekers hebben onlangs ontdekt dat de genexpressie van epitheliale groei- en herstelgenen (EGR) aanzienlijk is verminderd in bronchiale luchtwegepitheelcellen van ernstige astmapatiënten in vergelijking met minder ernstige astmapatiënten en gezonde controles. Deze nieuwe bevinding geeft aan dat epitheliale integriteit en gerelateerde processen van primair belang kunnen zijn voor de ontwikkeling van ernstig astma, en mogelijk het ernstige astma-subtype, AERD. Deze bevinding werd later ondersteund in een volgend laboratoriummodel, waaruit bleek dat het blokkeren van een centraal epitheelherstel- en differentiatiegen, menselijke epidermale groeifactorreceptor 2 (ERBB2), de genezingstijd van bronchiale epitheelcellen na letsel verkortte. Het doel van de voorgestelde studie is dus om te bepalen of het EGR-gen ook neerwaarts gereguleerd is in AERD, een homogeen ernstig astma-subtype. In het verlengde daarvan zullen de onderzoekers ook bepalen of genetische mutaties en/of epigenetische veranderingen verband houden met en mogelijk een verklaring zijn voor deze neerwaartse regulatie van EGR-genen. Concreet zijn de onderzoekers van plan genexpressie te verkrijgen van vers geborstelde epitheelcellen van de neusluchtweg van 140 AERD-patiënten, 70 niet-aspirinegevoelige astmapatiënten en 35 gezonde controles. astmatische luchtwegen. Door het neuskanaal schoon te vegen op epitheelcellen, kan genexpressie van epitheelcellen in de luchtwegen op niet-invasieve wijze worden geëvalueerd. Ons experimentele ontwerp contrasteert AERD-genexpressieprofielen met gezonde controles en bepaalt of EGR-genen depressief zijn in AERD ten opzichte van gezondheidscontroles. Als gevolg hiervan zoeken de onderzoekers naar een AERD-specifiek genexpressieprofiel dat op een dag kan helpen bij de diagnose en de huidige kennis van ziektemechanismen kan uitbreiden. Als uitbreiding zullen de onderzoekers genexpressieveranderingen, met name elke vondst van neerwaarts gereguleerde EGR-genen, correleren met methyleringsveranderingen (d.w.z. epigenetische veranderingen) en genetische mutaties.

Studie Overzicht

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Verwacht)

245

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

    • Colorado
      • Denver, Colorado, Verenigde Staten, 80206
        • National Jewish Health

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar tot 75 jaar (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

AERD-deelnemers, een subtype van ernstig astma dat wordt gekenmerkt door ontsteking van de neusholte, ontwikkeling van goedaardige gezwellen en een allergie voor aspirine; 35 gezonde controledeelnemers. Populaties zullen worden gerekruteerd uit kliniekbezoeken of vragen over klinisch onderzoek, allemaal vrijwilligers.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Arts diagnose van astma
  • Arts-diagnose van chronische neusziekte met neuspoliepen
  • Gevoeligheid voor aspirine geverifieerd door een aspirine provocerende uitdaging in de kliniek
  • Gezonde controle deelnemer

Uitsluitingscriteria:

  • Actief roken
  • Zwangerschap
  • Geschiedenis van meer dan of gelijk aan 10 pakjaren roken
  • Elke significante comorbide aandoening die onbedoeld de studieresultaten zou kunnen verstoren
  • Aandoeningen die uitbarstingen van orale corticosteroïden vereisen
  • Andere significante longziekten
  • Een andere ziekte verbiedt volgens de onderzoeker deelname aan het onderzoek

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Observatiemodellen: Case-control
  • Tijdsperspectieven: Prospectief

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
AERD-deelnemers
Deelnemers met aspirine verergerden luchtwegaandoeningen. Volwassenen met aspirine-allergie, neuspoliepen en ernstige astma bij volwassenen.
Gezonde controles
Gezonde deelnemers die geen astma hebben.
Niet-aspirinegevoelige astmadeelnemers
Deelnemers met astma, maar die niet overgevoelig zijn voor aspirine.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Evaluatie van EGR-gerelateerde genexpressie in AERD
Tijdsspanne: Door afronding van de studie, 3 jaar
Onderzoekers zullen globale genexpressie verkrijgen van vers geborstelde epitheelcellen van de neusluchtweg van AERD-patiënten, niet-aspirinegevoelige astmapatiënten en gezonde patiënten met behulp van neusuitstrijkjes en het uitvoeren van RNAseq op de verzamelde cellen. Onderzoekers zullen AERD-genprofielen afzetten tegen niet-aspirinegevoelige astmapatiënten en gezonde patiënten en bepalen of neerwaartse regulatie van EGR-genen wordt gevonden in AERD.
Door afronding van de studie, 3 jaar

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Relatie tussen EGR-genexpressie en epigenetische genmethylering
Tijdsspanne: Door afronding van de studie, 3 jaar
Om te bepalen of methylatieprofilering van het hele genoom is veranderd in verband met neerwaarts gereguleerde EGR-genen. Onderzoekers zullen complementaire methyleringsprofielen van het hele genoom van de studiedeelnemers verkrijgen en zullen evalueren of neerwaarts gereguleerde EGR-genen bij AERD-patiënten geassocieerd zijn met methylatieverschillen door een samengestelde analyse die expressie en epigenetische gegevens integreert. Het softwareprogramma MethylMix R zal worden gebruikt om methylatieveranderingen te identificeren die verband houden met veranderingen in genexpressie. MethylMix integreert DNA-methylering van normale en ziektemonsters met overeenkomende genexpressie. Samenvattend definieert MethylMix hyper- en hypomethylatiegenen door methylatiewaarden van ziek weefsel te vergelijken met normaal.
Door afronding van de studie, 3 jaar
Invloed van genetische variatie op EGR-gerelateerde genexpressie
Tijdsspanne: Door afronding van de studie, 3 jaar
Om te bepalen of genetische mutaties associëren met neerwaarts gereguleerde EGR-genexpressie bij AERD-patiënten. We zullen genotypen verkrijgen van dezelfde studiedeelnemers en evalueren of neerwaarts gereguleerde EGR-genen geassocieerd zijn met mutaties door een samengestelde analyse die expressie en genotypen integreert. De workflow voor genotypering van Affymetrix bestaat uit 4 stappen; de eerste 3 stappen gebruiken een set stand-alone softwarepakketten en de 4e stap gebruikt het R-pakket SNPolisher. Monster-QC wordt geëvalueerd door Dish-QC-statistiek, monsters behouden met standaard Dish-QC > 82%. Gegenotypeerde monsters met een oproeppercentage lager dan de standaardwaarde van 97% worden uitgesloten. Platewise QC wordt geëvalueerd door handmatig de 'Plate Pass Rate'- en 'Average Plate Call Rate'-statistieken te berekenen, met standaard afkapwaarden van 95 en 99%. De genotyperingsstap wordt opnieuw uitgevoerd voor monsters die voldoen aan de kwaliteitscriteria. SNPolisher zal de kwaliteit van het signaal evalueren en elke SNP-sonde classificeren.
Door afronding van de studie, 3 jaar

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

6 november 2018

Primaire voltooiing (Verwacht)

1 april 2022

Studie voltooiing (Verwacht)

1 april 2022

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

5 december 2019

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

5 februari 2020

Eerst geplaatst (Werkelijk)

10 februari 2020

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

1 september 2021

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

30 augustus 2021

Laatst geverifieerd

1 augustus 2021

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren