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Genética y genómica de la enfermedad respiratoria exacerbada por aspirina (AERD) (AERD)

30 de agosto de 2021 actualizado por: National Jewish Health
La enfermedad respiratoria exacerbada por aspirina (ERAE) es una enfermedad relativamente homogénea caracterizada por asma grave de inicio en adultos, desarrollo de crecimientos no cancerosos en el canal nasal (es decir, pólipos nasales) y alergia a la aspirina. Se desconoce la causa de AERD, aunque probablemente se deba a agresiones ambientales en combinación con susceptibilidad genética. La homogeneidad de la enfermedad AERD aumenta la posibilidad de descubrir contribuyentes genéticos estrechamente definidos y la convierte en una población ideal para estudiar los cambios genéticos y epigenéticos que causan el asma. Los investigadores descubrieron recientemente que la expresión génica de los genes de reparación y crecimiento epitelial (EGR) está sustancialmente disminuida en las células epiteliales de las vías respiratorias bronquiales de los asmáticos graves en comparación con los asmáticos menos graves y los controles sanos. Este nuevo hallazgo indica que la integridad epitelial y los procesos relacionados pueden ser de importancia primordial para el desarrollo del asma grave y, potencialmente, del subtipo de asma grave, AERD. Este hallazgo fue respaldado más tarde en un modelo de laboratorio posterior, que mostró que el bloqueo de un gen de reparación y diferenciación epitelial central, el receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano (ERBB2), disminuyó el tiempo de curación de las células epiteliales bronquiales después de una lesión. Por lo tanto, el objetivo del estudio propuesto es determinar si el gen EGR también está regulado a la baja en AERD, un subtipo homogéneo de asma grave. Como extensión, los investigadores también determinarán si las mutaciones genéticas y/o los cambios epigenéticos se relacionan con y potencialmente explican esta regulación negativa de los genes EGR. Específicamente, los investigadores planean obtener la expresión génica de células epiteliales de las vías respiratorias nasales recién cepilladas de 140 pacientes con AERD, 70 pacientes con asma no sensibles a la aspirina y 35 controles sanos, señalando que recientemente se ha demostrado que la expresión génica del epitelio nasal refleja cambios epiteliales pulmonares en vías respiratorias asmáticas. El hisopado del canal nasal en busca de células epiteliales permite evaluar la expresión génica de las células epiteliales de las vías respiratorias de forma no invasiva. Nuestro diseño experimental contrasta los perfiles de expresión génica de AERD con los controles sanos y determina si los genes EGR están deprimidos en AERD en relación con los controles de salud. Como corolario, los investigadores buscan descubrir un perfil de expresión génica específico de AERD que algún día pueda ayudar en el diagnóstico y ampliar el conocimiento actual de los mecanismos de la enfermedad. Como extensión, los investigadores correlacionarán los cambios en la expresión génica, específicamente cualquier hallazgo de genes EGR regulados a la baja, con cambios en la metilación (es decir, cambios epigenéticos) y mutaciones genéticas.

Descripción general del estudio

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Anticipado)

245

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

    • Colorado
      • Denver, Colorado, Estados Unidos, 80206
        • National Jewish Health

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

18 años a 75 años (Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

No

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

Participantes de AERD, un subtipo de asma grave caracterizado por inflamación de la cavidad nasal, desarrollo de crecimientos no cancerosos y alergia a la aspirina; 35 participantes de control sanos. Las poblaciones se reclutarán a partir de visitas clínicas o consultas de investigación clínica, todos voluntarios.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Diagnóstico médico del asma
  • Diagnóstico médico de enfermedad nasal crónica con pólipos nasales
  • Sensibilidad a la aspirina verificada por un desafío de provocación de aspirina en la clínica
  • Participante de control sano

Criterio de exclusión:

  • Tabaquismo activo
  • El embarazo
  • Antecedentes de tabaquismo mayor o igual a 10 paquetes-año
  • Cualquier condición comórbida significativa que podría interferir inadvertidamente con los resultados del estudio
  • Condiciones que requieren ráfagas de corticosteroides orales
  • Otras enfermedades pulmonares importantes
  • Otra enfermedad en opinión del investigador prohíbe la participación en el estudio

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Control de caso
  • Perspectivas temporales: Futuro

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Participantes de la AERD
Participantes con enfermedad respiratoria exacerbada por aspirina. Adultos con alergia a la aspirina, pólipos nasales y asma grave de inicio en adultos.
Controles saludables
Participantes sanos que no tienen asma.
Participantes con asma no sensibles a la aspirina
Participantes con asma, pero que no tienen sensibilidad a la aspirina.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Evaluación de la expresión génica relacionada con EGR en AERD
Periodo de tiempo: Hasta la finalización de los estudios, 3 años.
Los investigadores obtendrán la expresión génica global de células epiteliales de las vías respiratorias nasales recién cepilladas de pacientes con AERD, pacientes con asma no sensibles a la aspirina y pacientes sanos utilizando muestras de hisopos nasales y ejecutando RNAseq en las células recolectadas. Los investigadores contrastarán los perfiles de genes AERD con los de pacientes con asma no sensibles a la aspirina y pacientes sanos y determinarán si se encuentra una regulación negativa de los genes EGR en AERD.
Hasta la finalización de los estudios, 3 años.

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Relación de la expresión del gen EGR con la metilación del gen epigenético
Periodo de tiempo: Hasta la finalización de los estudios, 3 años.
Determinar si el perfil de metilación del genoma completo se altera en asociación con genes EGR regulados a la baja. Los investigadores obtendrán perfiles complementarios de metilación del genoma completo de los participantes del estudio y evaluarán si los genes EGR regulados a la baja en pacientes con AERD están asociados con diferencias de metilación mediante un análisis compuesto que integra datos epigenéticos y de expresión. El programa de software MethylMix R se utilizará para identificar los cambios de metilación asociados con los cambios en la expresión génica. MethylMix integra la metilación del ADN de muestras normales y de enfermedades con expresión génica coincidente. En resumen, MethylMix define los genes hiper e hipometilados comparando los valores de metilación del tejido enfermo frente al normal.
Hasta la finalización de los estudios, 3 años.
Influencia de la variación genética en la expresión génica relacionada con EGR
Periodo de tiempo: Hasta la finalización de los estudios, 3 años.
Determinar si las mutaciones genéticas se asocian con la expresión del gen EGR regulada a la baja en pacientes con AERD. Obtendremos genotipos en estos mismos participantes del estudio y evaluaremos si los genes EGR regulados a la baja están asociados con mutaciones mediante un análisis compuesto que integra la expresión y los genotipos. El flujo de trabajo de genotipado de Affymetrix consta de 4 pasos; Los primeros 3 pasos utilizan un conjunto de paquetes de software independientes y el 4.º paso utiliza el paquete R SNPolisher. El control de calidad de la muestra se evaluará mediante la estadística Dish-QC, reteniendo las muestras con Dish-QC predeterminado > 82 %. Se excluirán las muestras genotipadas con una tasa de llamadas inferior al valor predeterminado del 97 %. El control de calidad de Platewise se evaluará calculando manualmente las estadísticas 'Tasa de paso de placa' y 'Tasa promedio de llamada de placa', con valores de corte predeterminados de 95 y 99%. El paso de genotipado se volverá a ejecutar para las muestras que superen los criterios de calidad. SNPolisher evaluará la calidad de la señal y clasificará cada sonda SNP.
Hasta la finalización de los estudios, 3 años.

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

6 de noviembre de 2018

Finalización primaria (Anticipado)

1 de abril de 2022

Finalización del estudio (Anticipado)

1 de abril de 2022

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

5 de diciembre de 2019

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

5 de febrero de 2020

Publicado por primera vez (Actual)

10 de febrero de 2020

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

1 de septiembre de 2021

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

30 de agosto de 2021

Última verificación

1 de agosto de 2021

Más información

Términos relacionados con este estudio

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

Ensayos clínicos sobre Pólipos nasales

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